Coinfección natural de virus de ARN en cultivos de papa (<i>Solanum tuberosum</i> subsp. Andigena) en Antioquia (Colombia)
Las enfermedades virales son uno de los principales problemas fitopatológicos de la papa. Con el fin de determinar los virus más prevalentes en cultivos de papa var. Diacol Capiro en el oriente Antioqueño (Colombia), se evaluó mediante RT-qPCR la presencia de diez virus de ARN (PVY, PVA, PVV, TaLMV,...
| Main Authors: | , , , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Universidad Nacional de Colombia
2019-09-01
|
| Series: | Acta Biológica Colombiana |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol/article/view/79277 |
| _version_ | 1818789631567593472 |
|---|---|
| author | Yuliana Marcela Gallo García Andrea Sierra Mejía Livia Donaire Segarra Miguel Aranda Pablo Andres Gutiérrez Sánchez Mauricio Marín Montoya |
| author_facet | Yuliana Marcela Gallo García Andrea Sierra Mejía Livia Donaire Segarra Miguel Aranda Pablo Andres Gutiérrez Sánchez Mauricio Marín Montoya |
| author_sort | Yuliana Marcela Gallo García |
| collection | DOAJ |
| description | Las enfermedades virales son uno de los principales problemas fitopatológicos de la papa. Con el fin de determinar los virus más prevalentes en cultivos de papa var. Diacol Capiro en el oriente Antioqueño (Colombia), se evaluó mediante RT-qPCR la presencia de diez virus de ARN (PVY, PVA, PVV, TaLMV, PVS, PLRV, PYVV, PVX, ToRSV y PMTV) en 36 muestras de tejido foliar. Los resultados indicaron la ocurrencia de cinco de los diez virus evaluados, con niveles de prevalencia de 88,9 %, 75 %, 75 %, 41,7 % y 25 % para PVY, PVX, PYVV, PLRV y PVS, respectivamente. Con fines comparativos, cuatro virus también se evaluaron mediante ELISA, siendo detectados PVS (80,5 %), PVY (55 %) y PLRV (5,5 %); mientras que PVX no fue encontrado con esta prueba. La comparación de estas técnicas mediante la razón de prevalencia (RP), indicó que la RT-qPCR ofrece niveles superiores de detección con valores de RP = 1,6 y RP = 7,5 para los virus PVY y PLRV; mientras que para PVS la ELISA detectó más muestras positivas que RT-qPCR (RP = 3,22), evidenciándose la necesidad de diseñar nuevos cebadores ajustados a la diversidad de este virus en Antioquia. La coinfección mixta más frecuente fue PVY-PYVV-PVX (22,2 %), mientras que los cinco virus se encontraron en el 11,1 % de las muestras. Finalmente, utilizando secuenciación Sanger de la cápside y NGS para los genomas completos, se confirmó la circulación de todos los virus detectados en los cultivos de papa del oriente Antioqueño. Estos resultados señalan la necesidad de fortalecer los programas de manejo integrado de enfermedades virales en Antioquia. |
| first_indexed | 2024-12-18T14:42:38Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-546adec51da1441585c05c116c6a12c3 |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 0120-548X 1900-1649 |
| language | English |
| last_indexed | 2024-12-18T14:42:38Z |
| publishDate | 2019-09-01 |
| publisher | Universidad Nacional de Colombia |
| record_format | Article |
| series | Acta Biológica Colombiana |
| spelling | doaj.art-546adec51da1441585c05c116c6a12c32022-12-21T21:04:21ZengUniversidad Nacional de ColombiaActa Biológica Colombiana0120-548X1900-16492019-09-0124310.15446/abc.v24n3.7927751546Coinfección natural de virus de ARN en cultivos de papa (<i>Solanum tuberosum</i> subsp. Andigena) en Antioquia (Colombia)Yuliana Marcela Gallo García0Andrea Sierra Mejía1Livia Donaire Segarra2Miguel Aranda3Pablo Andres Gutiérrez Sánchez4Mauricio Marín Montoya5Universidad CES - Facultad de MedicinaUniversidad Nacional de Colombia - Sede Medellín - Facultad de Ciencias - Laboratorio de Microbiología IndustrialCentro de Edafología y Biología Aplicada del Segura (CEBAS)-CSIC - Grupo de Patología VegetalCentro de Edafología y Biología Aplicada del Segura (CEBAS)-CSIC - Grupo de Patología VegetalUniversidad Nacional de Colombia - Sede Medellín - Facultad de Ciencias - Laboratorio de Microbiología IndustrialUniversidad