СООТНОШЕНИЕ ГЕНОТИП-ФЕНОТИП, ОПРЕДЕЛЯЕМОЕ ГЕОМЕТРИЧЕСКОЙ МОРФОМЕТРИЕЙ
Фенотипическая изменчивость и генотипическая изменчивость проявляются в форме, величине и асимметричности листовых пластин. Для описания реакции растений на географическое местоположение было проведено линейное моделирование формы и асимметрии листовых пластин двух видов деревьев: светолюбивого (Чер...
| Main Author: | |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Cifra Publishing House
2023-05-01
|
| Series: | Journal of Bioinformatics and Genomics |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://journal-biogen.org/index.php/jbg/article/view/62 |
| _version_ | 1827938922428104704 |
|---|---|
| author | Баранов, С.Г. |
| author_facet | Баранов, С.Г. |
| author_sort | Баранов, С.Г. |
| collection | DOAJ |
| description | Фенотипическая изменчивость и генотипическая изменчивость проявляются в форме, величине и асимметричности листовых пластин. Для описания реакции растений на географическое местоположение было проведено линейное моделирование формы и асимметрии листовых пластин двух видов деревьев: светолюбивого (Черемуха обыкновенная, Prunus padus) и теневыносливого (Липа мелколистная, Tilia cordata Mull). Были выбраны 8 ценопопуляций, располагавшихся с севера на юг (от г. Мурманск до Московской области). У липы измерялось расстояние между основаниями жилок, а у черемухи – ширина листа. Линейные признаки R (правый) L (левый) не показали корреляционной связи (Spearman’s r >0.05) с индексом флуктуирующей асимметрии |R – L|/(R + L). По контуру листа выставлялось 100 меток и проводился морфогеометрический 2-х факторный дисперсионный анализ (MorphoJ). Индекс флуктуирующей асимметрии ФА18 рассчитывался с учетом ошибки троекратного нанесения меток, а р-уровень с учетом поправки α = 0.05 на весь ряд значений ФА для семи популяций. Направленная асимметрия определялась по критерию F фактора «сторона». Находился коэффициент корреляции r между диагональными значениями матриц фенотипа и генотипа. Полученные значения флуктуирующей асимметрии, направленной асимметрии и корреляции фенотип/генотип размножались до n =50 с учётом нормального распределения, и выполнялась линейная аппроксимация (R2= 0.97-0.99). Линии трендов располагались по нисходящему значению. Оценка регрессионных коэффициентов проводилась по F-критерию различия дисперсии остатков. Листовые пластины липы мелколистной показали более высокую флуктуационную асимметричность, листья черемухи – большую направленную асимметрию. Коэффициент фенотип/генотип также различался у двух видов (p <0.05). Северные популяции липы (гг. Петрозаводск и Апатиты) показали больший индекс по сравнению с южными популяциями из Московской области (Можайск), соответственно, FA18 = 0.0002; p = 0.01 и FA18 = 0.0001; p = 0.02. Высокая доля изменчивости направленной асимметрии как генотипического проявления проявился у черемухи, как местного вида. Липа мелколистная как вид-интродуцент проявлял фенотипическую изменчивость с высокой долей флуктуирующей асимметрии. Полученные данные свидетельствовали о различной реакции генотипа и фенотипа двух видов в зависимости от географического расположения ценопопуляций. |
| first_indexed | 2024-03-13T08:44:51Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-236dc000d228496f8950ecfea4f92533 |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 2530-1381 |
| language | English |
| last_indexed | 2024-03-13T08:44:51Z |
| publishDate | 2023-05-01 |
| publisher | Cifra Publishing House |
| record_format | Article |
| series | Journal of Bioinformatics and Genomics |
