PCR-SSP tekniğine dayalı laboratuvar yapımı HLA-B*27 optimizasyonu ve test kiti geliştirilmesi
AAmaç: Çalışmada Ankilozan spondilit ve diğer spondiloartropatilerin moleküler tanısında kullanılmak üzere güvenilir, ekonomik ve rutin kullanıma uygun laboratuvar yapımı (in-house) HLA-B*27 PCR-SSP tanı kiti geliştirilmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya, ticari kitler kullanılarak HLA-B*...
| Main Authors: | , , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Cukurova University
2018-12-01
|
| Series: | Cukurova Medical Journal |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://dergipark.org.tr/tr/pub/cumj/issue/38921/429882?publisher=cu |
| _version_ | 1797920713114386432 |
|---|---|
| author | Ramazan GÜNEŞAÇAR Bekir Mehmet KELLECİ Mehmet Yaşar ÖZKARS İlkay ADANIR Mustafa ÇELİK |
| author_facet | Ramazan GÜNEŞAÇAR Bekir Mehmet KELLECİ Mehmet Yaşar ÖZKARS İlkay ADANIR Mustafa ÇELİK |
| author_sort | Ramazan GÜNEŞAÇAR |
| collection | DOAJ |
| description | AAmaç: Çalışmada Ankilozan spondilit ve diğer spondiloartropatilerin moleküler tanısında kullanılmak üzere güvenilir, ekonomik ve rutin kullanıma uygun laboratuvar yapımı (in-house) HLA-B*27 PCR-SSP tanı kiti geliştirilmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya, ticari kitler kullanılarak HLA-B*27 pozitif olarak saptanan 119 ve negatif olarak saptanan 446 olmak üzere toplam 565 olgu dahil edildi. HLA-B*27 tipleme için sekansa spesifik primerler ve beta globin gen bölgesinden yararlanılarak dizayn edilen internal kontrol primer çifti kullanılarak PCR optimizasyonu gerçekleştirildi. Bulgular: HLA-B*27’si pozitif olan olgularda, %2’lik agaroz jelinde 273 bç internal kontrol bandının ilerisinde 149 bç’lik spesifik bant olmak üzere çift bant, B*27 negatif hastalarda ise sadece 273 bç’lik internal kontrol bandı saptandı. Ticari kitler kullanılarak HLA-B*27’si pozitif olarak saptanan 119 ve negatif olarak saptanan 446 bireyin sonuçları ile tarafımızdan geliştirilen PCR-SSP kiti kullanılarak elde edilen sonuçların tamamen uyumlu olması nedeniyle sensitivite ve spesifite %100 olarak belirlendi. Geliştirdiğimiz laboratuvar yapımı PCR-SSP kitinin maliyetinin, ticari kitlere göre en az 50 kat daha ucuz olduğu görüldü. Sonuç: Ticari kitler kullanılarak HLA-B*27’si pozitif olarak saptanan 119 ve negatif olarak saptanan 446 olgunun tamamında, geliştirdiğimiz yöntemle de birebir uyumlu sonuçlar elde edildi. Bu bulgular geliştirdiğimiz kitin güvenilir, ekonomik ve rutin kullanıma uygun olduğunu göstermektedir. |
| first_indexed | 2024-04-10T14:05:24Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-437c37a52dc64802b57380ef713afb66 |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 2602-3040 |
| language | English |
| last_indexed | 2024-04-10T14:05:24Z |
| publishDate | 2018-12-01 |
| publisher | Cukurova University |
| record_format | Article |
| series | Cukurova Medical Journal |
| spelling | doaj.art-437c37a52dc64802b57380ef713afb662023-02-15T16:10:03ZengCukurova UniversityCukurova Medical Journal2602-30402018-12-0143Ek 124024710.17826/cumj.42988248PCR-SSP tekniğine dayalı laboratuvar yapımı HLA-B*27 optimizasyonu ve test kiti geliştirilmesiRamazan GÜNEŞAÇAR0Bekir Mehmet KELLECİ1Mehmet Yaşar ÖZKARS2İlkay ADANIR3Mustafa ÇELİK4KAHRAMANMARAŞ SÜTÇÜ İMAM ÜNİVERSİTESİ, TIP FAKÜLTESİ, TEMEL TIP BİLİMLERİ BÖLÜMÜ, FİZYOLOJİ ANABİLİM DALIKAHRAMANMARAŞ SÜTÇÜ İMAM ÜNİVERSİTESİ, TIP FAKÜLTESİ, TEMEL TIP BİLİMLERİ BÖLÜMÜ, FİZYOLOJİ ANABİLİM DALIKAHRAMANMARAŞ SÜTÇÜ İMAM ÜNİVERSİTESİ, TIP FAKÜLTESİ, DAHİLİ TIP BİLİMLERİ BÖLÜMÜ, ÇOCUK RUH SAĞLIĞI VE HASTALIKLARI ANABİLİM DALIKAHRAMANMARAŞ SÜTÇÜ İMAM ÜNİVERSİTESİ, TIP FAKÜLTESİ, TEMEL TIP BİLİMLERİ BÖLÜMÜ, FİZYOLOJİ ANABİLİM