MARCADORES RAPD NA ANÁLISE DA DIVERGÊNCIA GENÉTICA ENTRE RAÇAS DE BOVINOS E NÚMERO DE LOCOS NECESSÁRIOS PARA A ESTABILIDADE DA DIVERGÊNCIA ESTIMADA
Diversos marcadores moleculares vêm auxiliando tanto geneticistas como melhoristas na detecção da variabilidade genética das populações. O incremento na capacidade computacional tem permitido também a otimização dos delineamentos, reduzindo os custos e o esforço laboratorial. O objetivo deste trabal...
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|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Universidade Federal de Goiás
2006-10-01
|
| Series: | Ciência Animal Brasileira |
| Online Access: | https://revistas.ufg.br/vet/article/view/269 |
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|---|---|
| author | Mariana Pires de Campos Telles Maria Silvia Rodrigues Monteiro Flávia Melo Rodrigues Thannya Nascimento Soares Lucileide Vilela Resende Alliny das Graças Amaral Paulo Roberto Marra |
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| author_sort | Mariana Pires de Campos Telles |
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| description | Diversos marcadores moleculares vêm auxiliando tanto geneticistas como melhoristas na detecção da variabilidade genética das populações. O incremento na capacidade computacional tem permitido também a otimização dos delineamentos, reduzindo os custos e o esforço laboratorial. O objetivo deste trabalho foi selecionar marcadores RAPD em bovinos, avaliando o padrão de similaridade genética entre rebanhos e definindo o número mínimo de locos necessário para estabilizar a divergência genética estimada. O DNA de dois rebanhos nelore e um holandês, totalizando 66 animais, foi utilizado para as análises. Dos 40 primers testados, 16 não apresentaram um bom padrão de amplificação ou não amplificaram. Os 24 primers restantes apresentaram 133 locos, sendo 65 deles polimórficos. Como esperado, uma análise de agrupamento UPGMA mostrou que os dois rebanhos nelore são mais próximos entre si, com similaridade genética (Jaccard) igual a 0,785. O holandês é o mais distante geneticamente do grupo dos nelore, com um valor médio de Jaccard igual a 0,589. Pelo bootstrap observa-se que um aumento no número de locos utilizados gera uma redução contínua nos desvios-padrão e nos coeficientes de variação e que 50 deve ser o número mínimo de locos necessário para que a estimativa da divergência genética entre essas amostras se torne estável.
PALAVRAS-CHAVE: Bovinos, divergência genética, marcador molecular, RAPD. |
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| issn | 1518-2797 1809-6891 |
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| publishDate | 2006-10-01 |
| publisher | Universidade Federal de Goiás |
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| series | Ciência Animal Brasileira |
| spelling | doaj.art-73ed3d1536604a358df78359cd2370f82023-06-28T21:40:54ZengUniversidade Federal de GoiásCiência Animal Brasileira1518-27971809-68912006-10-012210.5216/cab.v2i2.269MARCADORES RAPD NA ANÁLISE DA DIVERGÊNCIA GENÉTICA ENTRE RAÇAS DE BOVINOS E NÚMERO DE LOCOS NECESSÁRIOS PARA A ESTABILIDADE DA DIVERGÊNCIA ESTIMADAMariana Pires de Campos TellesMaria Silvia Rodrigues MonteiroFlávia Melo RodriguesThannya Nascimento SoaresLucileide Vilela ResendeAlliny das Graças AmaralPaulo Roberto MarraDiversos marcadores moleculares vêm auxiliando tanto geneticistas como melhoristas na detecção da variabilidade genética das populações. O incremento na capacidade computacional tem permitido também a otimização dos delineamentos, reduzindo os custos e o esforço laboratorial. O objetivo deste trabalho foi selecionar marcadores RAPD em bovinos, avaliando o padrão de similaridade genética entre rebanhos e definindo o número mínimo de locos necessário para estabilizar a divergência genética estimada. O DNA de dois rebanhos nelore e um holandês, totalizando 66 animais, foi utilizado para as análises. Dos 40 primers testados, 16 não apresentaram um bom padrão de amplificação ou não amplificaram. Os 24 primers restantes apresentaram 133 locos, sendo 65 deles polimórficos. Como esperado, uma análise de agrupamento UPGMA mostrou que os dois rebanhos nelore são mais próximos entre si, com similaridade genética (Jaccard) igual a 0,785. O holandês é o mais distante geneticamente do grupo dos nelore, com um valor médio de Jaccard igual a 0,589. Pelo bootstrap observa-se que um aumento no número de locos utilizados gera uma redução contínua nos desvios-padrão e nos coeficientes de variação e que 50 deve ser o número mínimo de locos necessário para que a estimativa da divergência genética entre essas amostras se torne estável. PALAVRAS-CHAVE: Bovinos, divergência genética, marcador molecular, RAPD.https://revistas.ufg.br/vet/article/view/269 |
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