بررسی نقش احتمالی BAX Inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی
تنش شوری یکی از مهمترین عوامل کاهش عملکرد گیاهان زراعی در سراسر جهان میباشد. مرگ سلولی برنامه ریزی شده نقش مهمی در سازگاری به تنشهای محیطی ایفا میکند. درک مبانی مولکولی مکانیسم این فرآیند، امکان دستورزی ژنتیکی هدفمند گیاهان در جهت تحمل به تنشهای محیطی را فراهم میکند. یک تنظیم کننده کاندید برای...
Main Authors: | , , , |
---|---|
Format: | Article |
Language: | fas |
Published: |
University of Birjand
2020-09-01
|
Series: | تنش های محیطی در علوم زراعی |
Subjects: | |
Online Access: | http://escs.birjand.ac.ir/article_1424_c31ad111dbaa99b1938ab348b0548d2e.pdf |
_version_ | 1797228498578833408 |
---|---|
author | زهرا زینتی عباس عالم زاده علی نیازی اسماعیل ابراهیمی |
author_facet | زهرا زینتی عباس عالم زاده علی نیازی اسماعیل ابراهیمی |
author_sort | زهرا زینتی |
collection | DOAJ |
description | تنش شوری یکی از مهمترین عوامل کاهش عملکرد گیاهان زراعی در سراسر جهان میباشد. مرگ سلولی برنامه ریزی شده نقش مهمی در سازگاری به تنشهای محیطی ایفا میکند. درک مبانی مولکولی مکانیسم این فرآیند، امکان دستورزی ژنتیکی هدفمند گیاهان در جهت تحمل به تنشهای محیطی را فراهم میکند. یک تنظیم کننده کاندید برای چنین مکانیسمی BAX Inhibitor 1 است. در این پژوهش، نقش احتمالی ژن رمز کننده BAX Inhibitor 1-like protein در تحمل به تنش شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی از قبیل آنالیز پروموتر و شبکه تنظیمی ژنی و همچنین بررسی بیان نسبی ژن در شاخساره رقم مقاوم ارگ، رقم حساس الموت و خویشاوند وحشی <em>Aegilops crassa</em> با استفاده از Real-time PCR مورد ارزیابی قرار گرفته است. با توجه به آنالیز شبکه تنظیمی، احتمالاً این ژن در بالادست مسیر پیام رسانی SOS عمل میکند. بر اساس آنالیز پروموتر وجود موتیفهای پاسخ به تنش از جمله موتیفهای ABRE (پاسخ دهنده به آبسزیک اسید)، LTR(پاسخ دهنده به دمای پایین)، MBS (پاسخ دهنده به خشکی)، CGTCA-motif (پاسخ دهنده به متیل جاسمونات)، TGACG-motif (پاسخ دهنده به متیل جاسمونات)، ERE (پاسخ دهنده به اتیلن)، و GT-1 motif (عنصر پاسخ به شوری) تائیدی بر نقش این ژن در تنشهای مختلف محیطی از جمله شوری میباشد. همچنین الگوی بیان ژن مورد مطالعه تحت تنش شوری بین ژنوتیپهای مقاوم و حساس اختلاف معنیداری داشت. در مجموع چنین نتیجهگیری میشود که ژن رمز کننده این پروتئین میتواند در القای تحمل به شوری در گندم نقش داشته باشد و جهت دستورزی ژنتیکی با هدف بهبود تحمل به تنش مورد استفاده قرار گیرد. |
first_indexed | 2024-04-24T14:57:39Z |
format | Article |
id | doaj.art-51142cf72a5e420b9b1ebda18b79725e |
institution | Directory Open Access Journal |
issn | 2228-7604 2383-3084 |
language | fas |
last_indexed | 2024-04-24T14:57:39Z |
publishDate | 2020-09-01 |
publisher | University of Birjand |
record_format | Article |
series | تنش های محیطی در علوم زراعی |