DALIKAHRAMANMARAŞ SÜTÇÜ İMAM ÜNİVERSİTESİ, TIP FAKÜLTESİ, TEMEL TIP BİLİMLERİ BÖLÜMÜ, FİZYOLOJİ ANABİLİM DALIAAmaç: Çalışmada Ankilozan spondilit ve diğer spondiloartropatilerin moleküler tanısında kullanılmak üzere güvenilir, ekonomik ve rutin kullanıma uygun laboratuvar yapımı (in-house) HLA-B*27 PCR-SSP tanı kiti geliştirilmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya, ticari kitler kullanılarak HLA-B*27 pozitif olarak saptanan 119 ve negatif olarak saptanan 446 olmak üzere toplam 565 olgu dahil edildi. HLA-B*27 tipleme için sekansa spesifik primerler ve beta globin gen bölgesinden yararlanılarak dizayn edilen internal kontrol primer çifti kullanılarak PCR optimizasyonu gerçekleştirildi. Bulgular: HLA-B*27’si pozitif olan olgularda, %2’lik agaroz jelinde 273 bç internal kontrol bandının ilerisinde 149 bç’lik spesifik bant olmak üzere çift bant, B*27 negatif hastalarda ise sadece 273 bç’lik internal kontrol bandı saptandı. Ticari kitler kullanılarak HLA-B*27’si pozitif olarak saptanan 119 ve negatif olarak saptanan 446 bireyin sonuçları ile tarafımızdan geliştirilen PCR-SSP kiti kullanılarak elde edilen sonuçların tamamen uyumlu olması nedeniyle sensitivite ve spesifite %100 olarak belirlendi. Geliştirdiğimiz laboratuvar yapımı PCR-SSP kitinin maliyetinin, ticari kitlere göre en az 50 kat daha ucuz olduğu görüldü. Sonuç: Ticari kitler kullanılarak HLA-B*27’si pozitif olarak saptanan 119 ve negatif olarak saptanan 446 olgunun tamamında, geliştirdiğimiz yöntemle de birebir uyumlu sonuçlar elde edildi. Bu bulgular geliştirdiğimiz kitin güvenilir, ekonomik ve rutin kullanıma uygun olduğunu göstermektedir.https://dergipark.org.tr/tr/pub/cumj/issue/38921/429882?publisher=cuhla-b*27pcr-ssptest kit developmentankylosing spondylitisspondyloarthropathieshla-b*27pcr-ssptest kiti geliştirilmesiankilozan spondilitspondiloartropatiler |
| spellingShingle | Ramazan GÜNEŞAÇAR Bekir Mehmet KELLECİ Mehmet Yaşar ÖZKARS İlkay ADANIR Mustafa ÇELİK PCR-SSP tekniğine dayalı laboratuvar yapımı HLA-B*27 optimizasyonu ve test kiti geliştirilmesi Cukurova Medical Journal hla-b*27 pcr-ssp test kit development ankylosing spondylitis spondyloarthropathies hla-b*27 pcr-ssp test kiti geliştirilmesi ankilozan spondilit spondiloartropatiler |
| title | PCR-SSP tekniğine dayalı laboratuvar yapımı HLA-B*27 optimizasyonu ve test kiti geliştirilmesi |
| title_full | PCR-SSP tekniğine dayalı laboratuvar yapımı HLA-B*27 optimizasyonu ve test kiti geliştirilmesi |
| title_fullStr | PCR-SSP tekniğine dayalı laboratuvar yapımı HLA-B*27 optimizasyonu ve test kiti geliştirilmesi |
| title_full_unstemmed | PCR-SSP tekniğine dayalı laboratuvar yapımı HLA-B*27 optimizasyonu ve test kiti geliştirilmesi |
| title_short | PCR-SSP tekniğine dayalı laboratuvar yapımı HLA-B*27 optimizasyonu ve test kiti geliştirilmesi |
| title_sort | pcr ssp teknigine dayali laboratuvar yapimi hla b 27 optimizasyonu ve test kiti gelistirilmesi |
| topic | hla-b*27 pcr-ssp test kit development ankylosing spondylitis spondyloarthropathies hla-b*27 pcr-ssp test kiti geliştirilmesi ankilozan spondilit spondiloartropatiler |
| url | https://dergipark.org.tr/tr/pub/cumj/issue/38921/429882?publisher=cu |
| work_keys_str_mv | AT ramazangunesacar pcrssptekniginedayalılaboratuvaryapımıhlab27optimizasyonuvetestkitigelistirilmesi AT bekirmehmetkelleci pcrssptekniginedayalılaboratuvaryapımıhlab27optimizasyonuvetestkitigelistirilmesi AT mehmetyasarozkars pcrssptekniginedayalılaboratuvaryapımıhlab27optimizasyonuvetestkitigelistirilmesi AT ilkayadanir pcrssptekniginedayalılaboratuvaryapımıhlab27optimizasyonuvetestkitigelistirilmesi AT mustafacelik pcrssptekniginedayalılaboratuvaryapımıhlab27optimizasyonuvetestkitigelistirilmesi |