Diversity of Morphology, Physiologi, Biochemistry and Virulence of Xanthomonas citri sub sp. citri Causes Cancer in Citrus
Kanker jeruk adalah penyakit penting tanaman jeruk di dunia, termasuk Indonesia. Identifikasi patogen oleh petani masih berdasarkan gejala penyakit, padahal patogen memiliki keragaman virulensi, patotipe, genetika, dan tanaman inang. Tujuan penelitian untuk mengetahui keragaman morfologi, fisiologi...
| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | Indonesian |
| Published: |
Perhimpunan Fitopatologi Indonesia
2022-05-01
|
| Series: | Jurnal Fitopatologi Indonesia |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://journal.ipb.ac.id/index.php/jfiti/article/view/38684 |
| _version_ | 1797962634105978880 |
|---|---|
| author | Agusti Kristi Kikin Hamzah Mutaqin Giyanto |
| author_facet | Agusti Kristi Kikin Hamzah Mutaqin Giyanto |
| author_sort | Agusti Kristi |
| collection | DOAJ |
| description |
Kanker jeruk adalah penyakit penting tanaman jeruk di dunia, termasuk Indonesia. Identifikasi patogen oleh petani masih berdasarkan gejala penyakit, padahal patogen memiliki keragaman virulensi, patotipe, genetika, dan tanaman inang. Tujuan penelitian untuk mengetahui keragaman morfologi, fisiologi, biokimia, molekuler, dan virulensi dari bakteri kanker jeruk. Bakteri diisolasi dari sampel lemon (Citrus limon), nipis (C. aurantifolia), purut (C. hystrix), siam (C. sinensis), dan fortunella (Fortunella margarita) yang menunjukkan gejala khas penyakit kanker di Bogor dan Kabupaten Lima Puluh Kota, Sumatera Barat. Karakteristik bakteri dilakukan berdasarkan morfologi, fisiologi, biokimia, dan molekuler menggunakan PCR primer universal, serta patogenisitas pada kultivar jeruk, yaitu lemon, nipis, purut, siam, dan fortunella. Sebanyak 16 galur bakteri patogen dari sampel tanaman jeruk menunjukkan gejala khas penyakit kanker. Koloni bakteri patogen beragam berdasarkan ukuran, warna, dan tekstur koloni; secara fisiologi dan biokimia juga beragam berdasarkan kemampuan protease, oksidase, hidrolisis kasein, dan hidrolisis pati; demikian juga patogenisitasnya pada empat kultivar jeruk juga beragam. Diketahui ada empat galur yang virulen (LB04, NP02, PB05, dan SP05) pada jeruk lemon, nipis, purut, dan siam dengan masa inkubasi 23–27 hari, insidensi 22.25–90.15%, dan keparahan 15.80–78.85%. Galur LB04 paling virulen berdasarkan nilai insidensi, keparahan, dan AUDPC; kultivar jeruk nipis paling rentan. Berdasarkan hasil analisis nukleotida gen 16S rRNA maka galur PB01 terkonfirmasi sebagai Xanthomonas citri subsp. citri (MK121207.1) dengan homologi 99.7% sehingga termasuk patotipe A (Asiatik).
