DOCKING MOLEKULER SENYAWA METABOLIT SEKUNDER Lantana camara SEBAGAI ANTIINFLAMASI TERHADAP ENZIM COX-1
Lantana camara mengandung beberapa jenis flavonoid seperti Umuhengerin, Lantadene A, Lantadene B, Ictero -genin. Salah satu mekanisme kerja flavonoid sebagai antiinflammatoryis dengan menghambat ceptor siklooksigenase (COX). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui afinitas senyawa flavonoid yang t...
| Main Authors: | , , , , , , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | Indonesian |
| Published: |
Universitas Islam Negeri Raden Fatah Palembang
2018-09-01
|
| Series: | Jurnal Biota |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://jurnal.radenfatah.ac.id/index.php/biota/article/view/2172 |
| _version_ | 1819014067529973760 |
|---|---|
| author | Atim Febry Masula Dian Puspitasari Eili Supriatin S.W Khoirul Ummah Dinik Rokhmatin M. Musthofa Mubarrok Ajheng Triyuni Hariza Isnawati Isnawati Erlix Rakhmad Purnama |
| author_facet | Atim Febry Masula Dian Puspitasari Eili Supriatin S.W Khoirul Ummah Dinik Rokhmatin M. Musthofa Mubarrok Ajheng Triyuni Hariza Isnawati Isnawati Erlix Rakhmad Purnama |
| author_sort | Atim Febry Masula |
| collection | DOAJ |
| description | Lantana camara mengandung beberapa jenis flavonoid seperti Umuhengerin, Lantadene A, Lantadene B, Ictero -genin. Salah satu mekanisme kerja flavonoid sebagai antiinflammatoryis dengan menghambat ceptor siklooksigenase (COX). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui afinitas senyawa flavonoid yang terkandung dalam L. camara dengan reseptor COX-1 sebagai antiinflamasi dan untuk mengetahui ikatan hidrogen yang dapat dibentuk dengan metode molecular docking. Pengujian in silico dilakukan berdasarkan metode desain obat yang dibantu komputer. Alat-alat yang digunakan dalam penelitian ini, perangkat lunak PyRx, perangkat lunak PyMol, Pubchem (senyawa database), PDB (Protein Data Bank), dan Po-seView. Berdasarkan hasil docking dan pembahasan di atas dapat disimpulkan bahwa Icterogenin com-pound dan senyawa Umuhengerin adalah senyawa yang paling efektif dalam proses antiinflamasi, Icterogenin com-pound memiliki nilai RMSD 41,1 Å dan nilai afinity mengikat -8,8 dan senyawa Umuhengerin memiliki val-ue RMSD 1, 61 Å dan nilai afinitas pengikatan -8.0. Ini menunjukkan bahwa senyawa tersebut memiliki nilai RMSD dari senyawa Icterogenin. Namun, senyawa Icterogenin memiliki ikatan hidrogen yang lebih kuat dan lebih efisien daripada senyawa Umuhengerin karena nilai afinitas pengikatan terendah. |
| first_indexed | 2024-12-21T02:09:57Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-ab0f9debbd204b7f8e0850c387ca925a |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 2528-262X 2460-7746 |
| language | Indonesian |
| last_indexed | 2024-12-21T02:09:57Z |
| publishDate | 2018-09-01 |
| publisher | Universitas Islam Negeri Raden Fatah Palembang |
| record_format | Article |
| series | Jurnal Biota |
| spelling | doaj.art-ab0f9debbd204b7f8e0850c387ca925a2022-12-21T19:19:23ZindUniversitas Islam Negeri Raden Fatah PalembangJurnal Biota2528-262X2460-77462018-09-0142798310.19109/Biota.v4i2.21722172DOCKING MOLEKULER SENYAWA METABOLIT SEKUNDER Lantana camara SEBAGAI ANTIINFLAMASI TERHADAP ENZIM COX-1Atim Febry MasulaDian PuspitasariEili Supriatin S.WKhoirul UmmahDinik RokhmatinM. Musthofa MubarrokAjheng Triyuni HarizaIsnawati IsnawatiErlix Rakhmad PurnamaLantana camara mengandung beberapa jenis flavonoid seperti Umuhengerin, Lantadene A, Lantadene B, Ictero -genin. Salah satu mekanisme kerja flavonoid sebagai antiinflammatoryis dengan menghambat ceptor siklooksigenase (COX). