Doğal Fermente Olan Sütteki Lactobacillus Spp.16S rRNA Geninin Kısmi Analizi
Amaç: Bu çalışmanın amacı doğal olarak fermente olan sütten Lactobacillus spp. türüne ait 16S rRNA ların gen sekansı yapmaktır. Materyal ve Metod: Kullanılan metodlar; alkali lizis yöntemiyle total DNA izolasyonu, spesifik primerlerle PCR amplifikasyonu ve amplifiye edilmiş DNA ların sekans analiz...
| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Cukurova University
2014-07-01
|
| Series: | Cukurova Medical Journal |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://dergipark.org.tr/tr/pub/cumj/issue/4192/55201?publisher=cu |
| _version_ | 1797908134821363712 |
|---|---|
| author | Nur KUSMİYATİ Nur HİDAYAT Fatchiyah FATCHİYAH |
| author_facet | Nur KUSMİYATİ Nur HİDAYAT Fatchiyah FATCHİYAH |
| author_sort | Nur KUSMİYATİ |
| collection | DOAJ |
| description | Amaç: Bu çalışmanın amacı doğal olarak fermente olan sütten Lactobacillus spp. türüne ait 16S rRNA ların gen sekansı yapmaktır. Materyal ve Metod: Kullanılan metodlar; alkali lizis yöntemiyle total DNA izolasyonu, spesifik primerlerle PCR amplifikasyonu ve amplifiye edilmiş DNA ların sekans analizlerinin yapılması şeklindedir. Elde edilen PCR ürünleri yaklaşık 585 bp uzunluğunda olup V1-V3 değişken bölgelerini içermektedir. Sekanslanan 16s rRNA daha sonra gen bankasıyla karşılaştırıldı. Bulgular: 16s rRNA geninin korunmuş bölgeleri; 189-358 ve 384-445 sırasıyla %95,9 ile %94,9 oranında korunurken, 16s rRNA geni totalde %78.8 oranında korunmuştur. Doğal sütün fermentasyonundan izole edilen bu 7 izolattan 2 tanesi L.Plantarum(benzerlik oranları %98.28 ve %97.78 diğer 5 izolattan 2"si L. Rhamnosus (benzerlik oranları (98.38 ve %97.51), diğer 2"si L. zeae (benzerlik oranları %97.36 ve % ve %98.38), biri ise L. case (benzerlik oranı%98.20) şeklinde tanımlanmıştır. Sonuç: Çalışmanın sonuçları test edilen izolatın Laktobailus genusuna ait olduğunu, fakat farklı türde sınıflandırıldığını göstermiştir. |
| first_indexed | 2024-04-10T10:47:45Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-8cc75af4e2f841158f701b8f7ff05c33 |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 2602-3040 |
| language | English |
| last_indexed | 2024-04-10T10:47:45Z |
| publishDate | 2014-07-01 |
| publisher | Cukurova University |
| record_format | Article |
| series | Cukurova Medical Journal |
| spelling | doaj.art-8cc75af4e2f841158f701b8f7ff05c332023-02-15T16:20:15ZengCukurova UniversityCukurova Medical Journal2602-30402014-07-013919910410.17826/cutf.8255248Doğal Fermente Olan Sütteki Lactobacillus Spp.16S rRNA Geninin Kısmi AnaliziNur KUSMİYATİNur HİDAYATFatchiyah FATCHİYAHAmaç: Bu çalışmanın amacı doğal olarak fermente olan sütten Lactobacillus spp. türüne ait 16S rRNA ların gen sekansı yapmaktır. Materyal ve Metod: Kullanılan metodlar; alkali lizis yöntemiyle total DNA izolasyonu, spesifik primerlerle PCR amplifikasyonu ve amplifiye edilmiş DNA ların sekans analizlerinin yapılması şeklindedir. Elde edilen PCR ürünleri yaklaşık 585 bp uzunluğunda olup V1-V3 değişken bölgelerini içermektedir. Sekanslanan 16s rRNA daha sonra gen bankasıyla karşılaştırıldı. Bulgular: 16s rRNA geninin korunmuş bölgeleri; 189-358 ve 384-445 sırasıyla %95,9 ile %94,9 oranında korunurken, 16s rRNA geni totalde %78.8 oranında korunmuştur. Doğal sütün fermentasyonundan izole edilen bu 7 izolattan 2 tanesi L.Plantarum(benzerlik oranları %98.28 ve %97.78 diğer 5 izolattan 2"si L. Rhamnosus (benzerlik oranları (98.38 ve %97.51), diğer 2"si L. zeae (benzerlik oranları %97.36 ve % ve %98.38), biri ise L. case (benzerlik oranı%98.20) şeklinde tanımlanmıştır. Sonuç: Çalışmanın sonuçları test edilen izolatın Laktobailus genusuna ait olduğunu, fakat farklı türde sınıflandırıldığını göstermiştir.https://dergipark.org.tr/tr/pub/cumj/issue/4192/55201?publisher=cu-16s rrna gene lactobacillus natural fermentation milk partial analysislaktobacillus doğal fermente süt 16s rrna parsiyal analiz |
| spellingShingle | Nur KUSMİYATİ Nur HİDAYAT Fatchiyah FATCHİYAH Doğal Fermente Olan Sütteki Lactobacillus Spp.16S rRNA Geninin Kısmi Analizi Cukurova Medical Journal - 16s rrna gene lactobacillus natural fermentation milk partial analysis laktobacillus doğal fermente süt 16s rrna parsiyal analiz |
| title | Doğal Fermente Olan Sütteki Lactobacillus Spp.16S rRNA Geninin Kısmi Analizi |
| title_full | Doğal Fermente Olan Sütteki Lactobacillus Spp.16S rRNA Geninin Kısmi Analizi |
| title_fullStr | Doğal Fermente Olan Sütteki Lactobacillus Spp.16S rRNA Geninin Kısmi Analizi |
| title_full_unstemmed | Doğal Fermente Olan Sütteki Lactobacillus Spp.16S rRNA Geninin Kısmi Analizi |
| title_short | Doğal Fermente Olan Sütteki Lactobacillus Spp.16S rRNA Geninin Kısmi Analizi |
| title_sort | dogal fermente olan sutteki lactobacillus spp 16s rrna geninin kismi analizi |
| topic | - 16s rrna gene lactobacillus natural fermentation milk partial analysis laktobacillus doğal fermente süt 16s rrna parsiyal analiz |
| url | https://dergipark.org.tr/tr/pub/cumj/issue/4192/55201?publisher=cu |
| work_keys_str_mv | AT nurkusmiyati dogalfermenteolansuttekilactobacillusspp16srrnagenininkısmianalizi AT nurhidayat dogalfermenteolansuttekilactobacillusspp16srrnagenininkısmianalizi AT fatchiyahfatchiyah dogalfermenteolansuttekilactobacillusspp16srrnagenininkısmianalizi |