Bazı rezene popülasyonlarının (Foeniculum vulgare Mill.) ISSR markörlerine dayalı moleküler varyasyonu
Bu araştırma, farklı rezene popülasyonları arasındaki moleküler varyasyonunu belirlemek amacıyla yürütülmüştür. Araştırmada materyal olarak farklı kaynaklardan sağlanan ve ikisi doğal floradan toplanmış olan 6 adet rezene popülasyonu kullanılmıştır. Popülasyonların moleküler karakterizasyonu 6 adet...
| Main Authors: | , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Ondokuz Mayıs University
2020-02-01
|
| Series: | Anadolu Tarım Bilimleri Dergisi |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://dergipark.org.tr/tr/pub/omuanajas/issue/50260/678277?publisher=omu |
| _version_ | 1797906589491920896 |
|---|---|
| author | Refika GİACHİNO AKÇALI Betül AVCI |
| author_facet | Refika GİACHİNO AKÇALI Betül AVCI |
| author_sort | Refika GİACHİNO AKÇALI |
| collection | DOAJ |
| description | Bu araştırma, farklı rezene popülasyonları arasındaki moleküler varyasyonunu belirlemek amacıyla yürütülmüştür. Araştırmada materyal olarak farklı kaynaklardan sağlanan ve ikisi doğal floradan toplanmış olan 6 adet rezene popülasyonu kullanılmıştır. Popülasyonların moleküler karakterizasyonu 6 adet ISSR primeri ile belirlenmiştir. Toplam 57 bant elde edilmiş, bunlardan 48 adedi polimorfik olarak değerlendirilmiştir. Ortalama polimorfizm oranı %85 olarak bulunmuştur. PIC değerleri 0.33 (ISSR-16) ile 0.43 (ISSR-11) arasında değişim göstermiş, ortalama ise 0.37 olarak hesaplanmıştır. Primerlerin ortalama RP değeri 4.17 olarak hesaplanmış, en yüksek değer ISSR-4 (6.33) primerinden elde edilmiştir. Ortalama EMR değeri 6.78 bulunurken en yüksek değer ISSR-4 (10.29) primerinden elde edilmiştir. Ortalama MI değeri 2.47 olarak tahmin edildi, en yüksek değer yine ISSR-4 (3.67) primerinde gözlenmiştir. ISSR-4 primeri bu üç parametre ve en yüksek toplam ve polimorfik bant sayısı bakımından öne çıkan primer olmuştur. Rezene popülasyonları arasındaki benzerlik değerleri 0.30 ile 0.95 arasında bulunmuştur. Jaccard'ın benzerlik matrisleri ile küme sonucu arasındaki zihinsel test r = 0.99 (Kofenetik korelasyon katsayısı) olarak bulunmuştur ve ISSR tabanlı benzerlik matrisi ile küme arasında çok iyi bir korelasyon olduğunu göstermektedir. İncelenen ISSR primerleri bakımından ekimi ve satışı yapılan Burdur, Denizli, Isparta ve Izmir populasyonları birbirlerine genetik bakımdan oldukça benzer bulunurken doğal floradan toplanan Manisa Yuntdağı ve Ödemis popülasyonları ayrı gruplarda yer almışlardır. |
| first_indexed | 2024-04-10T10:23:07Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-3ddc7fc718d44beab32a9c7ec6f18872 |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 1308-8750 1308-8769 |
| language | English |
| last_indexed | 2024-04-10T10:23:07Z |
| publishDate | 2020-02-01 |
| publisher | Ondokuz Mayıs University |
| record_format | Article |
| series | Anadolu Tarım Bilimleri Dergisi |
