بررسی نقش احتمالی BAX Inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی

تنش شوری یکی از مهمترین عوامل کاهش عملکرد گیاهان زراعی در سراسر جهان می‌باشد. مرگ سلولی برنامه ریزی شده نقش مهمی در سازگاری به تنش‌های محیطی ایفا می‌کند. درک مبانی مولکولی مکانیسم این فرآیند، امکان دستورزی ژنتیکی هدفمند گیاهان در جهت تحمل به تنش‌های محیطی را فراهم می‌کند. یک تنظیم کننده کاندید برای...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: زهرا زینتی, عباس عالم زاده, علی نیازی, اسماعیل ابراهیمی
Format: Article
Language:fas
Published: University of Birjand 2020-09-01
Series:تنش های محیطی در علوم زراعی
Subjects:
Online Access:http://escs.birjand.ac.ir/article_1424_c31ad111dbaa99b1938ab348b0548d2e.pdf
_version_ 1797228498578833408
author زهرا زینتی
عباس عالم زاده
علی نیازی
اسماعیل ابراهیمی
author_facet زهرا زینتی
عباس عالم زاده
علی نیازی
اسماعیل ابراهیمی
author_sort زهرا زینتی
collection DOAJ
description تنش شوری یکی از مهمترین عوامل کاهش عملکرد گیاهان زراعی در سراسر جهان می‌باشد. مرگ سلولی برنامه ریزی شده نقش مهمی در سازگاری به تنش‌های محیطی ایفا می‌کند. درک مبانی مولکولی مکانیسم این فرآیند، امکان دستورزی ژنتیکی هدفمند گیاهان در جهت تحمل به تنش‌های محیطی را فراهم می‌کند. یک تنظیم کننده کاندید برای چنین مکانیسمی BAX Inhibitor 1 است. در این پژوهش، نقش احتمالی ژن رمز کننده BAX Inhibitor 1-like protein در تحمل به تنش شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی از قبیل آنالیز پروموتر و شبکه تنظیمی ژنی و همچنین بررسی بیان نسبی ژن در شاخساره رقم مقاوم ارگ، رقم حساس الموت و خویشاوند وحشی <em>Aegilops crassa</em> با استفاده از Real-time PCR مورد ارزیابی قرار گرفته است. با توجه به آنالیز شبکه تنظیمی، احتمالاً این ژن در بالادست مسیر پیام رسانی SOS عمل می‌کند. بر اساس آنالیز پروموتر وجود موتیف‌های پاسخ به تنش از جمله موتیف‌های ABRE (پاسخ دهنده به آبسزیک اسید)، LTR(پاسخ دهنده به دمای پایین)، MBS (پاسخ دهنده به خشکی)، CGTCA-motif (پاسخ دهنده به متیل جاسمونات)، TGACG-motif (پاسخ دهنده به متیل جاسمونات)، ERE (پاسخ دهنده به اتیلن)، و GT-1 motif (عنصر پاسخ به شوری) تائیدی بر نقش این ژن در تنش‌های مختلف محیطی از جمله شوری می‌باشد. همچنین الگوی بیان ژن مورد مطالعه تحت تنش شوری بین ژنوتیپ‌های مقاوم و حساس اختلاف معنی‌داری داشت. در مجموع چنین نتیجه‌گیری می‌شود که ژن رمز کننده این پروتئین می‌تواند در القای تحمل به شوری در گندم نقش داشته باشد و جهت دستورزی ژنتیکی با هدف بهبود تحمل به تنش مورد استفاده قرار گیرد.
