Incidencia de potyvirus y caracterización molecular de PVY en regiones productoras de papa (Solanum tuberosum L.) de Colombia
<p class="MsoNormal" style="text-align: center; line-height: normal; margin: 0cm 0cm 0pt; mso-layout-grid-align: none;" align="center"><strong style="mso-bidi-font-weight: normal;"><span style="font-family: " lang="EN-US">...
| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | Spanish |
| Published: |
Universidad Nacional de Colombia
2011-08-01
|
| Series: | Revista Colombiana de Biotecnología |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://www.revistas.unal.edu.co/index.php/biotecnologia/article/view/22946 |
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|---|---|
| author | José Miguel Cotes José Fernando Gil Mauricio Marín |
| author_facet | José Miguel Cotes José Fernando Gil Mauricio Marín |
| author_sort | José Miguel Cotes |
| collection | DOAJ |
| description | <p class="MsoNormal" style="text-align: center; line-height: normal; margin: 0cm 0cm 0pt; mso-layout-grid-align: none;" align="center"><strong style="mso-bidi-font-weight: normal;"><span style="font-family: " lang="EN-US">Incidence of potyvirus and molecular characterization of PVY in potato (</span></strong><em style="mso-bidi-font-style: normal;"><span style="font-family: " lang="EN-US">Solanum tuberosum</span></em><span style="font-family: " lang="EN-US"> L.) </span><strong style="mso-bidi-font-weight: normal;"><span style="font-family: " lang="EN-US">growing regions of Colombia</span></strong></p><p class="MsoNormal" style="text-align: center; line-height: normal; margin: 0cm 0cm 0pt; mso-layout-grid-align: none;" align="center"><strong style="mso-bidi-font-weight: normal;"></strong></p><p class="MsoNormal" style="line-height: normal; margin: 0cm 0cm 0pt;"><strong style="mso-bidi-font-weight: normal;"><span style="font-family: " lang="ES">Título corto:</span></strong><span style="font-family: " lang="ES"> Incidencia de potyvirus en cultivos de papa de Colombia</span></p><p class="MsoNormal" style="line-height: normal; margin: 0cm 0cm 0pt;"> </p><p class="MsoNormal" style="line-height: normal; margin: 0cm 0cm 0pt;"><strong style="mso-bidi-font-weight: normal;"><span style="font-family: " lang="IT">Resumen</span></strong></p><p class="MsoNormal" style="line-height: normal; margin: 0cm 0cm 0pt;"><strong style="mso-bidi-font-weight: normal;"></strong><span style="font-family: ">Los problemas virales reducen los rendimientos y la calidad del tubérculo semilla en cultivos de papa de todo el mundo. Esta investigación se planteó con el fin de evaluar los niveles de incidencia de potyvirus en diez de las principales regiones cultivadoras de papa de los departamentos de Antioquia, Boyacá, Cundinamarca y Nariño (Colombia), y las características genotípicas del virus Y de la papa (<em style="mso-bidi-font-style: normal;">Potato virus Y</em>, PVY), seleccionado por ser el potyvirus más limitante de este cultivo. Para la evaluación de la incidencia se utilizaron pruebas de Elisa con anticuerpos que reconocen epítopes comunes a los potyvirus, mientras que las pruebas moleculares incluyeron el análisis filogenético de secuencias parciales del gen de la cápside viral de 33 aislamientos, así como la secuenciación de una porción de los extremos 5´ y 3´del genoma de dos cepas colombianas de este virus. Los resultados confirmaron la presencia de potyvirus en los cultivos de los cuatro departamentos evaluados, con una incidencia promedio del 72%, siendo este nivel superior al 56% en todas las zonas evaluadas. Los análisis moleculares del PVY, permitieron asociar las cepas colombianas estudiadas con las razas PVY<sup>N</sup> y la variante PVY<sup>NTN</sup>, esta última responsable de la enfermedad conocida en el mundo como PTNRD (<em style="mso-bidi-font-style: normal;">Potato tuber necrotic ringspot disease</em>).</span></p><p class="MsoNormal" style="line-height: normal; margin: 0cm 0cm 0pt;"> </p><p class="MsoNormal" style="line-height: normal; margin: 0cm 0cm 0pt;"><strong style="mso-bidi-font-weight: normal;"><span style="font-family: ">Palabras clave:</span></strong><span style="font-family: "> cápside, Elisa, RT-PCR, secuenciación.