Comparison of transcriptional initiation by RNA polymerase II across eukaryotic species

Comparison of transcriptional initiation by RNA polymerase II across eukaryotic species

The preinitiation complex (PIC) for transcriptional initiation by RNA polymerase (Pol) II is composed of general transcription factors that are highly conserved. However, analysis of ChIP-seq datasets reveals kinetic and compositional differences in the transcriptional initiation process among eukar...

Повний опис

Бібліографічні деталі
Автори:	Natalia Petrenko, Kevin Struhl
Формат:	Стаття
Мова:	English
Опубліковано:	eLife Sciences Publications Ltd 2021-09-01
Серія:	eLife
Предмети:	transcriptional initiation transcription factors RNA polymerase II Mediator TFIID promoters
Онлайн доступ:	https://elifesciences.org/articles/67964

Схожі ресурси

BET family members Bdf1/2 modulate global transcription initiation and elongation in Saccharomyces cerevisiae
за авторством: Rafal Donczew, та інші
Опубліковано: (2021-06-01)

Evidence that Mediator is essential for Pol II transcription, but is not a required component of the preinitiation complex in vivo
за авторством: Natalia Petrenko, та інші
Опубліковано: (2017-07-01)

Two roles for the yeast transcription coactivator SAGA and a set of genes redundantly regulated by TFIID and SAGA
за авторством: Rafal Donczew, та інші
Опубліковано: (2020-01-01)

Mechanisms and Functions of the RNA Polymerase II General Transcription Machinery during the Transcription Cycle
за авторством: Stephen R. Archuleta, та інші
Опубліковано: (2024-02-01)

Ssl2/TFIIH function in transcription start site scanning by RNA polymerase II in Saccharomyces cerevisiae
за авторством: Tingting Zhao, та інші
Опубліковано: (2021-10-01)

Requirements for RNA polymerase II preinitiation complex formation in vivo
за авторством: Natalia Petrenko, та інші
Опубліковано: (2019-01-01)

Tyrosine phosphorylation of RNA polymerase II CTD is associated with antisense promoter transcription and active enhancers in mammalian cells
за авторством: Nicolas Descostes, та інші
Опубліковано: (2014-05-01)

Reporter-ChIP-nexus reveals strong contribution of the Drosophila initiator sequence to RNA polymerase pausing
за авторством: Wanqing Shao, та інші
Опубліковано: (2019-04-01)

Genetic dissection of the RNA polymerase II transcription cycle
за авторством: Shao-Pei Chou, та інші
Опубліковано: (2022-07-01)

GE23077 binds to the RNA polymerase ‘i’ and ‘i+1’ sites and prevents the binding of initiating nucleotides
за авторством: Yu Zhang, та інші
Опубліковано: (2014-04-01)

Regulation of RNA Polymerase II Transcription Initiation and Elongation by Transcription Factor TFII-I
за авторством: Niko Linzer, та інші
Опубліковано: (2021-05-01)

The nucleosomal barrier to promoter escape by RNA polymerase II is overcome by the chromatin remodeler Chd1
за авторством: Peter J Skene, та інші
Опубліковано: (2014-04-01)

HIV Tat controls RNA Polymerase II and the epigenetic landscape to transcriptionally reprogram target immune cells
за авторством: Jonathan E Reeder, та інші
Опубліковано: (2015-10-01)

Effect of CFIm25 knockout on RNA polymerase II transcription
за авторством: Michael Tellier, та інші
Опубліковано: (2018-12-01)

Optical tweezers studies of transcription by eukaryotic RNA polymerases
за авторством: Lisica Ana, та інші
Опубліковано: (2017-02-01)

E. coli TraR allosterically regulates transcription initiation by altering RNA polymerase conformation
за авторством: James Chen, та інші
Опубліковано: (2019-12-01)

Effect of CFIm68 knockdown on RNA polymerase II transcription
за авторством: Michael Tellier, та інші
Опубліковано: (2019-09-01)

Genome‐wide analysis of FOXO3 mediated transcription regulation through RNA polymerase II profiling
за авторством: Astrid Eijkelenboom, та інші
Опубліковано: (2013-01-01)

