Diversity of Rhizoctonia solani Isolates of Rice Varieties of Ciherang, IR 64, Mekongga, and Situ Bagendit
Padi (Oryza sativa) termasuk ke dalam komoditas penting di Indonesia. Salah satu penyakit penting pada tanaman padi ialah penyakit hawar pelepah yang disebabkan oleh Rhizoctonia solani. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui karakteristik dan kelompok anastomosis R. solani yang diisolasi dari tanam...
| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | Indonesian |
| Published: |
Perhimpunan Fitopatologi Indonesia
2021-11-01
|
| Series: | Jurnal Fitopatologi Indonesia |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://journal.ipb.ac.id/index.php/jfiti/article/view/33517 |
| _version_ | 1828072745920888832 |
|---|---|
| author | Arina Manasikana Sri Sulandari Achmadi Priyatmojo |
| author_facet | Arina Manasikana Sri Sulandari Achmadi Priyatmojo |
| author_sort | Arina Manasikana |
| collection | DOAJ |
| description |
Padi (Oryza sativa) termasuk ke dalam komoditas penting di Indonesia. Salah satu penyakit penting pada tanaman padi ialah penyakit hawar pelepah yang disebabkan oleh Rhizoctonia solani. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui karakteristik dan kelompok anastomosis R. solani yang diisolasi dari tanaman padi varietas Ciherang, IR 64, Mekongga, dan Situ Bagendit; dan mengetahui keragaman genetiknya menggunakan primer universal, dan tingkat kekerabatannya. Penelitian dilaksanakan pada Oktober 2019 hingga Juli 2020 di Laboratorium Teknologi Pengendalian UGM. Pengambilan sampel dilaksanakan di Kecamatan Pandak, Bantul yang selanjutnya dilakukan isolasi dan pemurnian cendawan Rhizoctonia menggunakan medium agar-agar dekstrosa kentang. Isolat R. solani diklasifikasikan berdasarkan keragaman kultur, keragaman morfologi, jumlah inti sel, kemampuan anastomosis (AG), dan keragaman genetik. Analisis keragaman genetik dilakukan dengan PCR menggunakan primer universal ITS1 dan ITS4. Berdasarkan pengamatan keragaman kultur dan keragaman morfologi diperoleh hasil yang bervariasi. Hasil pengamatan jumlah inti sel pada keseluruhan isolat berkisar antara 5 hingga 7 inti pada sel yang termasuk dalam kategori multinukleat. Pengamatan kelompok anastomosis (AG) pada 13 isolat yang digunakan masuk ke dalam kategori C3 (anastomosis sempurna). Analisis PCR diperoleh pita DNA dengan hasil sesuai target yaitu 600–750 pb. Hasil secara sikuensing diketahui bahwa 12 isolat R. solani menunjukkan kekerabatan yang tinggi dengan isolat AG-1 IA, kecuali pada isolat CH 3.
