Phylogenetic analysis of large molecular data sets
Los adelantos tecnológicos en biología molecular han aumentado en gran medida la velocidad y eficiencia de la secuenciación de ADN, haciendo posible construir relativamente rápido grandes juegos de datos moleculares para la reconstrucción filogenética. A pesar de su potencial para mejorar nuestro en...
| Main Authors: | , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Sociedad Botánica de México, A. C.
1996-12-01
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| Series: | Botanical Sciences |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://www.botanicalsciences.com.mx/index.php/botanicalSciences/article/view/1509 |
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|---|---|
| author | Pamela S. Soltis Douglas E. Soltis |
| author_facet | Pamela S. Soltis Douglas E. Soltis |
| author_sort | Pamela S. Soltis |
| collection | DOAJ |
| description | Los adelantos tecnológicos en biología molecular han aumentado en gran medida la velocidad y eficiencia de la secuenciación de ADN, haciendo posible construir relativamente rápido grandes juegos de datos moleculares para la reconstrucción filogenética. A pesar de su potencial para mejorar nuestro entendimiento de la filogenia, estos grandes juegos de datos también proveen muchos retos. En este artículo discutimos varios de estos desafíos, incluyendo 1) el fracaso en la búsqueda del árbol más parsimonioso (el óptimo local) en un lapso de tiempo razonable, 2) la diferencia entre un óptimo local y el óptimo global, y 3) la existencia de clases múltiples (islas) de árboles más parsimoniosos. También discutimos posibles estrategias para aumentar la posibilidad de encontrar el o los árboles más parsimoniosos y presentamos dos ejemplos de nuestro trabajo en la filogenia de las angiospermas. Concluimos con una discusión de dos alternativas para el análisis de los juegos enteros de datos: el "enfoque de representantes" y la "compartamentalización". Sugerimos que debe darse consideración adicional al asunto del análisis de juegos grandes de datos, sean morfológicos o moleculares. |
| first_indexed | 2024-04-13T09:12:27Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-b19f3a2b116a4ee0905fe7d3d8417d1a |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 2007-4298 2007-4476 |
| language | English |
| last_indexed | 2024-04-13T09:12:27Z |
| publishDate | 1996-12-01 |
| publisher | Sociedad Botánica de México, A. C. |
| record_format | Article |
| series | Botanical Sciences |
| spelling | doaj.art-b19f3a2b116a4ee0905fe7d3d8417d1a2022-12-22T02:52:50ZengSociedad Botánica de México, A. C.Botanical Sciences2007-42982007-44761996-12-015910.17129/botsci.1509Phylogenetic analysis of large molecular data setsPamela S. Soltis0Douglas E. Soltis1Departament of botany, Washington State UniversityDepartament of botany, Washington State UniversityLos adelantos tecnológicos en biología molecular han aumentado en gran medida la velocidad y eficiencia de la secuenciación de ADN, haciendo posible construir relativamente rápido grandes juegos de datos moleculares para la reconstrucción filogenética. A pesar de su potencial para mejorar nuestro entendimiento de la filogenia, estos grandes juegos de datos también proveen muchos retos. En este artículo discutimos varios de estos desafíos, incluyendo 1) el fracaso en la búsqueda del árbol más parsimonioso (el óptimo local) en un lapso de tiempo razonable, 2) la diferencia entre un óptimo local y el óptimo global, y 3) la existencia de clases múltiples (islas) de árboles más parsimoniosos. También discutimos posibles estrategias para aumentar la posibilidad de encontrar el o los árboles más parsimoniosos y presentamos dos ejemplos de nuestro trabajo en la filogenia de las angiospermas. Concluimos con una discusión de dos alternativas para el análisis de los juegos enteros de datos: el "enfoque de representantes" y la "compartamentalización". Sugerimos que debe darse consideración adicional al asunto del análisis de juegos grandes de datos, sean morfológicos o moleculares.https://www.botanicalsciences.com.mx/index.php/botanicalSciences/article/view/1509óptimo localóptimo globalislasenfoque de representantescompartamentalización |
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