Evidence Supporting That RNA Polymerase II Catalyzes De Novo Transcription Using Potato Spindle Tuber Viroid Circular RNA Templates
за авторством: Shachinthaka D. Dissanayaka Mudiyanselage, та інші
Опубліковано: (2020-03-01)

PIP2-Effector Protein MPRIP Regulates RNA Polymerase II Condensation and Transcription
за авторством: Can Balaban, та інші
Опубліковано: (2023-02-01)

Architecture of TAF11/TAF13/TBP complex suggests novel regulation properties of general transcription factor TFIID
за авторством: Kapil Gupta, та інші
Опубліковано: (2017-11-01)

A New Insight into MYC Action: Control of RNA Polymerase II Methylation and Transcription Termination
за авторством: Fiorella Scagnoli, та інші
Опубліковано: (2023-01-01)

Structural mechanism of ATP-independent transcription initiation by RNA polymerase I
за авторством: Yan Han, та інші
Опубліковано: (2017-06-01)

TBP/TFIID-dependent activation of MyoD target genes in skeletal muscle cells
за авторством: Barbora Malecova, та інші
Опубліковано: (2016-02-01)

Proteins in eukaryotic transcription /
за авторством: Conaway, Ronald C., та інші
Опубліковано: (2004)

Initial Events in Bacterial Transcription Initiation
за авторством: Emily F. Ruff, та інші
Опубліковано: (2015-05-01)

REGULATORY TRANSCRIPTION FACTORS MAY PARTICIPATE IN POST-INITIATION CONTROL OF TRANSCRIPTION
за авторством: V. M. Merkulov, та інші
Опубліковано: (2015-01-01)

Novel <i>Escherichia coli</i> RNA Polymerase Binding Protein Encoded by Bacteriophage T5
за авторством: Evgeny Klimuk, та інші
Опубліковано: (2020-07-01)

Ssn6 Interacts with Polar Tube Protein 2 and Transcriptional Repressor for RNA Polymerase II: Insight into Its Involvement in the Biological Process of Microsporidium <i>Nosema bombycis</i>
за авторством: Runpeng Wang, та інші
Опубліковано: (2023-10-01)

The transcriptional elongation rate regulates alternative polyadenylation in yeast
за авторством: Joseph V Geisberg, та інші
Опубліковано: (2020-08-01)

Transcription initiation at a consensus bacterial promoter proceeds via a ‘bind-unwind-load-and-lock’ mechanism
за авторством: Abhishek Mazumder, та інші
Опубліковано: (2021-10-01)

Human promoter directionality is determined by transcriptional initiation and the opposing activities of INTS11 and CDK9
за авторством: Joshua D Eaton, та інші
Опубліковано: (2024-07-01)

Multisubunit RNA Polymerases of Jumbo Bacteriophages
за авторством: Maria L. Sokolova, та інші
Опубліковано: (2020-09-01)

RBM22 regulates RNA polymerase II 5′ pausing, elongation rate, and termination by coordinating 7SK-P-TEFb complex and SPT5
за авторством: Xian Du, та інші
Опубліковано: (2024-04-01)

Methylation of RNA polymerase II non-consensus Lysine residues marks early transcription in mammalian cells
за авторством: João D Dias, та інші
Опубліковано: (2015-12-01)

Mono-allelic epigenetic regulation of polycistronic transcription initiation by RNA polymerase II in Trypanosoma brucei
за авторством: Rudo Kieft, та інші
Опубліковано: (2025-02-01)

Complete dissection of transcription elongation reveals slow translocation of RNA polymerase II in a linear ratchet mechanism
за авторством: Manchuta Dangkulwanich, та інші
Опубліковано: (2013-09-01)

RNA Polymerase II cluster dynamics predict mRNA output in living cells
за авторством: Won-Ki Cho, та інші
Опубліковано: (2016-05-01)

Bacterial Suppression of RNA Polymerase II-Dependent Host Gene Expression
за авторством: Ines Ambite, та інші
Опубліковано: (2016-07-01)

Cross-regulome profiling of RNA polymerases highlights the regulatory role of polymerase III on mRNA transcription by maintaining local chromatin architecture
за авторством: Yongpeng Jiang, та інші
Опубліковано: (2022-11-01)