first_indexed 2024-04-24T14:57:39Z
format Article
id doaj.art-51142cf72a5e420b9b1ebda18b79725e
institution Directory Open Access Journal
issn 2228-7604
2383-3084
language fas
last_indexed 2024-04-24T14:57:39Z
publishDate 2020-09-01
publisher University of Birjand
record_format Article
series تنش های محیطی در علوم زراعی
spelling doaj.art-51142cf72a5e420b9b1ebda18b79725e2024-04-02T17:52:45ZfasUniversity of Birjandتنش های محیطی در علوم زراعی2228-76042383-30842020-09-0113391592410.22077/escs.2020.2225.15711424بررسی نقش احتمالی BAX Inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهیزهرا زینتی0عباس عالم زاده1علی نیازی2اسماعیل ابراهیمی3استادیار بخش اگرواکولوژی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دارابدانشیار بخش زراعت و اصلاح نبات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیرازاستاد مرکز بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیرازاستاد مرکز بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیرازتنش شوری یکی از مهمترین عوامل کاهش عملکرد گیاهان زراعی در سراسر جهان می‌باشد. مرگ سلولی برنامه ریزی شده نقش مهمی در سازگاری به تنش‌های محیطی ایفا می‌کند. درک مبانی مولکولی مکانیسم این فرآیند، امکان دستورزی ژنتیکی هدفمند گیاهان در جهت تحمل به تنش‌های محیطی را فراهم می‌کند. یک تنظیم کننده کاندید برای چنین مکانیسمی BAX Inhibitor 1 است. در این پژوهش، نقش احتمالی ژن رمز کننده BAX Inhibitor 1-like protein در تحمل به تنش شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی از قبیل آنالیز پروموتر و شبکه تنظیمی ژنی و همچنین بررسی بیان نسبی ژن در شاخساره رقم مقاوم ارگ، رقم حساس الموت و خویشاوند وحشی <em>Aegilops crassa</em> با استفاده از Real-time PCR مورد ارزیابی قرار گرفته است. با توجه به آنالیز شبکه تنظیمی، احتمالاً این ژن در بالادست مسیر پیام رسانی SOS عمل می‌کند. بر اساس آنالیز پروموتر وجود موتیف‌های پاسخ به تنش از جمله موتیف‌های ABRE (پاسخ دهنده به آبسزیک اسید)، LTR(پاسخ دهنده به دمای پایین)، MBS (پاسخ دهنده به خشکی)، CGTCA-motif (پاسخ دهنده به متیل جاسمونات)، TGACG-motif (پاسخ دهنده به متیل جاسمونات)، ERE (پاسخ دهنده به اتیلن)، و GT-1 motif (عنصر پاسخ به شوری) تائیدی بر نقش این ژن در تنش‌های مختلف محیطی از جمله شوری می‌باشد. همچنین الگوی بیان ژن مورد مطالعه تحت تنش شوری بین ژنوتیپ‌های مقاوم و حساس اختلاف معنی‌داری داشت. در مجموع چنین نتیجه‌گیری می‌شود که ژن رمز کننده این پروتئین می‌تواند در القای تحمل به شوری در گندم نقش داشته باشد و جهت دستورزی ژنتیکی با هدف بهبود تحمل به تنش مورد استفاده قرار گیرد.http://escs.birjand.ac.ir/article_1424_c31ad111dbaa99b1938ab348b0548d2e.pdfپروموترتنش شوریشبکه تنظیمیگندمbax inhibitor 1-like protein
spellingShingle زهرا زینتی
عباس عالم زاده
علی نیازی
اسماعیل ابراهیمی
بررسی نقش احتمالی BAX Inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی
تنش های محیطی در علوم زراعی
پروموتر
تنش شوری
شبکه تنظیمی
گندم
bax inhibitor 1-like protein
title بررسی نقش احتمالی BAX Inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی
title_full بررسی نقش احتمالی BAX Inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی
title_fullStr بررسی نقش احتمالی BAX Inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی
title_full_unstemmed بررسی نقش احتمالی BAX Inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی
title_short بررسی نقش احتمالی BAX Inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی
title_sort بررسی نقش احتمالی bax inhibitor 1 در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی
topic پروموتر
تنش شوری
شبکه تنظیمی
گندم
bax inhibitor 1-like protein
url http://escs.birjand.ac.ir/article_1424_c31ad111dbaa99b1938ab348b0548d2e.pdf
work_keys_str_mv AT zhrạzynty brrsynqsẖạḥtmạlybaxinhibitor1drtḥmlbhsẖwrybạạstfạdhạzạbzạrhạybywạnfwrmạtyḵywậzmạysẖgạhy
AT ʿbạsʿạlmzạdh brrsynqsẖạḥtmạlybaxinhibitor1drtḥmlbhsẖwrybạạstfạdhạzạbzạrhạybywạnfwrmạtyḵywậzmạysẖgạhy
AT ʿlynyạzy brrsynqsẖạḥtmạlybaxinhibitor1drtḥmlbhsẖwrybạạstfạdhạzạbzạrhạybywạnfwrmạtyḵywậzmạysẖgạhy
AT ạsmạʿylạbrạhymy brrsynqsẖạḥtmạlybaxinhibitor1drtḥmlbhsẖwrybạạstfạdhạzạbzạrhạybywạnfwrmạtyḵywậzmạysẖgạhy