بررسی تنوع ژنتیکی بین و درون جمعیتهای گیاه اشنان با استفاده از آنالیز RAPD در ایران
جنس Seidlitzia (تاج‌خروسیان) دارای سه گونه علفی و یک گونه درختچه‌ای است. گیاه اشنان (Seidlitzia rosmarinus) یکی از گیاهان مقاوم جوامع شورپسند است که نقش مهمی در حفاظت خاک ایفا می‌کند. در این تحقیق، نشانگر مولکولی RAPD برای بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت گونه مذکور، 85 نمونه گیاهی از 17 جمعیت، مورد مطالعه ق...
| Main Authors: | , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Agricultural Research, Education and Extension Organization
2022-09-01
|
| Series: | رستنی‌ها |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_127316_d46227f935534164df6630d1e2800504.pdf |
| _version_ | 1811183333559762944 |
|---|---|
| author | شیما صدیقی علیرضا ایرانبخش سید محمد مهدی حمدی ایرج مهرگان |
| author_facet | شیما صدیقی علیرضا ایرانبخش سید محمد مهدی حمدی ایرج مهرگان |
| author_sort | شیما صدیقی |
| collection | DOAJ |
| description | جنس Seidlitzia (تاج‌خروسیان) دارای سه گونه علفی و یک گونه درختچه‌ای است. گیاه اشنان (Seidlitzia rosmarinus) یکی از گیاهان مقاوم جوامع شورپسند است که نقش مهمی در حفاظت خاک ایفا می‌کند. در این تحقیق، نشانگر مولکولی RAPD برای بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت گونه مذکور، 85 نمونه گیاهی از 17 جمعیت، مورد مطالعه قرار گرفت. تعداد پنج آغازگر تصادفی در انجام واکنش RAPD به کار گرفته شد و در کل 400 باند DNA به دست آمد. بیشترین تعداد باندها از دو آغازگر OPM-06 وOPS-07 به دست آمد. در تجزیه کلاستر ژنوتیپ‌ها برای تفسیر دادههای آنالیز RAPD از نرم‌افزار NTSYS Ver. 2.02 استفاده شد. ماتریس تشابه ایجاد شده در نرم‌افزار NTSYS با روش UPGMA با استفاده از مدل خوشه‌بندی SAHN به دست آمد. در تحقیق حاضر، جمعیت کاشان (PSE) با بیشترین فاصله، به عنوان گروه خواهری سایر جمعیتهای موجود در نظر گرفته شد. بعد از تشکیل ماتریس صفر و یک با کمک نرم‌افزار Gen Alex 6.41، برای تفسیر دادههای آنالیز RAPD، از نرم‌افزار آنالیز واریانس مولکولی (AMOVA) به منظور برآورد تنوع ژنتیکی استفاده شد. از مجموع کل تنوع، بیشترین میزان تنوع ژنتیکی یعنی 69% آن مربوط به تنوع درون جمعیتی، 31% تنوع بین جمعیتی محاسبه شد. با توجه به اهداف این تحقیق، می‌توان نتیجه گرفت که نشانگر مولکولی RAPD روشی سودمند برای بررسی پراکندگی ژنتیکی جمعیت اشنان بوده است. |
| first_indexed | 2024-04-11T09:46:01Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-16a016d33f37435fac8574cff780c84e |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 1608-4306 2423-6608 |
| language | English |
| last_indexed | 2024-04-11T09:46:01Z |
| publishDate | 2022-09-01 |
| publisher | Agricultural Research, Education and Extension Organization |
| record_format | Article |
| series | رستنی‌ها |
| spelling | doaj.art-16a016d33f37435fac8574cff780c84e2022-12-22T04:30:58ZengAgricultural Research, Education and Extension Organizationرستنی‌ها1608-43062423-66082022-09-0123110511310.22092/botany.2022.358985.1310127316بررسی تنوع ژنتیکی بین و درون جمعیتهای گیاه اشنان با استفاده از آنالیز RAPD در ایرانشیما صدیقی0علیرضا ایرانبخش1سید محمد مهدی حمدی2ایرج مهرگان3دانشجوی دکتری زیست‌شناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایراناستاد گروه