</span></p><p class="MsoNormal" style="line-height: normal; margin: 0cm 0cm 0pt;"> </p><p class="MsoNormal" style="line-height: normal; margin: 0cm 0cm 0pt;"><sup><span style="font-family: " lang="ES"> </span></sup><strong style="mso-bidi-font-weight: normal;"><span style="font-family: " lang="EN-US">Abstract</span></strong></p><p class="MsoNormal" style="line-height: normal; margin: 0cm 0cm 0pt;"><strong style="mso-bidi-font-weight: normal;"></strong><span style="font-family: " lang="EN-US">Potato viruses are responsible for significant reductions in seed quality and crop yields around the world. In this study, we evaluate the levels of incidence of potyvirus in ten potato growing regions of Colombia from the provinces of Antioquia, Boyacá, Cundinamarca and Nariño. As PVY is the most limiting potyvirus in potato farming, a molecular characterization of Colombian PVY strains was also performed. Incidence was evaluated by ELISA using general potyvirus antibodies. Phylogenetic analysis were made on the partial sequence of the capsid gene from 33 isolates. A portion of the 5´ and 3' genome ends was obtained from two Colombian strains. Results confirmed the presence of potyvirus in the four provinces with an average incidence of 72%. The lowest incidence value was 56%. Molecular analysis clustered all Colombian isolates with strains PVY<sup>N</sup> and PVY<sup>NTN</sup>, the latter responsible for the disease known as PTNRD (<em style="mso-bidi-font-style: normal;">Potato tuber necrotic ringspot disease</em>).</span></p><p class="MsoNormal" style="line-height: normal; margin: 0cm 0cm 0pt;"> </p><p class="MsoNormal" style="line-height: normal; margin: 0cm 0cm 0pt;"><strong style="mso-bidi-font-weight: normal;"><span style="font-family: " lang="EN-US">Key words:</span></strong><span style="font-family: " lang="EN-US"> Capsid, Elisa, RT-PCR, sequencing.</span></p> |
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| issn | 0123-3475 1909-8758 |
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| publishDate | 2011-08-01 |
| publisher | Universidad Nacional de Colombia |
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| series | Revista Colombiana de Biotecnología |
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Esta investigación se planteó con el fin de evaluar los niveles de incidencia de potyvirus en diez de las principales regiones cultivadoras de papa de los departamentos de Antioquia, Boyacá, Cundinamarca y Nariño (Colombia), y las características genotípicas del virus Y de la papa (<em style="mso-bidi-font-style: normal;">Potato virus Y</em>, PVY), seleccionado por ser el potyvirus más limitante de este cultivo. Para la evaluación de la incidencia se utilizaron pruebas de Elisa con anticuerpos que reconocen epítopes comunes a los potyvirus, mientras que las pruebas moleculares incluyeron el análisis filogenético de secuencias parciales del gen de la cápside viral de 33 aislamientos, así como la secuenciación de una porción de los extremos 5´ y 3´del genoma de dos cepas colombianas de este virus. 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In this study, we evaluate the levels of incidence of potyvirus in ten potato growing regions of Colombia from the provinces of Antioquia, Boyacá, Cundinamarca and Nariño. As PVY is the most limiting potyvirus in potato farming, a molecular characterization of Colombian PVY strains was also performed. Incidence was evaluated by ELISA using general potyvirus antibodies. Phylogenetic analysis were made on the partial sequence of the capsid gene from 33 isolates. A portion of the 5´ and 3' genome ends was obtained from two Colombian strains. Results confirmed the presence of potyvirus in the four provinces with an average incidence of 72%. The lowest incidence value was 56%. Molecular analysis clustered all Colombian isolates with strains PVY<sup>N</sup> and PVY<sup>NTN</sup>, the latter responsible for the disease known as PTNRD (<em style="mso-bidi-font-style: normal;">Potato tuber necrotic ringspot disease</em>).</span></p><p class="MsoNormal" style="line-height: normal; margin: 0cm 0cm 0pt;"> </p><p class="MsoNormal" style="line-height: normal; margin: 0cm 0cm 0pt;"><strong style="mso-bidi-font-weight: normal;"><span style="font-family: " lang="EN-US">Key words:</span></strong><span style="font-family: " lang="EN-US"> Capsid, Elisa, RT-PCR, sequencing.</span></p>http://www.revistas.unal.edu.co/index.php/biotecnologia/article/view/22946CapsidElisaRT-PCRsequencingcápsideElisaRT-PCRsecuenciación |
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