DIVERSIDADE CLONAL DE CUTIBACTERIUM ACNES EM AMOSTRAS DE TECIDO PROFUNDO DE PACIENTES SUBMETIDOS A CIRURGIAS PRIMÁRIAS NÃO INFECTADAS DE OMBRO
Introdução/Objetivo: A diversidade genômica e filogenética de Cutibacterium acnes tem sido identificada como potenciais marcadores de patogenicidade. Analisamos os isolados de C. acnes obtidos de amostras clínicas, para investigar suas características genéticas e filotípicas. Métodos: No total, 11 c...
| Main Authors: | , , , , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Elsevier
2023-10-01
|
| Series: | Brazilian Journal of Infectious Diseases |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1413867023004075 |
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| author | Mauro José Salles Mariana Neri Lucas Kurihara Ingrid Nayara Marcelo Santos Thomas Stravinskas Durigon Ana Karolina Antunes Eisen Giovana Santos Caleiro Jansen de Araújo |
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| description | Introdução/Objetivo: A diversidade genômica e filogenética de Cutibacterium acnes tem sido identificada como potenciais marcadores de patogenicidade. Analisamos os isolados de C. acnes obtidos de amostras clínicas, para investigar suas características genéticas e filotípicas. Métodos: No total, 11 cepas de C. acnes foram identificados em amostras de tecidos profundos (bursa, osso e sinóvia) de pacientes submetidos a cirurgias limpas primárias de ombro que foram acompanhados prospectivamente por 2 anos. Os isolados foram submetidos a técnica de sequenciamento genômico completo (WGS) para identificar marcadores genômicos relevantes (genes de biofilme, resistência e patogenicidade). O DNA bacteriano foi purificado usando o kit ZymoBIOMICS DNA Miniprep e a concentração foi medida fluorímetro Qubit® 2.0. O sequenciamento foi realizado com o Ion torrent v2.0 da Thermo Fisher e todas as reações de sequenciamento seguiram as recomendações do fabricante. As sequências geradas foram então montadas, anotadas e analisadas de acordo por ferramentas de bioinformática. Resultados: O genoma completo dos isolados de C. acnes (todos multissensíveis) pertencem a quatro tipos diferentes de filotipo (IA1, IA2, IB and II) e quatro subtipos diferentes de SLST (H1, F1, A1 e K1), sendo que o H1 (tipo IB ST5 CC5) foi predominante em 72,7% (8/11). Em um paciente, foram identificadas duas cepas com filotipos diferentes, o tipo II (K1) e outro ao tipo IA2 (F1), sugerindo policlonalidade. Os seguintes genes marcadores de patogenicidade foram identificados, a lipoproteína LpqB, a chaperonina GroEL, os fatores de elongamento EF-Tu, EF-G e o fator CAMP, associados à produção de biofilme. Interessantemente, não foram detectados genes de fatores putativos de virulência, como tly e hyl, genes de resistência bacteriana e tampouco a presença de plasmídeos. Nenhuma infecção foi detectada no seguimento dos pacientes. Conclusão: Nossos resultados preliminares permitem concluir que os isolados de C. acnes são policlonais e possuem poucos marcadores de patogenicidade, além de genes formadores de biofilme. Mesmo prevalecendo os filotipos mais associados às infecções em implantes ortopédicos (IB e II), estes achados reforçam a possibilidade destas cepas serem provenientes da pele ao redor do campo operatório e terem sido inoculados durante o ato operatório. Sugerimos que a decisão de tratamento antibiótico nesta situação deve ser baseada em conjunto com a presença de sinais e sintomas de infecção. |
