Cooking small and large portions of “biodiversity‐soup”: Miniaturized DNA metabarcoding PCRs perform as good as large‐volume PCRs

Cooking small and large portions of “biodiversity‐soup”: Miniaturized DNA metabarcoding PCRs perform as good as large‐volume PCRs

Abstract DNA metabarcoding is a powerful tool to assess arthropod diversity in environmental bulk samples such as Malaise trap, pitfall trap, or hand net samples. While comparative performance tests for different extraction protocols, primers, and Taq polymerases have been made, the effect of differ...

সম্পূর্ণ বিবরণ

গ্রন্থ-পঞ্জীর বিবরন
প্রধান লেখক:	Dominik Buchner, Arne J. Beermann, Florian Leese, Martina Weiss
বিন্যাস:	প্রবন্ধ
ভাষা:	English
প্রকাশিত:	Wiley 2021-07-01
মালা:	Ecology and Evolution
বিষয়গুলি:	amplicon sequencing biomonitoring bulk sample Malaise trap PCR bias
অনলাইন ব্যবহার করুন:	https://doi.org/10.1002/ece3.7753

অনুরূপ উপাদানগুলি

Maximizing Identification Precision of Hymenoptera and Brachycera (Diptera) With a Non‐Destructive DNA Metabarcoding Approach
অনুযায়ী: Isabel C. Kilian, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2025-01-01)

Is it worth the extra mile? Comparing environmental DNA and RNA metabarcoding for vertebrate and invertebrate biodiversity surveys in a lowland stream
অনুযায়ী: Till-Hendrik Macher, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2024-10-01)

Persisting roadblocks in arthropod monitoring using non-destructive metabarcoding from collection media of passive traps
অনুযায়ী: Lucas Sire, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2023-10-01)

Enhancement of PCRs by Partial Restriction Digestion of Genomic Templates
অনুযায়ী: Raymond Vázquez, অন্যান্য
প্রকাশিত: (1999-01-01)

PCRS: Personalized Career-Path Recommender System for Engineering Students
অনুযায়ী: Manar Qamhieh, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2020-01-01)

Using Malaise Traps and Metabarcoding for Biodiversity Assessment in Vineyards: Effects of Weather and Trapping Effort
অনুযায়ী: Marvin Kaczmarek, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2022-05-01)

It's raining species: Rainwash eDNA metabarcoding as a minimally invasive method to assess tree canopy invertebrate diversity
অনুযায়ী: Till‐Hendrik Macher, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2023-01-01)

Exploring the utility of bioaerosol metagenomics compared to PCRs for swine pathogen surveillance
অনুযায়ী: Adrian Muwonge, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2024-10-01)

Characterizing Crustose Lichen Communities—DNA Metabarcoding Reveals More than Meets the Eye
অনুযায়ী: Jacob R. Henrie, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2022-09-01)

Characterizing parasitic nematode faunas in faeces and soil using DNA metabarcoding
অনুযায়ী: Marie Louise Davey, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2021-08-01)

Allele-Specific Dual PCRs to Identify Members of the 27a Cluster of PPV
অনুযায়ী: Vivien Tamás, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2022-07-01)

High-throughput multiplex qPCRs for the surveillance of zoonotic species of canine hookworms.
অনুযায়ী: Luca Massetti, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2020-06-01)

Ethanol eDNA Reveals Unique Community Composition of Aquatic Macroinvertebrates Compared to Bulk Tissue Metabarcoding in a Biomonitoring Sampling Scheme
অনুযায়ী: Sadhna Fiona Persaud, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2021-01-01)

Long PCRs of Transposons in the Structural Analysis of Genes Encoding Acquired Glycopeptide Resistance in Enterococci
অনুযায়ী: H. Haaheim, অন্যান্য
প্রকাশিত: (1998-03-01)

Development of two multiplex PCRs for microsatellite analysis in Alpine chamois (Rupicapra r. rupicapra)
অনুযায়ী: P. Sacchi, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2010-01-01)

The Phylogeny, Biodiversity, and Ecology of the Chloroflexi in Activated Sludge
অনুযায়ী: Lachlan B. M. Speirs, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2019-09-01)

Comparison of Pan-Lyssavirus RT-PCRs and Development of an Improved Protocol for Surveillance of Non-RABV Lyssaviruses
অনুযায়ী: Petra Drzewnioková, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2023-03-01)

Prevalence and detection of Tropheryma whipplei in the stools of Korean patients with diarrhea using real-time PCRs
অনুযায়ী: Sumi Yoon, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2022-12-01)

Outpatient palliative care referral system (PCRS) for patients with advanced cancer: an impact evaluation protocol
অনুযায়ী: Filippo de Braud, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2022-10-01)

