Respiratory pathogens in children with acute lower respiratory infection detected through multiplex real-time PCR
Introducción. La infección respiratoria aguda en niños tiene una alta carga de enfermedad. La detección de múltiples microorganismos a través de pruebas moleculares en hisopados nasales podría cambiar el paradigma de patógeno único causal de enfermedad respiratoria en niños y ser de utilidad en la p...
| Main Authors: | , , , , , , , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Universidad Nacional de Colombia
2021-09-01
|
| Series: | Revista de la Facultad de Medicina |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://revistas.unal.edu.co/index.php/revfacmed/article/view/94515 |
| _version_ | 1797824700489924608 |
|---|---|
| author | María del Pilar Montilla-Velásquez Diego Mauricio Galvis-Trujillo Suli Liliana Lizcano-Gamboa Gisell Adriana Cobos Angela Tatiana Rojas-Pinto Daniel Mauricio Rincón-Fernández Paola Jimena Soler-Rincón María Alejandra Perdomo-Rivas Diana Carolina Orozco-Vanegas María Consuelo Mor-Rodríguez |
| author_facet | María del Pilar Montilla-Velásquez Diego Mauricio Galvis-Trujillo Suli Liliana Lizcano-Gamboa Gisell Adriana Cobos Angela Tatiana Rojas-Pinto Daniel Mauricio Rincón-Fernández Paola Jimena Soler-Rincón María Alejandra Perdomo-Rivas Diana Carolina Orozco-Vanegas María Consuelo Mor-Rodríguez |
| author_sort | María del Pilar Montilla-Velásquez |
| collection | DOAJ |
| description | Introducción. La infección respiratoria aguda en niños tiene una alta carga de enfermedad. La detección de múltiples microorganismos a través de pruebas moleculares en hisopados nasales podría cambiar el paradigma de patógeno único causal de enfermedad respiratoria en niños y ser de utilidad en la práctica clínica.
Objetivo. Caracterizar los patógenos identificados mediante la técnica de reacción en cadena de polimerasa multiplex en tiempo real (RT-PCR) en hisopado nasal, así como las variables clínicas y los resultados de laboratorio en niños <5 años diagnosticados con infección respiratoria aguda baja (IRAB) y hospitalizados en Bogotá D.C., Colombia.
Materiales y métodos. Estudio transversal realizado en 81 niños hospitalizados entre septiembre de 2019 y marzo de 2020 en la clínica Cafam y en quienes se hizo hisopado nasal para realizar la identificación microbiológica mediante la prueba RT-PCR múltiplex Allplex. Las correlaciones entre el número de patógenos y los niveles de células del hemograma y el nivel de proteína C reactiva se determinaron mediante el coeficiente de correlación de Spearman.
Resultados. La edad promedio fue 17.23 meses (±14.44), 54.32% fueron varones y 51.85%, lactantes menores. Se identificaron 149 microorganismos (60.40% virus) en 63 niños (77.78%). Hubo infección mixta en el 48.15% y coinfección en 11.11% de los niños. Respecto a los hallazgos clínicos, la dificultad respiratoria, la obstrucción de la vía respiratoria alta, la tos, la fiebre y la faringitis fueron más comunes en los casos de infección mixta (32.97%), ausencia de microorganismo (16.00%), coinfección (64.40%), infección mixta (29.78%) y ausencia de microorganismo (22.00%), respectivamente. Se observó una correlación negativa entre el número de leucocitos y neutrófilos y el número de microorganismos detectados en preescolares (r=-0.46; p=0.058 y r=-0.51; p=0.033) y una positiva entre el recuento de monocitos y el número de microorganismos detectados (r=0.53; p=0.0096).