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui afinitas senyawa flavonoid yang terkandung dalam L. camara dengan reseptor COX-1 sebagai antiinflamasi dan untuk mengetahui ikatan hidrogen yang dapat dibentuk dengan metode molecular docking. Pengujian in silico dilakukan berdasarkan metode desain obat yang dibantu komputer. Alat-alat yang digunakan dalam penelitian ini, perangkat lunak PyRx, perangkat lunak PyMol, Pubchem (senyawa database), PDB (Protein Data Bank), dan Po-seView. Berdasarkan hasil docking dan pembahasan di atas dapat disimpulkan bahwa Icterogenin com-pound dan senyawa Umuhengerin adalah senyawa yang paling efektif dalam proses antiinflamasi, Icterogenin com-pound memiliki nilai RMSD 41,1 Å dan nilai afinity mengikat -8,8 dan senyawa Umuhengerin memiliki val-ue RMSD 1, 61 Å dan nilai afinitas pengikatan -8.0. Ini menunjukkan bahwa senyawa tersebut memiliki nilai RMSD dari senyawa Icterogenin. Namun, senyawa Icterogenin memiliki ikatan hidrogen yang lebih kuat dan lebih efisien daripada senyawa Umuhengerin karena nilai afinitas pengikatan terendah.http://jurnal.radenfatah.ac.id/index.php/biota/article/view/2172docking; metabolit sekunder; Lantana camara; anti-inflamasi; Enzim COX-1. |
| spellingShingle | Atim Febry Masula Dian Puspitasari Eili Supriatin S.W Khoirul Ummah Dinik Rokhmatin M. Musthofa Mubarrok Ajheng Triyuni Hariza Isnawati Isnawati Erlix Rakhmad Purnama DOCKING MOLEKULER SENYAWA METABOLIT SEKUNDER Lantana camara SEBAGAI ANTIINFLAMASI TERHADAP ENZIM COX-1 Jurnal Biota docking; metabolit sekunder; Lantana camara; anti-inflamasi; Enzim COX-1. |
| title | DOCKING MOLEKULER SENYAWA METABOLIT SEKUNDER Lantana camara SEBAGAI ANTIINFLAMASI TERHADAP ENZIM COX-1 |
| title_full | DOCKING MOLEKULER SENYAWA METABOLIT SEKUNDER Lantana camara SEBAGAI ANTIINFLAMASI TERHADAP ENZIM COX-1 |
| title_fullStr | DOCKING MOLEKULER SENYAWA METABOLIT SEKUNDER Lantana camara SEBAGAI ANTIINFLAMASI TERHADAP ENZIM COX-1 |
| title_full_unstemmed | DOCKING MOLEKULER SENYAWA METABOLIT SEKUNDER Lantana camara SEBAGAI ANTIINFLAMASI TERHADAP ENZIM COX-1 |
| title_short | DOCKING MOLEKULER SENYAWA METABOLIT SEKUNDER Lantana camara SEBAGAI ANTIINFLAMASI TERHADAP ENZIM COX-1 |
| title_sort | docking molekuler senyawa metabolit sekunder lantana camara sebagai antiinflamasi terhadap enzim cox 1 |
| topic | docking; metabolit sekunder; Lantana camara; anti-inflamasi; Enzim COX-1. |
| url | http://jurnal.radenfatah.ac.id/index.php/biota/article/view/2172 |
| work_keys_str_mv | AT atimfebrymasula dockingmolekulersenyawametabolitsekunderlantanacamarasebagaiantiinflamasiterhadapenzimcox1 AT dianpuspitasari dockingmolekulersenyawametabolitsekunderlantanacamarasebagaiantiinflamasiterhadapenzimcox1 AT eilisupriatinsw dockingmolekulersenyawametabolitsekunderlantanacamarasebagaiantiinflamasiterhadapenzimcox1 AT khoirulummah dockingmolekulersenyawametabolitsekunderlantanacamarasebagaiantiinflamasiterhadapenzimcox1 AT dinikrokhmatin dockingmolekulersenyawametabolitsekunderlantanacamarasebagaiantiinflamasiterhadapenzimcox1 AT mmusthofamubarrok dockingmolekulersenyawametabolitsekunderlantanacamarasebagaiantiinflamasiterhadapenzimcox1 AT ajhengtriyunihariza dockingmolekulersenyawametabolitsekunderlantanacamarasebagaiantiinflamasiterhadapenzimcox1 AT isnawatiisnawati dockingmolekulersenyawametabolitsekunderlantanacamarasebagaiantiinflamasiterhadapenzimcox1 AT erlixrakhmadpurnama dockingmolekulersenyawametabolitsekunderlantanacamarasebagaiantiinflamasiterhadapenzimcox1 |