مطالعه تاکسونومیک سیانوپروکاریوت‌های بستر رویشی گیاهان دارویی با تاکید بر فیلوژنی آرایه‌های پیچیده با استفاده از مارکر 16S rRNA
سیانوپروکاریوت‌ها موجودات ریز و ساده فتوسنتز‌کننده‌ای هستند که نقش مهمی در چرخه‌های نیتروژن و کربن خاک ایفا می‌نمایند. هدف مطالعه حاضر، بررسی فلور سیانوپروکاریوت‌های موجود در بستر رویشی گیاهان دارویی است. همچنین، بررسی فیلوژنتیک به منظور ارزیابی روابط فیلوژنی میان آرایه‌های مختلف سیانوپروکاریوتی با...
| Main Authors: | , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Agricultural Research, Education and Extension Organization
2019-12-01
|
| Series: | رستنی‌ها |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://rostaniha.areo.ir/article_120238_8b2ffaa6c0638a2be185f8657dedb396.pdf |
| _version_ | 1819051163282046976 |
|---|---|
| author | سمیه زارع زاده حسین ریاحی زینب شریعتمداری معصومه سادات حسینی |
| author_facet | سمیه زارع زاده حسین ریاحی زینب شریعتمداری معصومه سادات حسینی |
| author_sort | سمیه زارع زاده |
| collection | DOAJ |
| description | سیانوپروکاریوت‌ها موجودات ریز و ساده فتوسنتز‌کننده‌ای هستند که نقش مهمی در چرخه‌های نیتروژن و کربن خاک ایفا می‌نمایند. هدف مطالعه حاضر، بررسی فلور سیانوپروکاریوت‌های موجود در بستر رویشی گیاهان دارویی است. همچنین، بررسی فیلوژنتیک به منظور ارزیابی روابط فیلوژنی میان آرایه‌های مختلف سیانوپروکاریوتی با استفاده از مارکر 16S rRNA و ارزیابی کارآمدی این مارکر در جداسازی مرزهای تاکسونومیک میان آرایه‌ها، به ویژه در موارد پیچیده که روابط میان آن‌ها به خوبی شناخته شده نیست، انجام گرفته است. به این منظور، پس از جمع‌آوری خاک، جداسازی و خالص‌سازی سویه‌ها انجام گرفت. آرایه‌های سیانوپروکاریوتی براساس خصوصیات ریخت‌شناختی شناسایی شدند و تایید شناسایی‌ها با کمک مارکر مولکولی 16S rRNA انجام گرفت. روابط فیلوژنی با استفاده از Maximum Likelihood، Maximum Parsimony و Bayesian Inference مورد ارزیابی قرار گرفت. در مجموع، 42 آرایه سیانوپروکاریوتی شناسایی شد و نتایج نشان‌دهنده غالب بودن جنس گونه <em>Nostoc</em>در فلور بستر رویشی گیاهان دارویی بود. درخت حاصل از نتایج فیلوژنی نشان‌دهنده تک‌نیایی بودن <em>Nostocales</em> است. همچنین، جنس‌های <em>Wollea</em> و <em>Anabaena</em> با یکدیگر و نیز جنس‌های<em>Nostoc</em> و <em>Desmonostoc</em> با هم، گروه‌های تک‌نیا را تشکیل دادند. نتایج نشان‌دهنده کارآمدی مارکر16S rRNA در سطوح بالای سیستم رده‌بندی، اعم از راسته، تیره و جنس می‌باشد. با این وجود، این مارکر در جداسازی آرایه‌های نزدیک به یکدیگر نظیر <em>Desmonostoc</em> و <em>Nostoc</em> از کارآمدی لازم برخوردار نیست. <br /><strong> </strong> <br /><strong> </strong> |
| first_indexed | 2024-12-21T11:59:34Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-277c2061bd7144ecbc7c3f82887ee264 |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 1608-4306 2423-6608 |
| language | English |
| last_indexed | 2024-12-21T11:59:34Z |
| publishDate | 2019-12-01 |
| publisher | Agricultural Research, Education and Extension Organization |
| record_format | Article |
| series | رستنی‌ها |
| spelling | doaj.art-277c2061bd7144ecbc7c3f82887ee2642022-12-21T19:04:51ZengAgricultural Research, Education and Extension Organizationرستنی‌ها1608-43062423-66082019-12-012029810910.22092/botany.2019.126659.1159120238مطالعه تاکسونومیک سیانوپروکاریوت‌های بستر رویشی گیاهان دارویی با تاکید بر فیلوژنی آرایه‌های پیچیده با استفاده از مارکر 16S rRNAسمیه زارع زاده0حسین ریاحی1زینب شریعتمداری2معصومه سادات حسینی3دانشجوی دکتری دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایراناستاد دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایراناستادیار دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایرانفارغ‌التحصیل