Uncovering activity cliff generators using distribution of SALI values

Los acantilados de actividad se definen como compuestos con alta similitud estructural, pero también con altadiferencia en potencia. Estos compuestos tienen un impacto significativo en la optimización de líderes en químicamedicinal y en aplicaciones computacionales, como el desarrollo de modelos pre...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: José L. Medina-Franco, Karina Martinez-Mayorga
Format: Article
Language:English
Published: Universidad Nacional Autónoma de México 2018-01-01
Series:TIP Revista Especializada en Ciencias Químico-Biológicas
Online Access:http://www.redalyc.org/articulo.oa?id=43253401002
Description
Summary:Los acantilados de actividad se definen como compuestos con alta similitud estructural, pero también con altadiferencia en potencia. Estos compuestos tienen un impacto significativo en la optimización de líderes en químicamedicinal y en aplicaciones computacionales, como el desarrollo de modelos predictivos y en la selección demoléculas de referencia en búsquedas basadas en similitud molecular. Por lo tanto, es de gran relevancia laidentificación de compuestos altamente asociados con los acantilados como por ejemplo los “generadores deacantilados de actividad”. En este trabajo se reportan la identificación de acantilados de actividad y las relacionesestructura-actividad de un grupo de 289 compuestos obtenidos por síntesis química que han sido evaluados a travésde una proteína quinasa reguladora de receptores acoplados a proteínas-G. Para considerar la información demúltiples representaciones estructurales, se empleó el promedio del índice SALI (Structure-Activity Landscape Index)y se discuten también fragmentos estructurales responsables de la actividad biológica.
ISSN:1405-888X
2395-8723