پروفایل ترانسکریپتومی اندومتریوم برای رشد و طویل‌شدگی رویان گاوهای شیری
در تحقیق حاضر، به منظور شناسایی ژن‌های درگیر در طویل‌شدگی رویان گاوهای شیری، شناسایی آثار متقابل بین ژنی و واکاوی ماژولهای مهم و عملکردی در طول این فرآیند از داده‌های ترانسکریپتومی استفاده شد. رشد، تکوین موفقیت‌آمیز رویان و زنده‌مانی آن یکی از مهم‌ترین نیازهای اساسی در صنعت گاو شیری است. بخش بزرگی...
| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | fas |
| Published: |
University of Guilan
2020-07-01
|
| Series: | تحقیقات تولیدات دامی |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://ar.guilan.ac.ir/article_4195_7eb1536d273e75673f3b91b6dd043f8e.pdf |
| _version_ | 1818242602911137792 |
|---|---|
| author | جعفر جمعدار زنوزق محمد مرادی شهربابک اردشیر نجاتی جوارمی |
| author_facet | جعفر جمعدار زنوزق محمد مرادی شهربابک اردشیر نجاتی جوارمی |
| author_sort | جعفر جمعدار زنوزق |
| collection | DOAJ |
| description | در تحقیق حاضر، به منظور شناسایی ژن‌های درگیر در طویل‌شدگی رویان گاوهای شیری، شناسایی آثار متقابل بین ژنی و واکاوی ماژولهای مهم و عملکردی در طول این فرآیند از داده‌های ترانسکریپتومی استفاده شد. رشد، تکوین موفقیت‌آمیز رویان و زنده‌مانی آن یکی از مهم‌ترین نیازهای اساسی در صنعت گاو شیری است. بخش بزرگی از آبستنی‌های از دست رفته در طول هفته‌های اولیه و به ویژه در گام طویل‌شدگی رویان اتفاق می‌افتد. بدین ترتیب برای درک بهتر اساس مولکولی این فرآیند، پروفایل یاخته‌ای اندومتریوم رحمی گاوهای آبستن در طول رشد و مرحله طویل‌شدگی رویان در مقایسه با گاوهای غیرآبستن بررسی شد. بعد از پردازش و تجزیه داده‌های ریزآرایه و RNA-Seq و ترکیب نتایج حاصل، آثار متقابل بین ژنی با استفاده از روش داده‌کاوی مورد بررسی قرار گرفت. در نهایت با مقایسه پروفایل اندومتریوم و بازسازی شبکه و جستجوی ماژولهای مهم، شمار چهار ماژول عملکردی معنی‌دار شناسایی شد. مهم‌ترین ژن‌های موجود شامل ANKRD54، ADAMDEC1، PTN، MT1A، LIMS2، MT1E، CPA3 وMTPN بودند. بر اساس این تحقیق توصیه می‌شود ماژولهای شناسایی شده می‌توانند نشانگرهای مناسبی برای رشد، طویل‌شدگی، تکوین، ترشح مایع مجرای رحمی، پاسخ ایمنی و زنده‌مانی رویان باشند. |
| first_indexed | 2024-12-12T13:47:51Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-b9f6c8b76e3b46e784e6c6db22372f14 |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 2252-0872 2538-6107 |
| language | fas |
| last_indexed | 2024-12-12T13:47:51Z |
| publishDate | 2020-07-01 |
| publisher | University of Guilan |
| record_format | Article |
| series | تحقیقات تولیدات دامی |
