Identificación de polimorfismos en el gen <i>RXAM1</i> de yuca y su asociación con la resistencia a la bacteriosis vascular
La yuca (Manihot esculenta Crantz) es un cultivo importante en regiones del trópico que proporciona alimento para cerca de 1000 millones de personas en todo el mundo. La enfermedad bacteriana más importante es la bacteriosis vascular causada por Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). Recienteme...
| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Universidad Nacional de Colombia
2020-05-01
|
| Series: | Acta Biológica Colombiana |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol/article/view/77564 |
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| author | Andrea del Pilar Barrera Johana Soto-Sedano Camilo Ernesto López Carrascal |
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| description | La yuca (Manihot esculenta Crantz) es un cultivo importante en regiones del trópico que proporciona alimento para cerca de 1000 millones de personas en todo el mundo. La enfermedad bacteriana más importante es la bacteriosis vascular causada por Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). Recientemente se logró identificar un gen de resistencia denominado RXAM1, el cual codifica para una proteína que posee un dominio LRR (Leucine-Rich Repeat) extracelular y un dominio STK (Serine Threonine Kinase) citoplasmático. RXAM1 colocaliza con un QTL que explica el 13 % de la resistencia a la cepa CIO136 de Xam. En este trabajo se evaluó la respuesta a la infección con la cepa XamCIO136 en diez diferentes variedades de yuca lo cual permitió identificar que las variedades TMS60444, SG10735, MCOL1522, MCOL1505 y MCOL2215 fueron susceptibles, mientras que CM6438-14, CM523-7 y MBRA902 se comportaron como resistentes. Así mismo se identificaron polimorfismos tipo SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) en el gen RXAM1 en el mismo grupo de variedades. Las variedades SG10735, CM6438-14, TMS6044 y MBRA685 presentaron el mayor nivel de polimorfismos, mientras que las variedades CM523-7, CM2177-2 y MCOL1522 fueron menos polimórficas para este gen. Los análisis estadísticos no permitieron identificar una asociación significativa entre el fenotipo y los polimorfismos identificados. Este estudio representa un primer esfuerzo con miras a asociar variantes alélicas con el fenotipo de respuesta a la bacteriosis vascular. |
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| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 0120-548X 1900-1649 |
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| publishDate | 2020-05-01 |
| publisher | Universidad Nacional de Colombia |
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| series | Acta Biológica Colombiana |
| spelling | doaj.art-167581ebbe2741c0a77c1ba5b9fc04fc2022-12-21T20:07:01ZengUniversidad Nacional de ColombiaActa Biológica Colombiana0120-548X1900-16492020-05-0125210.15446/abc.v25n2.77564Identificación de polimorfismos en el gen <i>RXAM1</i> de yuca y su asociación con la resistencia a la bacteriosis vascularAndrea del Pilar Barrera0Johana Soto-Sedano1Camilo Ernesto López Carrascal2Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá - Facultad de Ciencias - Departamento de BiologíaUniversidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá - Facultad de Ciencias - Departamento de BiologíaUniversidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá - Facultad de Ciencias - Departamento de BiologíaLa yuca (Manihot esculenta Crantz) es un cultivo importante en regiones del trópico que proporciona alimento para cerca de 1000 millones de personas en todo el mundo. La enfermedad bacteriana más importante es la bacteriosis vascular causada por Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). Recientemente se logró identificar un gen de resistencia denominado RXAM1, el cual codifica para una proteína que posee un dominio LRR (Leucine-Rich Repeat) extracelular y un dominio STK (Serine Threonine Kinase) citoplasmático. RXAM1 colocaliza con un QTL que explica el 13 % de la resistencia a la cepa CIO136 de Xam. En este trabajo se evaluó la respuesta a la infección con la cepa XamCIO136 en diez diferentes variedades de yuca lo cual permitió identificar que las variedades TMS60444, SG10735, MCOL1522, MCOL1505 y MCOL2215 fueron susceptibles, mientras que CM6438-14, CM523-7 y MBRA902 se comportaron como resistentes. Así mismo se identificaron polimorfismos tipo SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) en el gen RXAM1 en el mismo grupo de variedades. Las variedades SG10735, CM6438-14, TMS6044 y MBRA685 presentaron el mayor nivel de polimorfismos, mientras que las variedades CM523-7, CM2177-2 y MCOL1522 fueron menos polimórficas para este gen. Los análisis estadísticos no permitieron identificar una asociación significativa entre el fenotipo y los polimorfismos identificados. Este estudio representa un primer esfuerzo con miras a asociar variantes alélicas con el fenotipo de respuesta a la bacteriosis vascular.https://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol/article/view/77564Alelodiversidadreceptorsíntomas de plantas |
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