Conclusión. La prueba RT-PCR multiplex permitió identificar microorganismos en la mayoría de niños, así como casos de infección mixta y coinfección en más de la mitad de la muestra. Además, los hallazgos clínicos fueron altamente heterogéneos entre los niños según el resultado de la prueba.
|
| first_indexed | 2024-03-13T10:43:03Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-428877d863c8420b8c59126ba050945a |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 0120-0011 2357-3848 |
| language | English |
| last_indexed | 2024-03-13T10:43:03Z |
| publishDate | 2021-09-01 |
| publisher | Universidad Nacional de Colombia |
| record_format | Article |
| series | Revista de la Facultad de Medicina |
| spelling | doaj.art-428877d863c8420b8c59126ba050945a2023-05-17T22:02:51ZengUniversidad Nacional de ColombiaRevista de la Facultad de Medicina0120-00112357-38482021-09-0170310.15446/revfacmed.v70n3.94515Respiratory pathogens in children with acute lower respiratory infection detected through multiplex real-time PCRMaría del Pilar Montilla-Velásquez0Diego Mauricio Galvis-Trujillo1Suli Liliana Lizcano-Gamboa 2Gisell Adriana Cobos3Angela Tatiana Rojas-Pinto 4Daniel Mauricio Rincón-Fernández 5Paola Jimena Soler-Rincón 6María Alejandra Perdomo-Rivas 7Diana Carolina Orozco-Vanegas8María Consuelo Mor-Rodríguez9Clínica Cafam - Pediatric Emergency Department - Bogotá D.C. - Colombia.Clínica Cafam - Pediatric Emergency Department - Bogotá D.C. - Colombia.Clínica Cafam - Pediatric Emergency Department - Bogotá D.C. - Colombia.Clínica Cafam - Pediatric Emergency Department - Bogotá D.C. - Colombia.Clínica Cafam - Pediatric Emergency Department - Bogotá D.C. - Colombia.Clínica Cafam - Pediatric Emergency Department - Bogotá D.C. - Colombia.Clínica Cafam - Pediatric Emergency Department - Bogotá D.C. - Colombia.Clínica Cafam - Pediatric Emergency Department - Bogotá D.C. - Colombia.Clínica Cafam - Pediatric Emergency Department - Bogotá D.C. - Colombia.Clínica Cafam - Pediatric Emergency Department - Bogotá D.C. - Colombia.Introducción. La infección respiratoria aguda en niños tiene una alta carga de enfermedad. La detección de múltiples microorganismos a través de pruebas moleculares en hisopados nasales podría cambiar el paradigma de patógeno único causal de enfermedad respiratoria en niños y ser de utilidad en la práctica clínica. Objetivo. Caracterizar los patógenos identificados mediante la técnica de reacción en cadena de polimerasa multiplex en tiempo real (RT-PCR) en hisopado nasal, así como las variables clínicas y los resultados de laboratorio en niños <5 años diagnosticados con infección respiratoria aguda baja (IRAB) y hospitalizados en Bogotá D.C., Colombia. Materiales y métodos. Estudio transversal realizado en 81 niños hospitalizados entre septiembre de 2019 y marzo de 2020 en la clínica Cafam y en quienes se hizo hisopado nasal para realizar la identificación microbiológica mediante la prueba RT-PCR múltiplex Allplex. Las correlaciones entre el número de patógenos y los niveles de células del hemograma y el nivel de proteína C reactiva se determinaron mediante el coeficiente de correlación de Spearman. Resultados. La edad promedio fue 17.23 meses (±14.44), 54.32% fueron varones y 51.85%, lactantes menores. Se identificaron 149 microorganismos (60.40% virus) en 63 niños (77.78%). Hubo infección mixta en el 48.15% y coinfección en 11.11% de los niños. Respecto a los hallazgos clínicos, la dificultad respiratoria, la obstrucción de la vía respiratoria alta, la tos, la fiebre y la faringitis fueron más comunes en los casos de infección mixta (32.97%), ausencia de microorganismo (16.00%), coinfección (64.40%), infección mixta (29.78%) y ausencia de microorganismo (22.00%), respectivamente. Se observó una correlación negativa entre el número de leucocitos y neutrófilos y el número de microorganismos detectados en preescolares (r=-0.46; p=0.058 y r=-0.51; p=0.033) y una positiva entre el recuento de monocitos y el número de microorganismos detectados (r=0.53; p=0.0096). Conclusión. La prueba RT-PCR multiplex permitió identificar microorganismos en la mayoría de niños, así como casos de infección mixta y coinfección en más de la mitad de la muestra. Además, los hallazgos clínicos fueron altamente heterogéneos entre los niños según el resultado de la prueba. https://revistas.unal.edu.co/index.php/revfacmed/article/view/94515VirusesBacteriaRespiratory Tract DiseasesReal-Time Polymerase Chain ReactionInfantChild |
| spellingShingle | María del Pilar Montilla-Velásquez Diego Mauricio Galvis-Trujillo Suli Liliana Lizcano-Gamboa Gisell Adriana Cobos Angela Tatiana Rojas-Pinto Daniel Mauricio Rincón-Fernández Paola Jimena Soler-Rincón María Alejandra Perdomo-Rivas Diana Carolina Orozco-Vanegas María Consuelo Mor-Rodríguez Respiratory pathogens in children with acute lower respiratory infection detected through multiplex real-time PCR Revista de la Facultad de Medicina Viruses Bacteria Respiratory Tract Diseases Real-Time Polymerase Chain Reaction Infant Child |
| title | Respiratory pathogens in children with acute lower respiratory infection detected through multiplex real-time PCR |
| title_full | Respiratory pathogens in children with acute lower respiratory infection detected through multiplex real-time PCR |
| title_fullStr | Respiratory pathogens in children with acute lower respiratory infection detected through multiplex real-time PCR |
| title_full_unstemmed | Respiratory pathogens in children with acute lower respiratory infection detected through multiplex real-time PCR |
| title_short | Respiratory pathogens in children with acute lower respiratory infection detected through multiplex real-time PCR |
| title_sort | respiratory pathogens in children with acute lower respiratory infection detected through multiplex real time pcr |
| topic | Viruses Bacteria Respiratory Tract Diseases Real-Time Polymerase Chain Reaction Infant Child |
| url | https://revistas.unal.edu.co/index.php/revfacmed/article/view/94515 |
| work_keys_str_mv | AT mariadelpilarmontillavelasquez respiratorypathogensinchildrenwithacutelowerrespiratoryinfectiondetectedthroughmultiplexrealtimepcr AT diegomauriciogalvistrujillo respiratorypathogensinchildrenwithacutelowerrespiratoryinfectiondetectedthroughmultiplexrealtimepcr AT sulililianalizcanogamboa respiratorypathogensinchildrenwithacutelowerrespiratoryinfectiondetectedthroughmultiplexrealtimepcr AT giselladrianacobos respiratorypathogensinchildrenwithacutelowerrespiratoryinfectiondetectedthroughmultiplexrealtimepcr AT angelatatianarojaspinto respiratorypathogensinchildrenwithacutelowerrespiratoryinfectiondetectedthroughmultiplexrealtimepcr AT danielmauriciorinconfernandez respiratorypathogensinchildrenwithacutelowerrespiratoryinfectiondetectedthroughmultiplexrealtimepcr AT paolajimenasolerrincon respiratorypathogensinchildrenwithacutelowerrespiratoryinfectiondetectedthroughmultiplexrealtimepcr AT mariaalejandraperdomorivas respiratorypathogensinchildrenwithacutelowerrespiratoryinfectiondetectedthroughmultiplexrealtimepcr AT dianacarolinaorozcovanegas respiratorypathogensinchildrenwithacutelowerrespiratoryinfectiondetectedthroughmultiplexrealtimepcr AT mariaconsuelomorrodriguez respiratorypathogensinchildrenwithacutelowerrespiratoryinfectiondetectedthroughmultiplexrealtimepcr |