| spelling | doaj.art-b9f6c8b76e3b46e784e6c6db22372f142022-12-22T00:22:38ZfasUniversity of Guilanتحقیقات تولیدات دامی2252-08722538-61072020-07-019211310.22124/ar.2020.14179.14394195پروفایل ترانسکریپتومی اندومتریوم برای رشد و طویل‌شدگی رویان گاوهای شیریجعفر جمعدار زنوزق0محمد مرادی شهربابک1اردشیر نجاتی جوارمی2دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهراناستاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهراناستاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهراندر تحقیق حاضر، به منظور شناسایی ژن‌های درگیر در طویل‌شدگی رویان گاوهای شیری، شناسایی آثار متقابل بین ژنی و واکاوی ماژولهای مهم و عملکردی در طول این فرآیند از داده‌های ترانسکریپتومی استفاده شد. رشد، تکوین موفقیت‌آمیز رویان و زنده‌مانی آن یکی از مهم‌ترین نیازهای اساسی در صنعت گاو شیری است. بخش بزرگی از آبستنی‌های از دست رفته در طول هفته‌های اولیه و به ویژه در گام طویل‌شدگی رویان اتفاق می‌افتد. بدین ترتیب برای درک بهتر اساس مولکولی این فرآیند، پروفایل یاخته‌ای اندومتریوم رحمی گاوهای آبستن در طول رشد و مرحله طویل‌شدگی رویان در مقایسه با گاوهای غیرآبستن بررسی شد. بعد از پردازش و تجزیه داده‌های ریزآرایه و RNA-Seq و ترکیب نتایج حاصل، آثار متقابل بین ژنی با استفاده از روش داده‌کاوی مورد بررسی قرار گرفت. در نهایت با مقایسه پروفایل اندومتریوم و بازسازی شبکه و جستجوی ماژولهای مهم، شمار چهار ماژول عملکردی معنی‌دار شناسایی شد. مهم‌ترین ژن‌های موجود شامل ANKRD54، ADAMDEC1، PTN، MT1A، LIMS2، MT1E، CPA3 وMTPN بودند. بر اساس این تحقیق توصیه می‌شود ماژولهای شناسایی شده می‌توانند نشانگرهای مناسبی برای رشد، طویل‌شدگی، تکوین، ترشح مایع مجرای رحمی، پاسخ ایمنی و زنده‌مانی رویان باشند.https://ar.guilan.ac.ir/article_4195_7eb1536d273e75673f3b91b6dd043f8e.pdfبلاستوسیستشبکه ژنیگاو آبستنماژول |
| spellingShingle | جعفر جمعدار زنوزق محمد مرادی شهربابک اردشیر نجاتی جوارمی پروفایل ترانسکریپتومی اندومتریوم برای رشد و طویل‌شدگی رویان گاوهای شیری تحقیقات تولیدات دامی بلاستوسیست شبکه ژنی گاو آبستن ماژول |
| title | پروفایل ترانسکریپتومی اندومتریوم برای رشد و طویل‌شدگی رویان گاوهای شیری |
| title_full | پروفایل ترانسکریپتومی اندومتریوم برای رشد و طویل‌شدگی رویان گاوهای شیری |
| title_fullStr | پروفایل ترانسکریپتومی اندومتریوم برای رشد و طویل‌شدگی رویان گاوهای شیری |
| title_full_unstemmed | پروفایل ترانسکریپتومی اندومتریوم برای رشد و طویل‌شدگی رویان گاوهای شیری |
| title_short | پروفایل ترانسکریپتومی اندومتریوم برای رشد و طویل‌شدگی رویان گاوهای شیری |
| title_sort | پروفایل ترانسکریپتومی اندومتریوم برای رشد و طویل‌شدگی رویان گاوهای شیری |
| topic | بلاستوسیست شبکه ژنی گاو آبستن ماژول |
| url | https://ar.guilan.ac.ir/article_4195_7eb1536d273e75673f3b91b6dd043f8e.pdf |
| work_keys_str_mv | AT jʿfrjmʿdạrznwzq prwfạyltrạnsḵryptwmyạndwmtrywmbrạyrsẖdwṭwylsẖdgyrwyạngạwhạysẖyry AT mḥmdmrạdysẖhrbạbḵ prwfạyltrạnsḵryptwmyạndwmtrywmbrạyrsẖdwṭwylsẖdgyrwyạngạwhạysẖyry AT ạrdsẖyrnjạtyjwạrmy prwfạyltrạnsḵryptwmyạndwmtrywmbrạyrsẖdwṭwylsẖdgyrwyạngạwhạysẖyry |