IDENTIFICAÇÃO MOLECULAR DE OSTRAS NATIVAS NA COSTA DO MARANHÃO, BRASIL
As ostras são encontradas ao longo de toda a costa do Brasil. Os fenótipos das espécies variam consideravelmente de acordo com as características do habitat. O presente estudo investigou a existência de diferentes espécies de ostra do gênero Crassostrea no litoral do Maranhão, utilizando a técnica...
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| Published: |
Instituto de Pesca
2018-12-01
|
| Series: | Boletim do Instituto de Pesca |
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| author | Rodolf Gabriel Prazeres Silva LOPES Ícaro Gomes ANTONIO Lígia TCHAIKA Maria Claudene BARROS Elmary FRAGA |
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| description | As ostras são encontradas ao longo de toda a costa do Brasil. Os fenótipos das espécies variam consideravelmente de acordo com as características do habitat. O presente estudo investigou a existência de diferentes espécies de ostra do gênero Crassostrea no litoral do Maranhão, utilizando a técnica de PCR Multiplex e DNA barcoding. Os resultados da PCR Multiplex revelaram duas bandas distintas, características das espécies C. gasar e C. rhizophorae num total de 135 amostras analisadas. No sequenciamento do gene COI de 98 amostras obteve-se fragmentos de 695 pb e 15 haplótipos para C. gasar e de 640 pb e oito haplótipos para C. rhizophorae. A árvore haplótipica agrupou fortemente as duas espécies em clados diferentes com 100% de bootstrap. Divergências intraespecíficas foram de 0,2% para ambas, e a interespecífica de 23,6%. A similaridade das sequencias deste estudo com sequências presentes no BoldSystems variou de 97,01 a 98,37 para C. rhizophorae e de 97,55 a 99,84 tanto para C. gasar como para C. brasiliana, reforçando uma problemática na taxonomia do grupo, que apontam para a sinonimia dessas espécies. Portanto, o DNA barcoding permitiu identificar as amostras coletadas e confirmou a existência de duas espécies de ostra |
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| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 1678-2305 |
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| publishDate | 2018-12-01 |
| publisher | Instituto de Pesca |
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| series | Boletim do Instituto de Pesca |
| spelling | doaj.art-9825e793766d48e89e020984a3edf99a2023-02-05T21:28:01ZengInstituto de PescaBoletim do Instituto de Pesca1678-23052018-12-0144410.20950/1678-2305.2018.44.4.377IDENTIFICAÇÃO MOLECULAR DE OSTRAS NATIVAS NA COSTA DO MARANHÃO, BRASILRodolf Gabriel Prazeres Silva LOPES0Ícaro Gomes ANTONIO1Lígia TCHAIKA2Maria Claudene BARROS3Elmary FRAGA4Universidade Estadual do Maranhão - UEMA, Programa de Pós-graduação em Recursos Aquáticos e Pesca - PPGRAUniversidade Estadual do Maranhão - UEMA, Centro de Ciências AgráriasUniversidade Estadual do Maranhão - UEMA, Centro de Ciências AgráriasUniversidade Estadual do Maranhão, Centro de Estudos Superiores de Caxias - CESCUniversidade Estadual do Maranhão, Centro de Estudos Superiores de Caxias - CESCAs ostras são encontradas ao longo de toda a costa do Brasil. Os fenótipos das espécies variam consideravelmente de acordo com as características do habitat. O presente estudo investigou a existência de diferentes espécies de ostra do gênero Crassostrea no litoral do Maranhão, utilizando a técnica de PCR Multiplex e DNA barcoding. Os resultados da PCR Multiplex revelaram duas bandas distintas, características das espécies C. gasar e C. rhizophorae num total de 135 amostras analisadas. No sequenciamento do gene COI de 98 amostras obteve-se fragmentos de 695 pb e 15 haplótipos para C. gasar e de 640 pb e oito haplótipos para C. rhizophorae. A árvore haplótipica agrupou fortemente as duas espécies em clados diferentes com 100% de bootstrap. Divergências intraespecíficas foram de 0,2% para ambas, e a interespecífica de 23,6%. A similaridade das sequencias deste estudo com sequências presentes no BoldSystems variou de 97,01 a 98,37 para C. rhizophorae e de 97,55 a 99,84 tanto para C. gasar como para C. brasiliana, reforçando uma problemática na taxonomia do grupo, que apontam para a sinonimia dessas espécies. Portanto, o DNA barcoding permitiu identificar as amostras coletadas e confirmou a existência de duas espécies de ostrahttps://institutodepesca.org/index.php/bip/article/view/1326DNA mitocondrialCOIidentificação de espécies |
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