Uporaba oligonukleotidnih sond in pretočne citometrije za analizo bakterijske združbe v bioloških čistilnih sistemih
Proučevanje združbe mikroorganizmov v aktivnem blatu z obstoječimi mikrobiološkimi metodami predstavlja nerešljiv problem, kadar želimo ugotavljati ne le število vseh mikroorganizmov v vzorcu temveč tudi število bakterij specifičnih bakterijskih subpopulacij. Opisali smo metodo za hitro analiziranje...
| Main Authors: | , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
University of Ljubljana Press (Založba Univerze v Ljubljani)
2000-05-01
|
| Series: | Acta Agriculturae Slovenica |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://journals.uni-lj.si/aas/article/view/15790 |
| _version_ | 1826532232419868672 |
|---|---|
| author | Luka LIPOGLAVŠEK Gorazd AVGUŠTIN |
| author_facet | Luka LIPOGLAVŠEK Gorazd AVGUŠTIN |
| author_sort | Luka LIPOGLAVŠEK |
| collection | DOAJ |
| description | Proučevanje združbe mikroorganizmov v aktivnem blatu z obstoječimi mikrobiološkimi metodami predstavlja nerešljiv problem, kadar želimo ugotavljati ne le število vseh mikroorganizmov v vzorcu temveč tudi število bakterij specifičnih bakterijskih subpopulacij. Opisali smo metodo za hitro analiziranje aktivnega blata z uporabo dveh različno označenih oligonukleotidnih sond in pripadajočih detektorjev fluorescence pretočnega citometra. S pomočjo sond EUB338-Cy3 in fD1-FITC, specifičnih za vse bakterije, smo postavili model in ga preizkusili s 16S rRNK sondo NSO190-FITC, specifično za kemolitotrofne oksidatorje amonija iz b - podskupine proteobakterij. Ugotovili smo, da je bilo v vzorcu 16,3% bakterij, ki jih prepozna omenjena sonda. Kot možno izboljšavo smo preizkusili učinek tripansko modrega na avtofluorescenco in fluorescenco s sondami hibridiziranih celic. Tripansko modro zniža raven zelene avtofluorescence in nespecifične fluorescence, ne vpliva pa na fluorescenco specifično hibridiziranih celic. |
| first_indexed | 2024-03-08T23:21:45Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-67d0a60ce2cf4101b393d696b2d34263 |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 1854-1941 |
| language | English |
| last_indexed | 2025-03-14T01:47:58Z |
| publishDate | 2000-05-01 |
| publisher | University of Ljubljana Press (Založba Univerze v Ljubljani) |
| record_format | Article |
| series | Acta Agriculturae Slovenica |
| spelling | doaj.art-67d0a60ce2cf4101b393d696b2d342632025-03-12T12:22:20ZengUniversity of Ljubljana Press (Založba Univerze v Ljubljani)Acta Agriculturae Slovenica1854-19412000-05-0176111312210.14720/aas.2000.76.1.1579022183Uporaba oligonukleotidnih sond in pretočne citometrije za analizo bakterijske združbe v bioloških čistilnih sistemihLuka LIPOGLAVŠEK0Gorazd AVGUŠTIN1Univ. v Ljubljani, Biotehniška fak., Odd. za zootehniko, Groblje 3, SI-1230 Domžale, SlovenijaUniv. v Ljubljani, Biotehniška fak., Odd. za zootehniko, Groblje 3, SI-1230 Domžale, SlovenijaProučevanje združbe mikroorganizmov v aktivnem blatu z obstoječimi mikrobiološkimi metodami predstavlja nerešljiv problem, kadar želimo ugotavljati ne le število vseh mikroorganizmov v vzorcu temveč tudi število bakterij specifičnih bakterijskih subpopulacij. Opisali smo metodo za hitro analiziranje aktivnega blata z uporabo dveh različno označenih oligonukleotidnih sond in pripadajočih detektorjev fluorescence pretočnega citometra. S pomočjo sond EUB338-Cy3 in fD1-FITC, specifičnih za vse bakterije, smo postavili model in ga preizkusili s 16S rRNK sondo NSO190-FITC, specifično za kemolitotrofne oksidatorje amonija iz b - podskupine proteobakterij. Ugotovili smo, da je bilo v vzorcu 16,3% bakterij, ki jih prepozna omenjena sonda. Kot možno izboljšavo smo preizkusili učinek tripansko modrega na avtofluorescenco in fluorescenco s sondami hibridiziranih celic. Tripansko modro zniža raven zelene avtofluorescence in nespecifične fluorescence, ne vpliva pa na fluorescenco specifično hibridiziranih celic.https://journals.uni-lj.si/aas/article/view/15790čistilni sistemibiološki čistilni sistemiaktivno blatomikrobiologijabakterijeanalitske metoderrnk sondepretočna citometrijaoksidatorji amonija |
| spellingShingle | Luka LIPOGLAVŠEK Gorazd AVGUŠTIN Uporaba oligonukleotidnih sond in pretočne citometrije za analizo bakterijske združbe v bioloških čistilnih sistemih Acta Agriculturae Slovenica čistilni sistemi biološki čistilni sistemi aktivno blato mikrobiologija bakterije analitske metode rrnk sonde pretočna citometrija oksidatorji amonija |
| title | Uporaba oligonukleotidnih sond in pretočne citometrije za analizo bakterijske združbe v bioloških čistilnih sistemih |
| title_full | Uporaba oligonukleotidnih sond in pretočne citometrije za analizo bakterijske združbe v bioloških čistilnih sistemih |
| title_fullStr | Uporaba oligonukleotidnih sond in pretočne citometrije za analizo bakterijske združbe v bioloških čistilnih sistemih |
| title_full_unstemmed | Uporaba oligonukleotidnih sond in pretočne citometrije za analizo bakterijske združbe v bioloških čistilnih sistemih |
| title_short | Uporaba oligonukleotidnih sond in pretočne citometrije za analizo bakterijske združbe v bioloških čistilnih sistemih |
| title_sort | uporaba oligonukleotidnih sond in pretocne citometrije za analizo bakterijske zdruzbe v bioloskih cistilnih sistemih |
| topic | čistilni sistemi biološki čistilni sistemi aktivno blato mikrobiologija bakterije analitske metode rrnk sonde pretočna citometrija oksidatorji amonija |
| url | https://journals.uni-lj.si/aas/article/view/15790 |
| work_keys_str_mv | AT lukalipoglavsek uporabaoligonukleotidnihsondinpretocnecitometrijezaanalizobakterijskezdruzbevbioloskihcistilnihsistemih AT gorazdavgustin uporabaoligonukleotidnihsondinpretocnecitometrijezaanalizobakterijskezdruzbevbioloskihcistilnihsistemih |