|
| first_indexed | 2024-04-11T01:16:16Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-685bb982814044b0b76518ed0fea441e |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 0215-7950 2339-2479 |
| language | Indonesian |
| last_indexed | 2024-04-11T01:16:16Z |
| publishDate | 2022-05-01 |
| publisher | Perhimpunan Fitopatologi Indonesia |
| record_format | Article |
| series | Jurnal Fitopatologi Indonesia |
| spelling | doaj.art-685bb982814044b0b76518ed0fea441e2023-01-04T02:42:50ZindPerhimpunan Fitopatologi IndonesiaJurnal Fitopatologi Indonesia0215-79502339-24792022-05-0118110.14692/jfi.18.1.29-42Diversity of Morphology, Physiologi, Biochemistry and Virulence of Xanthomonas citri sub sp. citri Causes Cancer in Citrus Agusti KristiKikin Hamzah Mutaqin0Giyanto1Department of Plant Protection, IPB UniversityDepartment of Plant Protection, IPB University Kanker jeruk adalah penyakit penting tanaman jeruk di dunia, termasuk Indonesia. Identifikasi patogen oleh petani masih berdasarkan gejala penyakit, padahal patogen memiliki keragaman virulensi, patotipe, genetika, dan tanaman inang. Tujuan penelitian untuk mengetahui keragaman morfologi, fisiologi, biokimia, molekuler, dan virulensi dari bakteri kanker jeruk. Bakteri diisolasi dari sampel lemon (Citrus limon), nipis (C. aurantifolia), purut (C. hystrix), siam (C. sinensis), dan fortunella (Fortunella margarita) yang menunjukkan gejala khas penyakit kanker di Bogor dan Kabupaten Lima Puluh Kota, Sumatera Barat. Karakteristik bakteri dilakukan berdasarkan morfologi, fisiologi, biokimia, dan molekuler menggunakan PCR primer universal, serta patogenisitas pada kultivar jeruk, yaitu lemon, nipis, purut, siam, dan fortunella. Sebanyak 16 galur bakteri patogen dari sampel tanaman jeruk menunjukkan gejala khas penyakit kanker. Koloni bakteri patogen beragam berdasarkan ukuran, warna, dan tekstur koloni; secara fisiologi dan biokimia juga beragam berdasarkan kemampuan protease, oksidase, hidrolisis kasein, dan hidrolisis pati; demikian juga patogenisitasnya pada empat kultivar jeruk juga beragam. Diketahui ada empat galur yang virulen (LB04, NP02, PB05, dan SP05) pada jeruk lemon, nipis, purut, dan siam dengan masa inkubasi 23–27 hari, insidensi 22.25–90.15%, dan keparahan 15.80–78.85%. Galur LB04 paling virulen berdasarkan nilai insidensi, keparahan, dan AUDPC; kultivar jeruk nipis paling rentan. Berdasarkan hasil analisis nukleotida gen 16S rRNA maka galur PB01 terkonfirmasi sebagai Xanthomonas citri subsp. citri (MK121207.1) dengan homologi 99.7% sehingga termasuk patotipe A (Asiatik). https://journal.ipb.ac.id/index.php/jfiti/article/view/38684AUDPCintensitas penyakitpatogenisitas |
| spellingShingle | Agusti Kristi Kikin Hamzah Mutaqin Giyanto Diversity of Morphology, Physiologi, Biochemistry and Virulence of Xanthomonas citri sub sp. citri Causes Cancer in Citrus Jurnal Fitopatologi Indonesia AUDPC intensitas penyakit patogenisitas |
| title | Diversity of Morphology, Physiologi, Biochemistry and Virulence of Xanthomonas citri sub sp. citri Causes Cancer in Citrus |
| title_full | Diversity of Morphology, Physiologi, Biochemistry and Virulence of Xanthomonas citri sub sp. citri Causes Cancer in Citrus |
| title_fullStr | Diversity of Morphology, Physiologi, Biochemistry and Virulence of Xanthomonas citri sub sp. citri Causes Cancer in Citrus |
| title_full_unstemmed | Diversity of Morphology, Physiologi, Biochemistry and Virulence of Xanthomonas citri sub sp. citri Causes Cancer in Citrus |
| title_short | Diversity of Morphology, Physiologi, Biochemistry and Virulence of Xanthomonas citri sub sp. citri Causes Cancer in Citrus |
| title_sort | diversity of morphology physiologi biochemistry and virulence of xanthomonas citri sub sp citri causes cancer in citrus |
| topic | AUDPC intensitas penyakit patogenisitas |
| url | https://journal.ipb.ac.id/index.php/jfiti/article/view/38684 |
| work_keys_str_mv | AT agustikristi diversityofmorphologyphysiologibiochemistryandvirulenceofxanthomonascitrisubspcitricausescancerincitrus AT kikinhamzahmutaqin diversityofmorphologyphysiologibiochemistryandvirulenceofxanthomonascitrisubspcitricausescancerincitrus AT giyanto diversityofmorphologyphysiologibiochemistryandvirulenceofxanthomonascitrisubspcitricausescancerincitrus |