Adjuvant immunotherapy in resected esophageal squamous cell carcinoma: a gospel to the non-pCRs
অনুযায়ী: Zhihui Zhang, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2021-08-01)

Biodiversity assessment of tropical shelf eukaryotic communities via pelagic eDNA metabarcoding
অনুযায়ী: Judith Bakker, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2019-12-01)

PERFORMANCE OF CONVENTIONAL PCRs BASED ON PRIMERS DIRECTED TO NUCLEAR AND MITOCHONDRIAL GENES FOR THE DETECTION AND IDENTIFICATION OF Leishmania spp.
অনুযায়ী: Estela Gallucci LOPES, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2016-01-01)

Novel High-Throughput Multiplex qPCRs for the Detection of Canine Vector-Borne Pathogens in the Asia-Pacific
অনুযায়ী: Lucas Huggins, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2021-05-01)

New Real-Time PCRs to Differentiate <i>Rickettsia</i> spp. and <i>Rickettsia conorii</i>
অনুযায়ী: Valeria Blanda, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2020-09-01)

Comparative Evaluation of Three Commercial Quantitative Real-Time PCRs Used in Japan for Bovine Leukemia Virus
অনুযায়ী: Syuji Yoneyama, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2022-05-01)

Brazilian Portuguese version of the Patient Competency Rating Scale (PCRS-R-BR): semantic adaptation and validity
অনুযায়ী: Nicolle Zimmermann, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2014-03-01)

Fruticose Lichen Communities at the Edge: Distribution and Diversity in a Desert Sky Island on the Colorado Plateau
অনুযায়ী: Abigail Robison, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2022-09-01)

mbctools: A User-Friendly Metabarcoding and Cross-Platform Pipeline for Analyzing Multiple Amplicon Sequencing Data across a Large Diversity of Organisms
অনুযায়ী: Barnabé, Christian, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2024-12-01)

Navigating diversity: primer impact on arthropod recovery in molecular environmental monitoring in tropical Amazon
অনুযায়ী: Fernanda Valente Penner, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2024-12-01)

Home is where the hollow is: Revealing vertebrate tree hollow user biodiversity with eDNA metabarcoding
অনুযায়ী: Joshua P. Newton, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2022-09-01)

Diatom metabarcoding as a tool to assess the water quality of two large tributaries of the Danube River
অনুযায়ী: Danijela Vidaković, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2024-11-01)

Optimizing insect metabarcoding using replicated mock communities
অনুযায়ী: Elzbieta Iwaszkiewicz‐Eggebrecht, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2023-04-01)

Fauna de Alticini (Newman) (Coleoptera, Chrysomelidae, Galerucinae) em diferentes estágios sucessionais na Floresta com Araucária do Paraná, Brasil: diversidade e estimativa de riqueza de espécies Alticini (Newman) (Coleoptera, Chrysomelidae, Galerucinae) fauna in different successional stages in an Araucaria Forest of Paraná, Brazil: diversity and estimation of species richness
অনুযায়ী: Adelita Maria Linzmeier, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2006-03-01)

Percevejos (Hemiptera: Heteroptera) em plantio de Eucalyptus urophylla e Floresta Estacional Semidecidual Montana no Estado da Bahia
অনুযায়ী: Ângela Neves Azevêdo, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2022-08-01)

Detection of non-pathogenic and pathogenic populations of Vibrio parahaemolyticus in various samples by the conventional, quantitative and droplet digital PCRs
অনুযায়ী: Sinisa Vidovic, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2024-02-01)

Comparative Assessment of In-House Real-Time PCRs Targeting Enteric Disease-Associated Microsporidia in Human Stool Samples
অনুযায়ী: Konstantin Tanida, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2021-05-01)

COMPARAÇÃO DA SENSIBILIDADE DE DIFERENTES PCRS PARA A DETECÇÃO DO DNA DE BARTONELLA HENSELAE
অনুযায়ী: Marina Rovani Drummond, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2023-10-01)

Multiplex real-time PCRs for detection of Salmonella, Listeria monocytogenes, and verotoxigenic Escherichia coli in carcasses of slaughtered animals
অনুযায়ী: Denis Edyta, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2016-09-01)

Development of O-antigen gene cluster-specific PCRs for rapid typing six epidemic serogroups of <it>Leptospira </it>in China
অনুযায়ী: Qin Jin-Hong, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2010-03-01)

Robber flies and hover flies (Insecta, Diptera, Asilidae and Syrphidae) in beech forests of the central Apennines: a contribution to the inventory of insect biodiversity in Italian State Nature Reserves
অনুযায়ী: Alice Lenzi, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2023-05-01)