تجزیه‌وتحلیل رونوشت نای در جوجه‌های گوشتی SPF آلوده به برونشیت عفونی پرندگان

برونشیت عفونی پرندگان (infectious bronchitis) یک بیماری حاد و بسیار مسری دستگاه تنفسی فوقانی است که توسط ویروس برونشیت عفونی (infectious bronchitis virus) ایجاد می‌شود. این ویروس از خانواده کرونا ویریده (coronaviridae) است و دارای سرو‌تیپ‌ها و سویه‌های متعددی است. تکثیر سریع همراه با نرخ جهش و نوترک...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: سید حسین زمزم, آرش قلیانچی لنگرودی, علیرضا خسروی
Format: Article
Language:fas
Published: Islamic Azad University, Tabriz Branch 2021-10-01
Series:Āsīb/shināsī-i Darmāngāhī-i Dāmpizishkī
Subjects:
Online Access:https://jvcp.tabriz.iau.ir/article_688670_b812693caa1bbc74a595eee7e8ecc673.pdf
_version_ 1797846304910475264
author سید حسین زمزم
آرش قلیانچی لنگرودی
علیرضا خسروی
author_facet سید حسین زمزم
آرش قلیانچی لنگرودی
علیرضا خسروی
author_sort سید حسین زمزم
collection DOAJ
description برونشیت عفونی پرندگان (infectious bronchitis) یک بیماری حاد و بسیار مسری دستگاه تنفسی فوقانی است که توسط ویروس برونشیت عفونی (infectious bronchitis virus) ایجاد می‌شود. این ویروس از خانواده کرونا ویریده (coronaviridae) است و دارای سرو‌تیپ‌ها و سویه‌های متعددی است. تکثیر سریع همراه با نرخ جهش و نوترکیبی بالا از دلایل اصلی تنوع بالای مشاهده‌شده است. ضریب تبدیل غذایی و میانگین افزایش روزانه در جوجه‌های گوشتی تحت تأثیر قرار می‌گیرد و عفونت اغلب با عفونت‌های باکتریایی ثانویه همراه است. در مرغ‌های تخم‌گذار، IBV باعث کاهش تولید و کیفیت تخم‌مرغ می‌شود. امروزه بیماری IBV یکی از مهم‌ترین بیماری‌های اقتصادی در صنعت طیور است. در مطالعه حاضر، پروفایل‌های رونویسی بافت نای گروه آلوده (IBV) با گروه کنترل برای بررسی تغییرات مشخصات رونوشت در مراحل اولیه عفونت مورد مطالعه قرار گرفت. پس از چالش جوجه‌های SPF با ویروس برونشیت عفونی واریانت 2 IBV IS-1494 (GI-23)، از بافت نای برای استخراج RNA استفاده شد و تغییرات در رونوشت با فن Illumina RNA-seq بررسی شد. ژن‌های تغییر‌بیان‌یافته (DEGs) در رونوشت نای شناسایی شدند. دسته هستی‌شناسی ژن، مسیر KEGG برای شناسایی روابط بین ژن‌های متفاوت بیان‌شده مورد تجزیه‌وتحلیل قرار گرفت. به‌طورکلی، در گروه آزمایش تعداد ژن‌های افزایش­بیان­یافته بیشتر از ژن‌های کاهش‌بیان‌یافته بود. در گروه آزمایشی، پاسخ ایمنی شدیدتر رخ داد. از ژن‌های تنظیم‌شده مهم در این گروه مسیر سیگنال‌دهی گیرنده شبه Toll، مسیر آپوپتوتیک، مسیر ‌سیگنالینگ MAPK بود. نتایج این مطالعه می‌تواند یک نمای کلی از تغییرات رونوشت در نای در مراحل اولیه عفونت با ویروس برونشیت عفونی پرندگان (IBV) ارائه دهد.
