بررسی الگوی بیانی خانواده فاکتورهای رونویسی شوک حرارتی (HSFs) در گیاه آلوروپوس لیتورالیس تحت تنش شوری
فاکتورهای شوک حرارتی (Heat Shock Factors)، نقش مهمی در پاسخ به تنش‌های زیستی و غیرزیستی در یوکاریوت‌ها ایفا می‌نمایند. هدف از اجرای این تحقیق، شناسایی ژن‌های فاکتور رونویسی <em>AlHSF</em> در گیاه هالوفیت آلوروپوس لیتورالیس (<em>Aeluropus littoralis</em>) می‌باشد. بدین منظور ش...
| Main Authors: | , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | fas |
| Published: |
University of Birjand
2020-06-01
|
| Series: | تنش های محیطی در علوم زراعی |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://escs.birjand.ac.ir/article_1352_e02a4fe331ce0ed1eb221c521f721f88.pdf |
| _version_ | 1797230275668738048 |
|---|---|
| author | سیدحمیدرضا هاشمی قربانعلی نعمت زاده سمیرا محمدی مارکوس کولمن |
| author_facet | سیدحمیدرضا هاشمی قربانعلی نعمت زاده سمیرا محمدی مارکوس کولمن |
| author_sort | سیدحمیدرضا هاشمی |
| collection | DOAJ |
| description | فاکتورهای شوک حرارتی (Heat Shock Factors)، نقش مهمی در پاسخ به تنش‌های زیستی و غیرزیستی در یوکاریوت‌ها ایفا می‌نمایند. هدف از اجرای این تحقیق، شناسایی ژن‌های فاکتور رونویسی <em>AlHSF</em> در گیاه هالوفیت آلوروپوس لیتورالیس (<em>Aeluropus littoralis</em>) می‌باشد. بدین منظور شناسایی و تعیین مشخصه‌سازی ژن‌ها، ساختار ژنی، آنالیز موتیف‌های پروتئینی و روابط فیلوژنتیکی خانواده ژنی <em>AlHSF</em> مدنظر قرار گرفت. آنالیز الگوی بیان این ژن‌ها در دو بافت برگ و ریشه، تحت شرایط تنش شوری و شرایط ریکاوری، با استفاده از داده‌های RNA-seq صورت پذیرفت. بر اساس توالی‌های ژنومی <em>A.</em> <em>littoralis</em>، 11 ژن <em>AlHSF</em> غیرتکراری و منحصربفرد شناخته شدند. تمام 11 فاکتور رونویسی AlHSFs، بر اساس همولوژی با آرابیدوپسیس، به سه دسته (A، B و C) تقسیم شدند. بر اساس داده‌های RNA-seq، الگوی بیان ژن‌های <em>AlHSF</em> در بافت‌های برگ و ریشه تحت شرایط تنش شوری و ریکاوری، متفاوت بود. سطح بیان متفاوت این ژن‌ها، می‌تواند به عملکردهای مولکولی و مکانیسم‌های تنظیمی متفاوت در کنترل فعالیت این ژن‌ها مرتبط باشد. یافته‌های این تحقیق، ضمن ارائه خصوصیات عملکردی ژن‌های <em>AlHSF</em>، پایه‌ای برای تحقیقات کاربردی آینده در مورد نقش بیولوژیکی آن‌ها در تحمل گیاه آلوروپوس لیتورالیس به تنش‌های زیستی و غیرزیستی، فراهم می‌نماید.<br /><br /> |
| first_indexed | 2024-04-24T15:25:54Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-b47bc308ef1f4d3d8bbb4e8fabaf217b |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 2228-7604 2383-3084 |
| language | fas |
| last_indexed | 2024-04-24T15:25:54Z |
| publishDate | 2020-06-01 |
| publisher | University of Birjand |
| record_format | Article |
| series | تنش های محیطی در علوم زراعی |
| spelling | doaj.art-b47bc308ef1f4d3d8bbb4e8fabaf217b2024-04-02T06:17:13ZfasUniversity of Birjandتنش های محیطی در علوم زراعی2228-76042383-30842020-06-0113257158110.22077/escs.2019.2109.15341352بررسی الگوی بیانی خانواده فاکتورهای رونویسی شوک حرارتی (HSFs) در گیاه آلوروپوس لیتورالیس تحت تنش شوریسیدحمیدرضا هاشمی0قربانعلی نعمت زاده1سمیرا محمدی2مارکوس کولمن3استادیار گروه مهندسی ژنتیک و بیولوژی، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساریاستاد گروه مهندسی ژنتیک و بیولوژی، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساریدانشجوی دکتری اصلاح