Propuesta para la comparación de flujos metabólicos
El análisis de flujos metabólicos puede proporcionar información importante para una mejor comprensión de la vida y todos sus procesos, beneficiando directamente a áreas como la medicina, la agronomía, la farmacia y otras. Algunas de las principales herramientas utilizadas para estudiar y analizar l...
| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | Spanish |
| Published: |
Instituto Tecnológico de Costa Rica
2020-03-01
|
| Series: | Tecnología en Marcha |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://revistas.tec.ac.cr/index.php/tec_marcha/article/view/5072 |
| _version_ | 1811216150904700928 |
|---|---|
| author | Esteban Arias-Méndez Alonso Montero-Marín Francisco J. Torres-Rojas |
| author_facet | Esteban Arias-Méndez Alonso Montero-Marín Francisco J. Torres-Rojas |
| author_sort | Esteban Arias-Méndez |
| collection | DOAJ |
| description | El análisis de flujos metabólicos puede proporcionar información importante para una mejor comprensión de la vida y todos sus procesos, beneficiando directamente a áreas como la medicina, la agronomía, la farmacia y otras. Algunas de las principales herramientas utilizadas para estudiar y analizar las rutas metabólicas se han basado en la idea de la comparación de rutas metabólicas, utilizando estructuras de datos como grafos. Algunas de esas tareas se consideran problemas computacionales difíciles. Por otro lado, esas comparaciones aún no han tenido en cuenta el flujo metabólico como parte de la vía o proceso metabólico. Es decir, considerar cuánta cantidad de un metabolito pasa a través de un sistema de reacción con el tiempo. Proponemos aquí una forma simple de comparar rutas metabólicas utilizando su información de flujo relacionada mediante un método simple de comparación de rutas metabólicas introducido en 2017 y ajustándolo a grafos ponderados. Los algoritmos analizan los grafos ponderados asociados de las rutas de flujo metabólico y proporcionan una puntuación rápida de sus similitudes de flujo en primer lugar y una lista de similitudes y diferencias entre las rutas de flujo dadas, enumeradas como rutas. Proporcionamos algunas ideas sobre el análisis a continuación para obtener un buen sistema de puntuación al comparar grafos ponderados relacionados con las rutas metabólicas en un cálculo de bajo costo. |
| first_indexed | 2024-04-12T06:34:31Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-4a067145cab0495088c30e5fea546d41 |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 0379-3982 2215-3241 |
| language | Spanish |
| last_indexed | 2024-04-12T06:34:31Z |
| publishDate | 2020-03-01 |
| publisher | Instituto Tecnológico de Costa Rica |
| record_format | Article |
| series | Tecnología en Marcha |
| spelling | doaj.art-4a067145cab0495088c30e5fea546d412022-12-22T03:43:55ZspaInstituto Tecnológico de Costa RicaTecnología en Marcha0379-39822215-32412020-03-01ág. 313710.18845/tm.v33i5.50724335Propuesta para la comparación de flujos metabólicosEsteban Arias-Méndez0https://orcid.org/0000-0002-5600-8381Alonso Montero-Marín1https://orcid.org/0000-0002-8206-5312Francisco J. Torres-Rojas2https://orcid.org/0000-0001-7075-3305Instituto Tecnológico de Costa RicaInstituto Tecnológico de Costa RicaInstituto Tecnológico de Costa RicaEl análisis de flujos metabólicos puede proporcionar información importante para una mejor comprensión de la vida y todos sus procesos, beneficiando directamente a áreas como la medicina, la agronomía, la farmacia y otras. Algunas de las principales herramientas utilizadas para estudiar y analizar las rutas metabólicas se han basado en la idea de la comparación de rutas metabólicas, utilizando estructuras de datos como grafos. Algunas de esas tareas se consideran problemas computacionales difíciles. Por otro lado, esas comparaciones aún no han tenido en cuenta el flujo metabólico como parte de la vía o proceso metabólico. Es decir, considerar cuánta cantidad de un metabolito pasa a través de un sistema de reacción con el tiempo. Proponemos aquí una forma simple de comparar rutas metabólicas utilizando su información de flujo relacionada mediante un método simple de comparación de rutas metabólicas introducido en 2017 y ajustándolo a grafos ponderados. Los algoritmos analizan los grafos ponderados asociados de las rutas de flujo metabólico y proporcionan una puntuación rápida de sus similitudes de flujo en primer lugar y una lista de similitudes y diferencias entre las rutas de flujo dadas, enumeradas como rutas. Proporcionamos algunas ideas sobre el análisis a continuación para obtener un buen sistema de puntuación al comparar grafos ponderados relacionados con las rutas metabólicas en un cálculo de bajo costo.https://revistas.tec.ac.cr/index.php/tec_marcha/article/view/5072grafos ponderadosalgoritmo needleman-wunschalineamiento globalalgoritmo smith-watermanalineamiento localrecorrido de grafos |
| spellingShingle | Esteban Arias-Méndez Alonso Montero-Marín Francisco J. Torres-Rojas Propuesta para la comparación de flujos metabólicos Tecnología en Marcha grafos ponderados algoritmo needleman-wunsch alineamiento global algoritmo smith-waterman alineamiento local recorrido de grafos |
| title | Propuesta para la comparación de flujos metabólicos |
| title_full | Propuesta para la comparación de flujos metabólicos |
| title_fullStr | Propuesta para la comparación de flujos metabólicos |
| title_full_unstemmed | Propuesta para la comparación de flujos metabólicos |
| title_short | Propuesta para la comparación de flujos metabólicos |
| title_sort | propuesta para la comparacion de flujos metabolicos |
| topic | grafos ponderados algoritmo needleman-wunsch alineamiento global algoritmo smith-waterman alineamiento local recorrido de grafos |
| url | https://revistas.tec.ac.cr/index.php/tec_marcha/article/view/5072 |
| work_keys_str_mv | AT estebanariasmendez propuestaparalacomparaciondeflujosmetabolicos AT alonsomonteromarin propuestaparalacomparaciondeflujosmetabolicos AT franciscojtorresrojas propuestaparalacomparaciondeflujosmetabolicos |