first_indexed 2024-04-09T17:52:47Z
format Article
id doaj.art-a0f26d4b4b2a4920b9521afa4a395168
institution Directory Open Access Journal
issn 2322-4746
2476-6984
language fas
last_indexed 2024-04-09T17:52:47Z
publishDate 2021-10-01
publisher Islamic Azad University, Tabriz Branch
record_format Article
series Āsīb/shināsī-i Darmāngāhī-i Dāmpizishkī
spelling doaj.art-a0f26d4b4b2a4920b9521afa4a3951682023-04-15T14:00:20ZfasIslamic Azad University, Tabriz BranchĀsīb/shināsī-i Darmāngāhī-i Dāmpizishkī2322-47462476-69842021-10-01153 (59) پاییز27128810.30495/jvcp.2022.1945808.1343688670تجزیه‌وتحلیل رونوشت نای در جوجه‌های گوشتی SPF آلوده به برونشیت عفونی پرندگانسید حسین زمزم0آرش قلیانچی لنگرودی1علیرضا خسروی2دانشجوی دکترای تخصصی ویروس‌شناسی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه تهران، تهران، ایران.استاد گروه میکروبیولوژی و ایمونولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه تهران، تهران، ایران.استاد گروه میکروبیولوژی و ایمونولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه تهران، تهران، ایران.برونشیت عفونی پرندگان (infectious bronchitis) یک بیماری حاد و بسیار مسری دستگاه تنفسی فوقانی است که توسط ویروس برونشیت عفونی (infectious bronchitis virus) ایجاد می‌شود. این ویروس از خانواده کرونا ویریده (coronaviridae) است و دارای سرو‌تیپ‌ها و سویه‌های متعددی است. تکثیر سریع همراه با نرخ جهش و نوترکیبی بالا از دلایل اصلی تنوع بالای مشاهده‌شده است. ضریب تبدیل غذایی و میانگین افزایش روزانه در جوجه‌های گوشتی تحت تأثیر قرار می‌گیرد و عفونت اغلب با عفونت‌های باکتریایی ثانویه همراه است. در مرغ‌های تخم‌گذار، IBV باعث کاهش تولید و کیفیت تخم‌مرغ می‌شود. امروزه بیماری IBV یکی از مهم‌ترین بیماری‌های اقتصادی در صنعت طیور است. در مطالعه حاضر، پروفایل‌های رونویسی بافت نای گروه آلوده (IBV) با گروه کنترل برای بررسی تغییرات مشخصات رونوشت در مراحل اولیه عفونت مورد مطالعه قرار گرفت. پس از چالش جوجه‌های SPF با ویروس برونشیت عفونی واریانت 2 IBV IS-1494 (GI-23)، از بافت نای برای استخراج RNA استفاده شد و تغییرات در رونوشت با فن Illumina RNA-seq بررسی شد. ژن‌های تغییر‌بیان‌یافته (DEGs) در رونوشت نای شناسایی شدند. دسته هستی‌شناسی ژن، مسیر KEGG برای شناسایی روابط بین ژن‌های متفاوت بیان‌شده مورد تجزیه‌وتحلیل قرار گرفت. به‌طورکلی، در گروه آزمایش تعداد ژن‌های افزایش­بیان­یافته بیشتر از ژن‌های کاهش‌بیان‌یافته بود. در گروه آزمایشی، پاسخ ایمنی شدیدتر رخ داد. از ژن‌های تنظیم‌شده مهم در این گروه مسیر سیگنال‌دهی گیرنده شبه Toll، مسیر آپوپتوتیک، مسیر ‌سیگنالینگ MAPK بود. نتایج این مطالعه می‌تواند یک نمای کلی از تغییرات رونوشت در نای در مراحل اولیه عفونت با ویروس برونشیت عفونی پرندگان (IBV) ارائه دهد.https://jvcp.tabriz.iau.ir/article_688670_b812693caa1bbc74a595eee7e8ecc673.pdfویروس برونشیت عفونی پرندگانرونوشتrna-seqنای
spellingShingle سید حسین زمزم
آرش قلیانچی لنگرودی
علیرضا خسروی
تجزیه‌وتحلیل رونوشت نای در جوجه‌های گوشتی SPF آلوده به برونشیت عفونی پرندگان
Āsīb/shināsī-i Darmāngāhī-i Dāmpizishkī
ویروس برونشیت عفونی پرندگان
رونوشت
rna-seq
نای
title تجزیه‌وتحلیل رونوشت نای در جوجه‌های گوشتی SPF آلوده به برونشیت عفونی پرندگان
title_full تجزیه‌وتحلیل رونوشت نای در جوجه‌های گوشتی SPF آلوده به برونشیت عفونی پرندگان
title_fullStr تجزیه‌وتحلیل رونوشت نای در جوجه‌های گوشتی SPF آلوده به برونشیت عفونی پرندگان
title_full_unstemmed تجزیه‌وتحلیل رونوشت نای در جوجه‌های گوشتی SPF آلوده به برونشیت عفونی پرندگان
title_short تجزیه‌وتحلیل رونوشت نای در جوجه‌های گوشتی SPF آلوده به برونشیت عفونی پرندگان
title_sort تجزیه‌وتحلیل رونوشت نای در جوجه‌های گوشتی spf آلوده به برونشیت عفونی پرندگان
topic ویروس برونشیت عفونی پرندگان
رونوشت
rna-seq
نای
url https://jvcp.tabriz.iau.ir/article_688670_b812693caa1bbc74a595eee7e8ecc673.pdf
work_keys_str_mv AT sydḥsynzmzm tjzyhwtḥlylrwnwsẖtnạydrjwjhhạygwsẖtyspfậlwdhbhbrwnsẖytʿfwnyprndgạn
AT ậrsẖqlyạncẖylngrwdy tjzyhwtḥlylrwnwsẖtnạydrjwjhhạygwsẖtyspfậlwdhbhbrwnsẖytʿfwnyprndgạn
AT ʿlyrḍạkẖsrwy tjzyhwtḥlylrwnwsẖtnạydrjwjhhạygwsẖtyspfậlwdhbhbrwnsẖytʿfwnyprndgạn