|
| first_indexed | 2024-04-11T01:15:50Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-025fb832182f4f6dad3228cb4c6214b2 |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 0215-7950 2339-2479 |
| language | Indonesian |
| last_indexed | 2024-04-11T01:15:50Z |
| publishDate | 2021-11-01 |
| publisher | Perhimpunan Fitopatologi Indonesia |
| record_format | Article |
| series | Jurnal Fitopatologi Indonesia |
| spelling | doaj.art-025fb832182f4f6dad3228cb4c6214b22023-01-04T02:43:01ZindPerhimpunan Fitopatologi IndonesiaJurnal Fitopatologi Indonesia0215-79502339-24792021-11-0117410.14692/jfi.17.4.141-150Diversity of Rhizoctonia solani Isolates of Rice Varieties of Ciherang, IR 64, Mekongga, and Situ BagenditArina Manasikana0Sri Sulandari1Achmadi PriyatmojoUniversitas Gadjah MadaUniversitas Gadjah Mada Padi (Oryza sativa) termasuk ke dalam komoditas penting di Indonesia. Salah satu penyakit penting pada tanaman padi ialah penyakit hawar pelepah yang disebabkan oleh Rhizoctonia solani. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui karakteristik dan kelompok anastomosis R. solani yang diisolasi dari tanaman padi varietas Ciherang, IR 64, Mekongga, dan Situ Bagendit; dan mengetahui keragaman genetiknya menggunakan primer universal, dan tingkat kekerabatannya. Penelitian dilaksanakan pada Oktober 2019 hingga Juli 2020 di Laboratorium Teknologi Pengendalian UGM. Pengambilan sampel dilaksanakan di Kecamatan Pandak, Bantul yang selanjutnya dilakukan isolasi dan pemurnian cendawan Rhizoctonia menggunakan medium agar-agar dekstrosa kentang. Isolat R. solani diklasifikasikan berdasarkan keragaman kultur, keragaman morfologi, jumlah inti sel, kemampuan anastomosis (AG), dan keragaman genetik. Analisis keragaman genetik dilakukan dengan PCR menggunakan primer universal ITS1 dan ITS4. Berdasarkan pengamatan keragaman kultur dan keragaman morfologi diperoleh hasil yang bervariasi. Hasil pengamatan jumlah inti sel pada keseluruhan isolat berkisar antara 5 hingga 7 inti pada sel yang termasuk dalam kategori multinukleat. Pengamatan kelompok anastomosis (AG) pada 13 isolat yang digunakan masuk ke dalam kategori C3 (anastomosis sempurna). Analisis PCR diperoleh pita DNA dengan hasil sesuai target yaitu 600–750 pb. Hasil secara sikuensing diketahui bahwa 12 isolat R. solani menunjukkan kekerabatan yang tinggi dengan isolat AG-1 IA, kecuali pada isolat CH 3. https://journal.ipb.ac.id/index.php/jfiti/article/view/33517anastomosis, hawar pelepah, inti sel, keragaman genetik, variabilitas |
| spellingShingle | Arina Manasikana Sri Sulandari Achmadi Priyatmojo Diversity of Rhizoctonia solani Isolates of Rice Varieties of Ciherang, IR 64, Mekongga, and Situ Bagendit Jurnal Fitopatologi Indonesia anastomosis, hawar pelepah, inti sel, keragaman genetik, variabilitas |
| title | Diversity of Rhizoctonia solani Isolates of Rice Varieties of Ciherang, IR 64, Mekongga, and Situ Bagendit |
| title_full | Diversity of Rhizoctonia solani Isolates of Rice Varieties of Ciherang, IR 64, Mekongga, and Situ Bagendit |
| title_fullStr | Diversity of Rhizoctonia solani Isolates of Rice Varieties of Ciherang, IR 64, Mekongga, and Situ Bagendit |
| title_full_unstemmed | Diversity of Rhizoctonia solani Isolates of Rice Varieties of Ciherang, IR 64, Mekongga, and Situ Bagendit |
| title_short | Diversity of Rhizoctonia solani Isolates of Rice Varieties of Ciherang, IR 64, Mekongga, and Situ Bagendit |
| title_sort | diversity of rhizoctonia solani isolates of rice varieties of ciherang ir 64 mekongga and situ bagendit |
| topic | anastomosis, hawar pelepah, inti sel, keragaman genetik, variabilitas |
| url | https://journal.ipb.ac.id/index.php/jfiti/article/view/33517 |
| work_keys_str_mv | AT arinamanasikana diversityofrhizoctoniasolaniisolatesofricevarietiesofciherangir64mekonggaandsitubagendit AT srisulandari diversityofrhizoctoniasolaniisolatesofricevarietiesofciherangir64mekonggaandsitubagendit AT achmadipriyatmojo diversityofrhizoctoniasolaniisolatesofricevarietiesofciherangir64mekonggaandsitubagendit |