شناسایی ژنهای متفاوت بیان شده در جوجه‌های آلوده به ویروس H5N1 با استفاده از فراتحلیل داده‌های ریزآرایه DNA
پیدا کردن نیم‌رخ بیان ژنی در طول سالهای اخیر، منجر به شناسایی ژنهای خاص در پاسخ به بیماریهای گوناگون شدهاست. یکی از این بیماریهای مهم در صنعت طیور، بیماری آنفولانزا است. هدف از پژوهش حاضر، شناسایی ژنهای موثر در بروز آنفولانزای ناشی از ویروس H5N1 با استفاده از فراتحلیل دو مجموعه داده ریزآرایه...
| Main Authors: | , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | fas |
| Published: |
University of Guilan
2018-11-01
|
| Series: | تحقیقات تولیدات دامی |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://ar.guilan.ac.ir/article_3180_7035ac218cc333a5bda72fa1bb51cb0e.pdf |
| _version_ | 1828345681204477952 |
|---|---|
| author | مونا صالحی نسب قدرت الله رحیمی میانجی اسماعیل ابراهیمی سید علی غفوری |
| author_facet | مونا صالحی نسب قدرت الله رحیمی میانجی اسماعیل ابراهیمی سید علی غفوری |
| author_sort | مونا صالحی نسب |
| collection | DOAJ |
| description | پیدا کردن نیم‌رخ بیان ژنی در طول سالهای اخیر، منجر به شناسایی ژنهای خاص در پاسخ به بیماریهای گوناگون شدهاست. یکی از این بیماریهای مهم در صنعت طیور، بیماری آنفولانزا است. هدف از پژوهش حاضر، شناسایی ژنهای موثر در بروز آنفولانزای ناشی از ویروس H5N1 با استفاده از فراتحلیل دو مجموعه داده ریزآرایه DNA که بیان ژنهای میزبان در پاسخ به آنفولانزا را مورد بررسی قرار داده بودند، بود. فراتحلیل نشان داد که ژنهای <em>STK17B</em>، <em>CCL4</em>، <em>MCM9</em>، <em>IRF7</em> و <em>IL6</em> با روشهای Fisher، AW و maxP متمایز بیان می‌شوند. برای تایید تمایز بیان ژنهای شناسایی شده در آزمایشگاه از Real-time PCR استفاده شد. بدین منظور از نمونههایی استفاده شد که پیشتر با ویروس H5N1 چالش داده شده بودند. نتایج برای هر پنج ژن انتخابی، تمایز بیان آنها را در حالت مواجهه با آلودگی و حتی جهت تنظیمی بیان را که در فراتحلیل مشاهده شده بود، در سطوح معنیدار تایید نمود، به گونهای که ژنهای <em>IL6</em>، <em>IRF7</em> و <em>CCL4</em> افزایش بیان و ژنهای <em>STK17B</em> و <em>MCM9</em> کاهش بیان نشان دادند. این نتایج پیشنهاد میدهند فراتحلیل روشی بسیار قوی در شناسایی ژنهایی است که ممکن است در پژوهشهای انفرادی مورد توجه قرار نگیرند. این ژنها ممکن است نقش حیاتی در تنظیم پاسخ میزبان ایفا نمایند. |
| first_indexed | 2024-04-14T00:15:01Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-597b88c1e09e448ea0181ee2eac72576 |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 2252-0872 2538-6107 |
| language | fas |
| last_indexed | 2024-04-14T00:15:01Z |
| publishDate | 2018-11-01 |
| publisher | University of Guilan |
| record_format | Article |
| series | تحقیقات تولیدات دامی |
| spelling | doaj.art-597b88c1e09e448ea0181ee2eac725762022-12-22T02:23:09ZfasUniversity of Guilanتحقیقات تولیدات دامی2252-08722538-61072018-11-0173132310.22124/ar.2018.9622.12833180شناسایی ژنهای متفاوت بیان شده در جوجه‌های آلوده به ویروس H5N1 با استفاده از فراتحلیل داده‌های ریزآرایه DNAمونا صالحی نسب0قدرت الله رحیمی میانجی1اسماعیل ابراهیمی2سید علی غفوری3دانشجوی دکتری دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساریاستاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساریدانشیار