Representing true plant genomes: haplotype-resolved hybrid pepper genome with trio-binning
As sequencing costs decrease and availability of high fidelity long-read sequencing increases, generating experiment specific de novo genome assemblies becomes feasible. In many crop species, obtaining the genome of a hybrid or heterozygous individual is necessary for systems that do not tolerate in...
Автори: | Emily E. Delorean, Ramey C. Youngblood, Sheron A. Simpson, Ashley N. Schoonmaker, Brian E. Scheffler, William B. Rutter, Amanda M. Hulse-Kemp |
---|---|
Формат: | Стаття |
Мова: | English |
Опубліковано: |
Frontiers Media S.A.
2023-11-01
|
Серія: | Frontiers in Plant Science |
Предмети: | |
Онлайн доступ: | https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2023.1184112/full |
Схожі ресурси
Схожі ресурси
-
Chromosome-Scale, Haplotype-Resolved Genome Assembly of Suaeda Glauca
за авторством: Liuxi Yi, та інші
Опубліковано: (2022-05-01) -
Metagenomic binning of PacBio HiFi data prior to assembly reveals a complete genome of Cosmopolites sordidus (Germar) (Coleopterea: Curculionidae, Dryophthorinae) the most damaging arthropod pest of bananas and plantains
за авторством: Alfredo Rodriguez Ruiz, та інші
Опубліковано: (2023-11-01) -
Haplotype-resolved assembly of auto-polyploid genomes via combining Hi-C and gametic data
за авторством: Xiaohui Zhang, та інші
Опубліковано: (2024-04-01) -
trioPhaser: using Mendelian inheritance logic to improve genomic phasing of trios
за авторством: Dustin B. Miller, та інші
Опубліковано: (2021-11-01) -
Haplotype-resolved Chinese male genome assembly based on high-fidelity sequencing
за авторством: Xiaofei Yang, та інші
Опубліковано: (2022-11-01)