| spelling | doaj.art-3ddc7fc718d44beab32a9c7ec6f188722023-02-15T16:21:30ZengOndokuz Mayıs UniversityAnadolu Tarım Bilimleri Dergisi1308-87501308-87692020-02-0135114014610.7161/omuanajas.678277194Bazı rezene popülasyonlarının (Foeniculum vulgare Mill.) ISSR markörlerine dayalı moleküler varyasyonuRefika GİACHİNO AKÇALI0Betül AVCI1EGE UNIVERSITY, FACULTY OF AGRICULTURE, DEPARTMENT OF FIELD CROPSEGE UNIVERSITY, ÖDEMİŞ VOCATIONAL SCHOOLBu araştırma, farklı rezene popülasyonları arasındaki moleküler varyasyonunu belirlemek amacıyla yürütülmüştür. Araştırmada materyal olarak farklı kaynaklardan sağlanan ve ikisi doğal floradan toplanmış olan 6 adet rezene popülasyonu kullanılmıştır. Popülasyonların moleküler karakterizasyonu 6 adet ISSR primeri ile belirlenmiştir. Toplam 57 bant elde edilmiş, bunlardan 48 adedi polimorfik olarak değerlendirilmiştir. Ortalama polimorfizm oranı %85 olarak bulunmuştur. PIC değerleri 0.33 (ISSR-16) ile 0.43 (ISSR-11) arasında değişim göstermiş, ortalama ise 0.37 olarak hesaplanmıştır. Primerlerin ortalama RP değeri 4.17 olarak hesaplanmış, en yüksek değer ISSR-4 (6.33) primerinden elde edilmiştir. Ortalama EMR değeri 6.78 bulunurken en yüksek değer ISSR-4 (10.29) primerinden elde edilmiştir. Ortalama MI değeri 2.47 olarak tahmin edildi, en yüksek değer yine ISSR-4 (3.67) primerinde gözlenmiştir. ISSR-4 primeri bu üç parametre ve en yüksek toplam ve polimorfik bant sayısı bakımından öne çıkan primer olmuştur. Rezene popülasyonları arasındaki benzerlik değerleri 0.30 ile 0.95 arasında bulunmuştur. Jaccard'ın benzerlik matrisleri ile küme sonucu arasındaki zihinsel test r = 0.99 (Kofenetik korelasyon katsayısı) olarak bulunmuştur ve ISSR tabanlı benzerlik matrisi ile küme arasında çok iyi bir korelasyon olduğunu göstermektedir. İncelenen ISSR primerleri bakımından ekimi ve satışı yapılan Burdur, Denizli, Isparta ve Izmir populasyonları birbirlerine genetik bakımdan oldukça benzer bulunurken doğal floradan toplanan Manisa Yuntdağı ve Ödemis popülasyonları ayrı gruplarda yer almışlardır.https://dergipark.org.tr/tr/pub/omuanajas/issue/50260/678277?publisher=omufennelissrgenetic diversitypicpcoarezeneissrgenetik farklılıkpicpcoa |
| spellingShingle | Refika GİACHİNO AKÇALI Betül AVCI Bazı rezene popülasyonlarının (Foeniculum vulgare Mill.) ISSR markörlerine dayalı moleküler varyasyonu Anadolu Tarım Bilimleri Dergisi fennel issr genetic diversity pic pcoa rezene issr genetik farklılık pic pcoa |
| title | Bazı rezene popülasyonlarının (Foeniculum vulgare Mill.) ISSR markörlerine dayalı moleküler varyasyonu |
| title_full | Bazı rezene popülasyonlarının (Foeniculum vulgare Mill.) ISSR markörlerine dayalı moleküler varyasyonu |
| title_fullStr | Bazı rezene popülasyonlarının (Foeniculum vulgare Mill.) ISSR markörlerine dayalı moleküler varyasyonu |
| title_full_unstemmed | Bazı rezene popülasyonlarının (Foeniculum vulgare Mill.) ISSR markörlerine dayalı moleküler varyasyonu |
| title_short | Bazı rezene popülasyonlarının (Foeniculum vulgare Mill.) ISSR markörlerine dayalı moleküler varyasyonu |
| title_sort | bazi rezene populasyonlarinin foeniculum vulgare mill issr markorlerine dayali molekuler varyasyonu |
| topic | fennel issr genetic diversity pic pcoa rezene issr genetik farklılık pic pcoa |
| url | https://dergipark.org.tr/tr/pub/omuanajas/issue/50260/678277?publisher=omu |
| work_keys_str_mv | AT refikagiachinoakcali bazırezenepopulasyonlarınınfoeniculumvulgaremillissrmarkorlerinedayalımolekulervaryasyonu AT betulavci bazırezenepopulasyonlarınınfoeniculumvulgaremillissrmarkorlerinedayalımolekulervaryasyonu |