پژوهشکده بیوتکنولوژی دانشگاه شیرازاستادیار سازمان دامپزشکی ایرانپیدا کردن نیم‌رخ بیان ژنی در طول سالهای اخیر، منجر به شناسایی ژنهای خاص در پاسخ به بیماریهای گوناگون شدهاست. یکی از این بیماریهای مهم در صنعت طیور، بیماری آنفولانزا است. هدف از پژوهش حاضر، شناسایی ژنهای موثر در بروز آنفولانزای ناشی از ویروس H5N1 با استفاده از فراتحلیل دو مجموعه داده ریزآرایه DNA که بیان ژنهای میزبان در پاسخ به آنفولانزا را مورد بررسی قرار داده بودند، بود. فراتحلیل نشان داد که ژنهای <em>STK17B</em>، <em>CCL4</em>، <em>MCM9</em>، <em>IRF7</em> و <em>IL6</em> با روشهای Fisher، AW و maxP متمایز بیان می‌شوند. برای تایید تمایز بیان ژنهای شناسایی شده در آزمایشگاه از Real-time PCR استفاده شد. بدین منظور از نمونههایی استفاده شد که پیشتر با ویروس H5N1 چالش داده شده بودند. نتایج برای هر پنج ژن انتخابی، تمایز بیان آنها را در حالت مواجهه با آلودگی و حتی جهت تنظیمی بیان را که در فراتحلیل مشاهده شده بود، در سطوح معنیدار تایید نمود، به گونهای که ژنهای <em>IL6</em>، <em>IRF7</em> و <em>CCL4</em> افزایش بیان و ژنهای <em>STK17B</em> و <em>MCM9</em> کاهش بیان نشان دادند. این نتایج پیشنهاد میدهند فراتحلیل روشی بسیار قوی در شناسایی ژنهایی است که ممکن است در پژوهشهای انفرادی مورد توجه قرار نگیرند. این ژنها ممکن است نقش حیاتی در تنظیم پاسخ میزبان ایفا نمایند.https://ar.guilan.ac.ir/article_3180_7035ac218cc333a5bda72fa1bb51cb0e.pdfآنفولانزای پرندگانپاسخ میزبانپی سی آر کمّیتمایز بیانفراتحلیل |
| spellingShingle | مونا صالحی نسب قدرت الله رحیمی میانجی اسماعیل ابراهیمی سید علی غفوری شناسایی ژنهای متفاوت بیان شده در جوجه‌های آلوده به ویروس H5N1 با استفاده از فراتحلیل داده‌های ریزآرایه DNA تحقیقات تولیدات دامی آنفولانزای پرندگان پاسخ میزبان پی سی آر کمّی تمایز بیان فراتحلیل |
| title | شناسایی ژنهای متفاوت بیان شده در جوجه‌های آلوده به ویروس H5N1 با استفاده از فراتحلیل داده‌های ریزآرایه DNA |
| title_full | شناسایی ژنهای متفاوت بیان شده در جوجه‌های آلوده به ویروس H5N1 با استفاده از فراتحلیل داده‌های ریزآرایه DNA |
| title_fullStr | شناسایی ژنهای متفاوت بیان شده در جوجه‌های آلوده به ویروس H5N1 با استفاده از فراتحلیل داده‌های ریزآرایه DNA |
| title_full_unstemmed | شناسایی ژنهای متفاوت بیان شده در جوجه‌های آلوده به ویروس H5N1 با استفاده از فراتحلیل داده‌های ریزآرایه DNA |
| title_short | شناسایی ژنهای متفاوت بیان شده در جوجه‌های آلوده به ویروس H5N1 با استفاده از فراتحلیل داده‌های ریزآرایه DNA |
| title_sort | شناسایی ژنهای متفاوت بیان شده در جوجه‌های آلوده به ویروس h5n1 با استفاده از فراتحلیل داده‌های ریزآرایه dna |
| topic | آنفولانزای پرندگان پاسخ میزبان پی سی آر کمّی تمایز بیان فراتحلیل |
| url | https://ar.guilan.ac.ir/article_3180_7035ac218cc333a5bda72fa1bb51cb0e.pdf |
| work_keys_str_mv | AT mwnạṣạlḥynsb sẖnạsạyyzẖnhạymtfạwtbyạnsẖdhdrjwjhhạyậlwdhbhwyrwsh5n1bạạstfạdhạzfrạtḥlyldạdhhạyryzậrạyhdna AT qdrtạllhrḥymymyạnjy sẖnạsạyyzẖnhạymtfạwtbyạnsẖdhdrjwjhhạyậlwdhbhwyrwsh5n1bạạstfạdhạzfrạtḥlyldạdhhạyryzậrạyhdna AT ạsmạʿylạbrạhymy sẖnạsạyyzẖnhạymtfạwtbyạnsẖdhdrjwjhhạyậlwdhbhwyrwsh5n1bạạstfạdhạzfrạtḥlyldạdhhạyryzậrạyhdna AT sydʿlygẖfwry sẖnạsạyyzẖnhạymtfạwtbyạnsẖdhdrjwjhhạyậlwdhbhwyrwsh5n1bạạstfạdhạzfrạtḥlyldạdhhạyryzậrạyhdna |