Gene flow and geographic variation in natural populations of Alnus acuminata ssp. arguta (Fagales: Betulaceae) in Costa Rica and Panama
Seventeen natural populations in Costa Rica and Panama were used to asses gene flow and geographic patterns of genetic variation in this tree species. Gene flow analysis was based on the methods of rare alleles and FST (Index of genetic similarity M), using the only four polymorphic gene loci among...
| Main Authors: | , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Vicerractoría Investigación
1999-12-01
|
| Series: | Revista de Biología Tropical |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77441999000400011 |
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|---|---|
| author | Olman Murillo Oscar Rocha |
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| author_sort | Olman Murillo |
| collection | DOAJ |
| description | Seventeen natural populations in Costa Rica and Panama were used to asses gene flow and geographic patterns of genetic variation in this tree species. Gene flow analysis was based on the methods of rare alleles and FST (Index of genetic similarity M), using the only four polymorphic gene loci among 22 investigated (PGI-B, PGM-A, MNR-A and IDH-A). The geographic variation analysis was based on Pearson`s correlations between four geographic and 14 genetic variables. Some evidence of isolation by distance and a weak gene flow among geographic regions was found. Patterns of clinal variation in relation to altitude (r = -0.62 for genetic diversity) and latitude (r= -0.77 for PGI-B3) were also observed, supporting the hypothesis of isolation by distance. No private alleles were found at the single population level.<br>Diecisiete poblaciones naturales de esta especie forestal en Costa Rica y Panamá, fueron investigadas en relación con sus patrones de flujo genético y de variación geográfica. El análisis de flujo genético fue basado en los métodos de los alelos raros y de FST (Indice de similaridad genética M). Los análisis fueron a su vez basados en los únicos cuatro loci genéticos de un total de 22 investigados que mostraron polimorfismo (PGI-B, PGM-A, MNR-A and IDH-A). Los análisis de variación geográfica fueron basados en el desarrollo de correlaciones de Pearson entre 4 variables geográficas y 14 variables genéticas. Alguna evidencia de aislamiento por distancia así como un débil flujo genético entre regiones geográficas fue encontrado. Fueron también observados patrones de variación clinal en relación con la altitud (r = -0.62 para la diversidad genética) y latitud (r= -0.77 en PGI-B3), que apoyan la hipotesis de aislamiento por distancia para esta especie. No se encontraron alelos privados en ninguna de las poblaciones investigadas. |
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| publishDate | 1999-12-01 |
| publisher | Vicerractoría Investigación |
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| series | Revista de Biología Tropical |
| spelling | doaj.art-a33423f0c5a54f898303671929c63d5a2023-09-02T20:54:20ZengVicerractoría InvestigaciónRevista de Biología Tropical0034-77442215-20751999-12-01474739753Gene flow and geographic variation in natural populations of Alnus acuminata ssp. arguta (Fagales: Betulaceae) in Costa Rica and PanamaOlman MurilloOscar RochaSeventeen natural populations in Costa Rica and Panama were used to asses gene flow and geographic patterns of genetic variation in this tree species. Gene flow analysis was based on the methods of rare alleles and FST (Index of genetic similarity M), using the only four polymorphic gene loci among 22 investigated (PGI-B, PGM-A, MNR-A and IDH-A). The geographic variation analysis was based on Pearson`s correlations between four geographic and 14 genetic variables. Some evidence of isolation by distance and a weak gene flow among geographic regions was found. Patterns of clinal variation in relation to altitude (r = -0.62 for genetic diversity) and latitude (r= -0.77 for PGI-B3) were also observed, supporting the hypothesis of isolation by distance. No private alleles were found at the single population level.<br>Diecisiete poblaciones naturales de esta especie forestal en Costa Rica y Panamá, fueron investigadas en relación con sus patrones de flujo genético y de variación geográfica. El análisis de flujo genético fue basado en los métodos de los alelos raros y de FST (Indice de similaridad genética M). Los análisis fueron a su vez basados en los únicos cuatro loci genéticos de un total de 22 investigados que mostraron polimorfismo (PGI-B, PGM-A, MNR-A and IDH-A). Los análisis de variación geográfica fueron basados en el desarrollo de correlaciones de Pearson entre 4 variables geográficas y 14 variables genéticas. Alguna evidencia de aislamiento por distancia así como un débil flujo genético entre regiones geográficas fue encontrado. Fueron también observados patrones de variación clinal en relación con la altitud (r = -0.62 para la diversidad genética) y latitud (r= -0.77 en PGI-B3), que apoyan la hipotesis de aislamiento por distancia para esta especie. No se encontraron alelos privados en ninguna de las poblaciones investigadas.http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-77441999000400011Costa RicaPanamaAlnus acuminataisozymesgene flowclinegeographic variation |
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