کارشناسی ارشد، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایرانسیانوپروکاریوت‌ها موجودات ریز و ساده فتوسنتز‌کننده‌ای هستند که نقش مهمی در چرخه‌های نیتروژن و کربن خاک ایفا می‌نمایند. هدف مطالعه حاضر، بررسی فلور سیانوپروکاریوت‌های موجود در بستر رویشی گیاهان دارویی است. همچنین، بررسی فیلوژنتیک به منظور ارزیابی روابط فیلوژنی میان آرایه‌های مختلف سیانوپروکاریوتی با استفاده از مارکر 16S rRNA و ارزیابی کارآمدی این مارکر در جداسازی مرزهای تاکسونومیک میان آرایه‌ها، به ویژه در موارد پیچیده که روابط میان آن‌ها به خوبی شناخته شده نیست، انجام گرفته است. به این منظور، پس از جمع‌آوری خاک، جداسازی و خالص‌سازی سویه‌ها انجام گرفت. آرایه‌های سیانوپروکاریوتی براساس خصوصیات ریخت‌شناختی شناسایی شدند و تایید شناسایی‌ها با کمک مارکر مولکولی 16S rRNA انجام گرفت. روابط فیلوژنی با استفاده از Maximum Likelihood، Maximum Parsimony و Bayesian Inference مورد ارزیابی قرار گرفت. در مجموع، 42 آرایه سیانوپروکاریوتی شناسایی شد و نتایج نشان‌دهنده غالب بودن جنس گونه <em>Nostoc</em>در فلور بستر رویشی گیاهان دارویی بود. درخت حاصل از نتایج فیلوژنی نشان‌دهنده تک‌نیایی بودن <em>Nostocales</em> است. همچنین، جنس‌های <em>Wollea</em> و <em>Anabaena</em> با یکدیگر و نیز جنس‌های<em>Nostoc</em> و <em>Desmonostoc</em> با هم، گروه‌های تک‌نیا را تشکیل دادند. نتایج نشان‌دهنده کارآمدی مارکر16S rRNA در سطوح بالای سیستم رده‌بندی، اعم از راسته، تیره و جنس می‌باشد. با این وجود، این مارکر در جداسازی آرایه‌های نزدیک به یکدیگر نظیر <em>Desmonostoc</em> و <em>Nostoc</em> از کارآمدی لازم برخوردار نیست. <br /><strong> </strong> <br /><strong> </strong>http://rostaniha.areo.ir/article_120238_8b2ffaa6c0638a2be185f8657dedb396.pdfسیانوپروکاریوت16s rrnaفیلوژنیwolleadesmonostoc |
| spellingShingle | سمیه زارع زاده حسین ریاحی زینب شریعتمداری معصومه سادات حسینی مطالعه تاکسونومیک سیانوپروکاریوت‌های بستر رویشی گیاهان دارویی با تاکید بر فیلوژنی آرایه‌های پیچیده با استفاده از مارکر 16S rRNA رستنی‌ها سیانوپروکاریوت 16s rrna فیلوژنی wollea desmonostoc |
| title | مطالعه تاکسونومیک سیانوپروکاریوت‌های بستر رویشی گیاهان دارویی با تاکید بر فیلوژنی آرایه‌های پیچیده با استفاده از مارکر 16S rRNA |
| title_full | مطالعه تاکسونومیک سیانوپروکاریوت‌های بستر رویشی گیاهان دارویی با تاکید بر فیلوژنی آرایه‌های پیچیده با استفاده از مارکر 16S rRNA |
| title_fullStr | مطالعه تاکسونومیک سیانوپروکاریوت‌های بستر رویشی گیاهان دارویی با تاکید بر فیلوژنی آرایه‌های پیچیده با استفاده از مارکر 16S rRNA |
| title_full_unstemmed | مطالعه تاکسونومیک سیانوپروکاریوت‌های بستر رویشی گیاهان دارویی با تاکید بر فیلوژنی آرایه‌های پیچیده با استفاده از مارکر 16S rRNA |
| title_short | مطالعه تاکسونومیک سیانوپروکاریوت‌های بستر رویشی گیاهان دارویی با تاکید بر فیلوژنی آرایه‌های پیچیده با استفاده از مارکر 16S rRNA |
| title_sort | مطالعه تاکسونومیک سیانوپروکاریوت‌های بستر رویشی گیاهان دارویی با تاکید بر فیلوژنی آرایه‌های پیچیده با استفاده از مارکر 16s rrna |
| topic | سیانوپروکاریوت 16s rrna فیلوژنی wollea desmonostoc |
| url | http://rostaniha.areo.ir/article_120238_8b2ffaa6c0638a2be185f8657dedb396.pdf |
| work_keys_str_mv | AT smyhzạrʿzạdh mṭạlʿhtạḵswnwmyḵsyạnwprwḵạrywthạybstrrwysẖygyạhạndạrwyybạtạḵydbrfylwzẖnyậrạyhhạypycẖydhbạạstfạdhạzmạrḵr16srrna AT ḥsynryạḥy mṭạlʿhtạḵswnwmyḵsyạnwprwḵạrywthạybstrrwysẖygyạhạndạrwyybạtạḵydbrfylwzẖnyậrạyhhạypycẖydhbạạstfạdhạzmạrḵr16srrna AT zynbsẖryʿtmdạry mṭạlʿhtạḵswnwmyḵsyạnwprwḵạrywthạybstrrwysẖygyạhạndạrwyybạtạḵydbrfylwzẖnyậrạyhhạypycẖydhbạạstfạdhạzmạrḵr16srrna AT mʿṣwmhsạdạtḥsyny mṭạlʿhtạḵswnwmyḵsyạnwprwḵạrywthạybstrrwysẖygyạhạndạrwyybạtạḵydbrfylwzẖnyậrạyhhạypycẖydhbạạstfạdhạzmạrḵr16srrna |