spelling | doaj.art-51142cf72a5e420b9b1ebda18b79725e2024-04-02T17:52:45ZfasUniversity of Birjandتنش های محیطی در علوم زراعی2228-76042383-30842020-09-0113391592410.22077/escs.2020.2225.15711424بررسی نقش احتمالی BAX Inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهیزهرا زینتی0عباس عالم زاده1علی نیازی2اسماعیل ابراهیمی3استادیار بخش اگرواکولوژی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دارابدانشیار بخش زراعت و اصلاح نبات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیرازاستاد مرکز بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیرازاستاد مرکز بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیرازتنش شوری یکی از مهمترین عوامل کاهش عملکرد گیاهان زراعی در سراسر جهان میباشد. مرگ سلولی برنامه ریزی شده نقش مهمی در سازگاری به تنشهای محیطی ایفا میکند. درک مبانی مولکولی مکانیسم این فرآیند، امکان دستورزی ژنتیکی هدفمند گیاهان در جهت تحمل به تنشهای محیطی را فراهم میکند. یک تنظیم کننده کاندید برای چنین مکانیسمی BAX Inhibitor 1 است. در این پژوهش، نقش احتمالی ژن رمز کننده BAX Inhibitor 1-like protein در تحمل به تنش شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی از قبیل آنالیز پروموتر و شبکه تنظیمی ژنی و همچنین بررسی بیان نسبی ژن در شاخساره رقم مقاوم ارگ، رقم حساس الموت و خویشاوند وحشی <em>Aegilops crassa</em> با استفاده از Real-time PCR مورد ارزیابی قرار گرفته است. با توجه به آنالیز شبکه تنظیمی، احتمالاً این ژن در بالادست مسیر پیام رسانی SOS عمل میکند. بر اساس آنالیز پروموتر وجود موتیفهای پاسخ به تنش از جمله موتیفهای ABRE (پاسخ دهنده به آبسزیک اسید)، LTR(پاسخ دهنده به دمای پایین)، MBS (پاسخ دهنده به خشکی)، CGTCA-motif (پاسخ دهنده به متیل جاسمونات)، TGACG-motif (پاسخ دهنده به متیل جاسمونات)، ERE (پاسخ دهنده به اتیلن)، و GT-1 motif (عنصر پاسخ به شوری) تائیدی بر نقش این ژن در تنشهای مختلف محیطی از جمله شوری میباشد. همچنین الگوی بیان ژن مورد مطالعه تحت تنش شوری بین ژنوتیپهای مقاوم و حساس اختلاف معنیداری داشت. در مجموع چنین نتیجهگیری میشود که ژن رمز کننده این پروتئین میتواند در القای تحمل به شوری در گندم نقش داشته باشد و جهت دستورزی ژنتیکی با هدف بهبود تحمل به تنش مورد استفاده قرار گیرد.http://escs.birjand.ac.ir/article_1424_c31ad111dbaa99b1938ab348b0548d2e.pdfپروموترتنش شوریشبکه تنظیمیگندمbax inhibitor 1-like protein |
spellingShingle | زهرا زینتی عباس عالم زاده علی نیازی اسماعیل ابراهیمی بررسی نقش احتمالی BAX Inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی تنش های محیطی در علوم زراعی پروموتر تنش شوری شبکه تنظیمی گندم bax inhibitor 1-like protein |
title | بررسی نقش احتمالی BAX Inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی |
title_full | بررسی نقش احتمالی BAX Inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی |
title_fullStr | بررسی نقش احتمالی BAX Inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی |
title_full_unstemmed | بررسی نقش احتمالی BAX Inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی |
title_short | بررسی نقش احتمالی BAX Inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی |
title_sort | بررسی نقش احتمالی bax inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی |
topic | پروموتر تنش شوری شبکه تنظیمی گندم bax inhibitor 1-like protein |
url | http://escs.birjand.ac.ir/article_1424_c31ad111dbaa99b1938ab348b0548d2e.pdf |
work_keys_str_mv | AT zhrạzynty brrsynqsẖạḥtmạlybaxinhibitor1drtḥmlbhsẖwrybạạstfạdhạzạbzạrhạybywạnfwrmạtyḵywậzmạysẖgạhy AT ʿbạsʿạlmzạdh brrsynqsẖạḥtmạlybaxinhibitor1drtḥmlbhsẖwrybạạstfạdhạzạbzạrhạybywạnfwrmạtyḵywậzmạysẖgạhy AT ʿlynyạzy brrsynqsẖạḥtmạlybaxinhibitor1drtḥmlbhsẖwrybạạstfạdhạzạbzạrhạybywạnfwrmạtyḵywậzmạysẖgạhy AT ạsmạʿylạbrạhymy brrsynqsẖạḥtmạlybaxinhibitor1drtḥmlbhsẖwrybạạstfạdhạzạbzạrhạybywạnfwrmạtyḵywậzmạysẖgạhy |