نباتات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساریگروه ژنتیک مولکولی، مؤسسه ژنتیک گیاهی و تحقیقات گیاهان زراعی لیبنیز (IPK)، آلمانفاکتورهای شوک حرارتی (Heat Shock Factors)، نقش مهمی در پاسخ به تنش‌های زیستی و غیرزیستی در یوکاریوت‌ها ایفا می‌نمایند. هدف از اجرای این تحقیق، شناسایی ژن‌های فاکتور رونویسی <em>AlHSF</em> در گیاه هالوفیت آلوروپوس لیتورالیس (<em>Aeluropus littoralis</em>) می‌باشد. بدین منظور شناسایی و تعیین مشخصه‌سازی ژن‌ها، ساختار ژنی، آنالیز موتیف‌های پروتئینی و روابط فیلوژنتیکی خانواده ژنی <em>AlHSF</em> مدنظر قرار گرفت. آنالیز الگوی بیان این ژن‌ها در دو بافت برگ و ریشه، تحت شرایط تنش شوری و شرایط ریکاوری، با استفاده از داده‌های RNA-seq صورت پذیرفت. بر اساس توالی‌های ژنومی <em>A.</em> <em>littoralis</em>، 11 ژن <em>AlHSF</em> غیرتکراری و منحصربفرد شناخته شدند. تمام 11 فاکتور رونویسی AlHSFs، بر اساس همولوژی با آرابیدوپسیس، به سه دسته (A، B و C) تقسیم شدند. بر اساس داده‌های RNA-seq، الگوی بیان ژن‌های <em>AlHSF</em> در بافت‌های برگ و ریشه تحت شرایط تنش شوری و ریکاوری، متفاوت بود. سطح بیان متفاوت این ژن‌ها، می‌تواند به عملکردهای مولکولی و مکانیسم‌های تنظیمی متفاوت در کنترل فعالیت این ژن‌ها مرتبط باشد. یافته‌های این تحقیق، ضمن ارائه خصوصیات عملکردی ژن‌های <em>AlHSF</em>، پایه‌ای برای تحقیقات کاربردی آینده در مورد نقش بیولوژیکی آن‌ها در تحمل گیاه آلوروپوس لیتورالیس به تنش‌های زیستی و غیرزیستی، فراهم می‌نماید.<br /><br />http://escs.birjand.ac.ir/article_1352_e02a4fe331ce0ed1eb221c521f721f88.pdfآنالیز ترانسکریپتومیکسآنالیز موتیف‌های پروتئینیپروتئین‌های شوک حرارتیساختار ژنی |
| spellingShingle | سیدحمیدرضا هاشمی قربانعلی نعمت زاده سمیرا محمدی مارکوس کولمن بررسی الگوی بیانی خانواده فاکتورهای رونویسی شوک حرارتی (HSFs) در گیاه آلوروپوس لیتورالیس تحت تنش شوری تنش های محیطی در علوم زراعی آنالیز ترانسکریپتومیکس آنالیز موتیف‌های پروتئینی پروتئین‌های شوک حرارتی ساختار ژنی |
| title | بررسی الگوی بیانی خانواده فاکتورهای رونویسی شوک حرارتی (HSFs) در گیاه آلوروپوس لیتورالیس تحت تنش شوری |
| title_full | بررسی الگوی بیانی خانواده فاکتورهای رونویسی شوک حرارتی (HSFs) در گیاه آلوروپوس لیتورالیس تحت تنش شوری |
| title_fullStr | بررسی الگوی بیانی خانواده فاکتورهای رونویسی شوک حرارتی (HSFs) در گیاه آلوروپوس لیتورالیس تحت تنش شوری |
| title_full_unstemmed | بررسی الگوی بیانی خانواده فاکتورهای رونویسی شوک حرارتی (HSFs) در گیاه آلوروپوس لیتورالیس تحت تنش شوری |
| title_short | بررسی الگوی بیانی خانواده فاکتورهای رونویسی شوک حرارتی (HSFs) در گیاه آلوروپوس لیتورالیس تحت تنش شوری |
| title_sort | بررسی الگوی بیانی خانواده فاکتورهای رونویسی شوک حرارتی hsfs در گیاه آلوروپوس لیتورالیس تحت تنش شوری |
| topic | آنالیز ترانسکریپتومیکس آنالیز موتیف‌های پروتئینی پروتئین‌های شوک حرارتی ساختار ژنی |
| url | http://escs.birjand.ac.ir/article_1352_e02a4fe331ce0ed1eb221c521f721f88.pdf |
| work_keys_str_mv | AT sydḥmydrḍạhạsẖmy brrsyạlgwybyạnykẖạnwạdhfạḵtwrhạyrwnwysysẖwḵḥrạrtyhsfsdrgyạhậlwrwpwslytwrạlystḥttnsẖsẖwry AT qrbạnʿlynʿmtzạdh brrsyạlgwybyạnykẖạnwạdhfạḵtwrhạyrwnwysysẖwḵḥrạrtyhsfsdrgyạhậlwrwpwslytwrạlystḥttnsẖsẖwry AT smyrạmḥmdy brrsyạlgwybyạnykẖạnwạdhfạḵtwrhạyrwnwysysẖwḵḥrạrtyhsfsdrgyạhậlwrwpwslytwrạlystḥttnsẖsẖwry AT mạrḵwsḵwlmn brrsyạlgwybyạnykẖạnwạdhfạḵtwrhạyrwnwysysẖwḵḥrạrtyhsfsdrgyạhậlwrwpwslytwrạlystḥttnsẖsẖwry |