زیست‌شناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایراندانشیار گروه زیست‌شناسی، واحد تهران مرکزی، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایراندانشیار گروه زیست‌شناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایرانجنس Seidlitzia (تاج‌خروسیان) دارای سه گونه علفی و یک گونه درختچه‌ای است. گیاه اشنان (Seidlitzia rosmarinus) یکی از گیاهان مقاوم جوامع شورپسند است که نقش مهمی در حفاظت خاک ایفا می‌کند. در این تحقیق، نشانگر مولکولی RAPD برای بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت گونه مذکور، 85 نمونه گیاهی از 17 جمعیت، مورد مطالعه قرار گرفت. تعداد پنج آغازگر تصادفی در انجام واکنش RAPD به کار گرفته شد و در کل 400 باند DNA به دست آمد. بیشترین تعداد باندها از دو آغازگر OPM-06 وOPS-07 به دست آمد. در تجزیه کلاستر ژنوتیپ‌ها برای تفسیر دادههای آنالیز RAPD از نرم‌افزار NTSYS Ver. 2.02 استفاده شد. ماتریس تشابه ایجاد شده در نرم‌افزار NTSYS با روش UPGMA با استفاده از مدل خوشه‌بندی SAHN به دست آمد. در تحقیق حاضر، جمعیت کاشان (PSE) با بیشترین فاصله، به عنوان گروه خواهری سایر جمعیتهای موجود در نظر گرفته شد. بعد از تشکیل ماتریس صفر و یک با کمک نرم‌افزار Gen Alex 6.41، برای تفسیر دادههای آنالیز RAPD، از نرم‌افزار آنالیز واریانس مولکولی (AMOVA) به منظور برآورد تنوع ژنتیکی استفاده شد. از مجموع کل تنوع، بیشترین میزان تنوع ژنتیکی یعنی 69% آن مربوط به تنوع درون جمعیتی، 31% تنوع بین جمعیتی محاسبه شد. با توجه به اهداف این تحقیق، می‌توان نتیجه گرفت که نشانگر مولکولی RAPD روشی سودمند برای بررسی پراکندگی ژنتیکی جمعیت اشنان بوده است.https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_127316_d46227f935534164df6630d1e2800504.pdfآنالیز واریانس مولکولیتاج‌خروسیانتجزیه خوشه‌ایروش upgmaseidlitzia rosmarinus |
| spellingShingle | شیما صدیقی علیرضا ایرانبخش سید محمد مهدی حمدی ایرج مهرگان بررسی تنوع ژنتیکی بین و درون جمعیتهای گیاه اشنان با استفاده از آنالیز RAPD در ایران رستنی‌ها آنالیز واریانس مولکولی تاج‌خروسیان تجزیه خوشه‌ای روش upgma seidlitzia rosmarinus |
| title | بررسی تنوع ژنتیکی بین و درون جمعیتهای گیاه اشنان با استفاده از آنالیز RAPD در ایران |
| title_full | بررسی تنوع ژنتیکی بین و درون جمعیتهای گیاه اشنان با استفاده از آنالیز RAPD در ایران |
| title_fullStr | بررسی تنوع ژنتیکی بین و درون جمعیتهای گیاه اشنان با استفاده از آنالیز RAPD در ایران |
| title_full_unstemmed | بررسی تنوع ژنتیکی بین و درون جمعیتهای گیاه اشنان با استفاده از آنالیز RAPD در ایران |
| title_short | بررسی تنوع ژنتیکی بین و درون جمعیتهای گیاه اشنان با استفاده از آنالیز RAPD در ایران |
| title_sort | بررسی تنوع ژنتیکی بین و درون جمعیتهای گیاه اشنان با استفاده از آنالیز rapd در ایران |
| topic | آنالیز واریانس مولکولی تاج‌خروسیان تجزیه خوشه‌ای روش upgma seidlitzia rosmarinus |
| url | https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_127316_d46227f935534164df6630d1e2800504.pdf |
| work_keys_str_mv | AT sẖymạṣdyqy brrsytnwʿzẖntyḵybynwdrwnjmʿythạygyạhạsẖnạnbạạstfạdhạzậnạlyzrapddrạyrạn AT ʿlyrḍạạyrạnbkẖsẖ brrsytnwʿzẖntyḵybynwdrwnjmʿythạygyạhạsẖnạnbạạstfạdhạzậnạlyzrapddrạyrạn AT sydmḥmdmhdyḥmdy brrsytnwʿzẖntyḵybynwdrwnjmʿythạygyạhạsẖnạnbạạstfạdhạzậnạlyzrapddrạyrạn AT ạyrjmhrgạn brrsytnwʿzẖntyḵybynwdrwnjmʿythạygyạhạsẖnạnbạạstfạdhạzậnạlyzrapddrạyrạn |