| spelling | doaj.art-236dc000d228496f8950ecfea4f925332023-05-30T06:05:28ZengCifra Publishing HouseJournal of Bioinformatics and Genomics2530-13812023-05-0120232 (20)3310.18454/jbg.2023.20.2.00310.18454/jbg.2023.20.2.003СООТНОШЕНИЕ ГЕНОТИП-ФЕНОТИП, ОПРЕДЕЛЯЕМОЕ ГЕОМЕТРИЧЕСКОЙ МОРФОМЕТРИЕЙБаранов, С.Г.0Владимирский государственный университетФенотипическая изменчивость и генотипическая изменчивость проявляются в форме, величине и асимметричности листовых пластин. Для описания реакции растений на географическое местоположение было проведено линейное моделирование формы и асимметрии листовых пластин двух видов деревьев: светолюбивого (Черемуха обыкновенная, Prunus padus) и теневыносливого (Липа мелколистная, Tilia cordata Mull). Были выбраны 8 ценопопуляций, располагавшихся с севера на юг (от г. Мурманск до Московской области). У липы измерялось расстояние между основаниями жилок, а у черемухи – ширина листа. Линейные признаки R (правый) L (левый) не показали корреляционной связи (Spearman’s r >0.05) с индексом флуктуирующей асимметрии |R – L|/(R + L). По контуру листа выставлялось 100 меток и проводился морфогеометрический 2-х факторный дисперсионный анализ (MorphoJ). Индекс флуктуирующей асимметрии ФА18 рассчитывался с учетом ошибки троекратного нанесения меток, а р-уровень с учетом поправки α = 0.05 на весь ряд значений ФА для семи популяций. Направленная асимметрия определялась по критерию F фактора «сторона». Находился коэффициент корреляции r между диагональными значениями матриц фенотипа и генотипа. Полученные значения флуктуирующей асимметрии, направленной асимметрии и корреляции фенотип/генотип размножались до n =50 с учётом нормального распределения, и выполнялась линейная аппроксимация (R2= 0.97-0.99). Линии трендов располагались по нисходящему значению. Оценка регрессионных коэффициентов проводилась по F-критерию различия дисперсии остатков. Листовые пластины липы мелколистной показали более высокую флуктуационную асимметричность, листья черемухи – большую направленную асимметрию. Коэффициент фенотип/генотип также различался у двух видов (p <0.05). Северные популяции липы (гг. Петрозаводск и Апатиты) показали больший индекс по сравнению с южными популяциями из Московской области (Можайск), соответственно, FA18 = 0.0002; p = 0.01 и FA18 = 0.0001; p = 0.02. Высокая доля изменчивости направленной асимметрии как генотипического проявления проявился у черемухи, как местного вида. Липа мелколистная как вид-интродуцент проявлял фенотипическую изменчивость с высокой долей флуктуирующей асимметрии. Полученные данные свидетельствовали о различной реакции генотипа и фенотипа двух видов в зависимости от географического расположения ценопопуляций.https://journal-biogen.org/index.php/jbg/article/view/62asymmetrymatrixphenotype-genotype modelасимметрияматрицамодель фенотип-генотипasymmetrymatrixphenotype-genotype model |
| spellingShingle | Баранов, С.Г. СООТНОШЕНИЕ ГЕНОТИП-ФЕНОТИП, ОПРЕДЕЛЯЕМОЕ ГЕОМЕТРИЧЕСКОЙ МОРФОМЕТРИЕЙ Journal of Bioinformatics and Genomics asymmetry matrix phenotype-genotype model асимметрия матрица модель фенотип-генотип asymmetry matrix phenotype-genotype model |
| title | СООТНОШЕНИЕ ГЕНОТИП-ФЕНОТИП, ОПРЕДЕЛЯЕМОЕ ГЕОМЕТРИЧЕСКОЙ МОРФОМЕТРИЕЙ |
| title_full | СООТНОШЕНИЕ ГЕНОТИП-ФЕНОТИП, ОПРЕДЕЛЯЕМОЕ ГЕОМЕТРИЧЕСКОЙ МОРФОМЕТРИЕЙ |
| title_fullStr | СООТНОШЕНИЕ ГЕНОТИП-ФЕНОТИП, ОПРЕДЕЛЯЕМОЕ ГЕОМЕТРИЧЕСКОЙ МОРФОМЕТРИЕЙ |
| title_full_unstemmed | СООТНОШЕНИЕ ГЕНОТИП-ФЕНОТИП, ОПРЕДЕЛЯЕМОЕ ГЕОМЕТРИЧЕСКОЙ МОРФОМЕТРИЕЙ |
| title_short | СООТНОШЕНИЕ ГЕНОТИП-ФЕНОТИП, ОПРЕДЕЛЯЕМОЕ ГЕОМЕТРИЧЕСКОЙ МОРФОМЕТРИЕЙ |
| title_sort | соотношение генотип фенотип определяемое геометрической морфометрией |
| topic | asymmetry matrix phenotype-genotype model асимметрия матрица модель фенотип-генотип asymmetry matrix phenotype-genotype model |
| url | https://journal-biogen.org/index.php/jbg/article/view/62 |
| work_keys_str_mv | AT baranovsg sootnošeniegenotipfenotipopredelâemoegeometričeskojmorfometriej |