Nacional de Colombia - Sede Medellín - Facultad de Ciencias - Laboratorio de Biología Celular y MolecularLas enfermedades virales son uno de los principales problemas fitopatológicos de la papa. Con el fin de determinar los virus más prevalentes en cultivos de papa var. Diacol Capiro en el oriente Antioqueño (Colombia), se evaluó mediante RT-qPCR la presencia de diez virus de ARN (PVY, PVA, PVV, TaLMV, PVS, PLRV, PYVV, PVX, ToRSV y PMTV) en 36 muestras de tejido foliar. Los resultados indicaron la ocurrencia de cinco de los diez virus evaluados, con niveles de prevalencia de 88,9 %, 75 %, 75 %, 41,7 % y 25 % para PVY, PVX, PYVV, PLRV y PVS, respectivamente. Con fines comparativos, cuatro virus también se evaluaron mediante ELISA, siendo detectados PVS (80,5 %), PVY (55 %) y PLRV (5,5 %); mientras que PVX no fue encontrado con esta prueba. La comparación de estas técnicas mediante la razón de prevalencia (RP), indicó que la RT-qPCR ofrece niveles superiores de detección con valores de RP = 1,6 y RP = 7,5 para los virus PVY y PLRV; mientras que para PVS la ELISA detectó más muestras positivas que RT-qPCR (RP = 3,22), evidenciándose la necesidad de diseñar nuevos cebadores ajustados a la diversidad de este virus en Antioquia. La coinfección mixta más frecuente fue PVY-PYVV-PVX (22,2 %), mientras que los cinco virus se encontraron en el 11,1 % de las muestras. Finalmente, utilizando secuenciación Sanger de la cápside y NGS para los genomas completos, se confirmó la circulación de todos los virus detectados en los cultivos de papa del oriente Antioqueño. Estos resultados señalan la necesidad de fortalecer los programas de manejo integrado de enfermedades virales en Antioquia.https://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol/article/view/79277ELISART-qPCRSecuenciación de nueva generación (NGS)SolanaceaeVirus de ARN |
| spellingShingle | Yuliana Marcela Gallo García Andrea Sierra Mejía Livia Donaire Segarra Miguel Aranda Pablo Andres Gutiérrez Sánchez Mauricio Marín Montoya Coinfección natural de virus de ARN en cultivos de papa (<i>Solanum tuberosum</i> subsp. Andigena) en Antioquia (Colombia) Acta Biológica Colombiana ELISA RT-qPCR Secuenciación de nueva generación (NGS) Solanaceae Virus de ARN |
| title | Coinfección natural de virus de ARN en cultivos de papa (<i>Solanum tuberosum</i> subsp. Andigena) en Antioquia (Colombia) |
| title_full | Coinfección natural de virus de ARN en cultivos de papa (<i>Solanum tuberosum</i> subsp. Andigena) en Antioquia (Colombia) |
| title_fullStr | Coinfección natural de virus de ARN en cultivos de papa (<i>Solanum tuberosum</i> subsp. Andigena) en Antioquia (Colombia) |
| title_full_unstemmed | Coinfección natural de virus de ARN en cultivos de papa (<i>Solanum tuberosum</i> subsp. Andigena) en Antioquia (Colombia) |
| title_short | Coinfección natural de virus de ARN en cultivos de papa (<i>Solanum tuberosum</i> subsp. Andigena) en Antioquia (Colombia) |
| title_sort | coinfeccion natural de virus de arn en cultivos de papa i solanum tuberosum i subsp andigena en antioquia colombia |
| topic | ELISA RT-qPCR Secuenciación de nueva generación (NGS) Solanaceae Virus de ARN |
| url | https://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol/article/view/79277 |
| work_keys_str_mv | AT yulianamarcelagallogarcia coinfeccionnaturaldevirusdearnencultivosdepapaisolanumtuberosumisubspandigenaenantioquiacolombia AT andreasierramejia coinfeccionnaturaldevirusdearnencultivosdepapaisolanumtuberosumisubspandigenaenantioquiacolombia AT liviadonairesegarra coinfeccionnaturaldevirusdearnencultivosdepapaisolanumtuberosumisubspandigenaenantioquiacolombia AT miguelaranda coinfeccionnaturaldevirusdearnencultivosdepapaisolanumtuberosumisubspandigenaenantioquiacolombia AT pabloandresgutierrezsanchez coinfeccionnaturaldevirusdearnencultivosdepapaisolanumtuberosumisubspandigenaenantioquiacolombia AT mauriciomarinmontoya coinfeccionnaturaldevirusdearnencultivosdepapaisolanumtuberosumisubspandigenaenantioquiacolombia |