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| spelling | doaj.art-47400f513f134e0c999184149f7e281f2023-11-16T06:07:27ZengElsevierBrazilian Journal of Infectious Diseases1413-86702023-10-0127103147DIVERSIDADE CLONAL DE CUTIBACTERIUM ACNES EM AMOSTRAS DE TECIDO PROFUNDO DE PACIENTES SUBMETIDOS A CIRURGIAS PRIMÁRIAS NÃO INFECTADAS DE OMBROMauro José Salles0Mariana Neri Lucas Kurihara1Ingrid Nayara Marcelo Santos2Thomas Stravinskas Durigon3Ana Karolina Antunes Eisen4Giovana Santos Caleiro5Jansen de Araújo6Escola Paulista de Medicina (EPM), Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), São Paulo, SP, Brasil; Corresponding author.Escola Paulista de Medicina (EPM), Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), São Paulo, SP, BrasilEscola Paulista de Medicina (EPM), Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), São Paulo, SP, BrasilEscola Paulista de Medicina (EPM), Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), São Paulo, SP, BrasilUniversidade de São Paulo (USP), São Paulo, SP, BrasilUniversidade de São Paulo (USP), São Paulo, SP, BrasilUniversidade de São Paulo (USP), São Paulo, SP, BrasilIntrodução/Objetivo: A diversidade genômica e filogenética de Cutibacterium acnes tem sido identificada como potenciais marcadores de patogenicidade. Analisamos os isolados de C. acnes obtidos de amostras clínicas, para investigar suas características genéticas e filotípicas. Métodos: No total, 11 cepas de C. acnes foram identificados em amostras de tecidos profundos (bursa, osso e sinóvia) de pacientes submetidos a cirurgias limpas primárias de ombro que foram acompanhados prospectivamente por 2 anos. Os isolados foram submetidos a técnica de sequenciamento genômico completo (WGS) para identificar marcadores genômicos relevantes (genes de biofilme, resistência e patogenicidade). O DNA bacteriano foi purificado usando o kit ZymoBIOMICS DNA Miniprep e a concentração foi medida fluorímetro Qubit® 2.0. O sequenciamento foi realizado com o Ion torrent v2.0 da Thermo Fisher e todas as reações de sequenciamento seguiram as recomendações do fabricante. As sequências geradas foram então montadas, anotadas e analisadas de acordo por ferramentas de bioinformática. Resultados: O genoma completo dos isolados de C. acnes (todos multissensíveis) pertencem a quatro tipos diferentes de filotipo (IA1, IA2, IB and II) e quatro subtipos diferentes de SLST (H1, F1, A1 e K1), sendo que o H1 (tipo IB ST5 CC5) foi predominante em 72,7% (8/11). Em um paciente, foram identificadas duas cepas com filotipos diferentes, o tipo II (K1) e outro ao tipo IA2 (F1), sugerindo policlonalidade. Os seguintes genes marcadores de patogenicidade foram identificados, a lipoproteína LpqB, a chaperonina GroEL, os fatores de elongamento EF-Tu, EF-G e o fator CAMP, associados à produção de biofilme. Interessantemente, não foram detectados genes de fatores putativos de virulência, como tly e hyl, genes de resistência bacteriana e tampouco a presença de plasmídeos. Nenhuma infecção foi detectada no seguimento dos pacientes. Conclusão: Nossos resultados preliminares permitem concluir que os isolados de C. acnes são policlonais e possuem poucos marcadores de patogenicidade, além de genes formadores de biofilme. Mesmo prevalecendo os filotipos mais associados às infecções em implantes ortopédicos (IB e II), estes achados reforçam a possibilidade destas cepas serem provenientes da pele ao redor do campo operatório e terem sido inoculados durante o ato operatório. Sugerimos que a decisão de tratamento antibiótico nesta situação deve ser baseada em conjunto com a presença de sinais e sintomas de infecção.http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1413867023004075Colonização bacteriana Cirurgia de Ombro Sequenciamento completo do genoma |
| spellingShingle | Mauro José Salles Mariana Neri Lucas Kurihara Ingrid Nayara Marcelo Santos Thomas Stravinskas Durigon Ana Karolina Antunes Eisen Giovana Santos Caleiro Jansen de Araújo DIVERSIDADE CLONAL DE CUTIBACTERIUM ACNES EM AMOSTRAS DE TECIDO PROFUNDO DE PACIENTES SUBMETIDOS A CIRURGIAS PRIMÁRIAS NÃO INFECTADAS DE OMBRO Brazilian Journal of Infectious Diseases Colonização bacteriana Cirurgia de Ombro Sequenciamento completo do genoma |
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