scifi-ATAC-seq: massive-scale single-cell chromatin accessibility sequencing using combinatorial fluidic indexing par Xuan Zhang, Alexandre P. Marand, Haidong Yan, Robert J. Schmitz

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Modeling chromatin state from sequence across angiosperms using recurrent convolutional neural networks par Travis Wrightsman, Alexandre P. Marand, Peter A. Crisp, Nathan M. Springer, Edward S. Buckler

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Cold stress induces enhanced chromatin accessibility and bivalent histone modifications H3K4me3 and H3K27me3 of active genes in potato par Zixian Zeng, Wenli Zhang, Alexandre P. Marand, Bo Zhu, C. Robin Buell, Jiming Jiang

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Leveraging histone modifications to improve genome annotations par John Pablo Mendieta, Alexandre P Marand, William A Ricci, Xuan Zhang, Robert J Schmitz

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Identification of a novel base J binding protein complex involved in RNA polymerase II transcription termination in trypanosomes. par Rudo Kieft, Yang Zhang, Alexandre P Marand, Jose Dagoberto Moran, Robert Bridger, Lance Wells, Robert J Schmitz, Robert Sabatini

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Stability of DNA methylation and chromatin accessibility in structurally diverse maize genomes par Jaclyn M Noshay, Zhikai Liang, Peng Zhou, Peter A Crisp, Alexandre P Marand, Candice N Hirsch, Robert J Schmitz, Nathan M Springer

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Meiotic crossovers are associated with open chromatin and enriched with Stowaway transposons in potato par Alexandre P. Marand, Shelley H. Jansky, Hainan Zhao, Courtney P. Leisner, Xiaobiao Zhu, Zixian Zeng, Emily Crisovan, Linsey Newton, Andy J. Hamernik, Richard E. Veilleux, C. Robin Buell, Jiming Jiang

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