Pangenomic genotyping with the marker array
Abstract We present a new method and software tool called rowbowt that applies a pangenome index to the problem of inferring genotypes from short-read sequencing data. The method uses a novel indexing structure called the marker array. Using the marker array, we can genotype variants with respect fr...
| Հիմնական հեղինակներ: | , , |
|---|---|
| Ձևաչափ: | Հոդված |
| Լեզու: | English |
| Հրապարակվել է: |
BMC
2023-05-01
|
| Շարք: | Algorithms for Molecular Biology |
| Խորագրեր: | |
| Առցանց հասանելիություն: | https://doi.org/10.1186/s13015-023-00225-3 |