بررسی ساختار ژنتیکی اسب نژاد عرب با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
هدف از این تحقیق، بررسی تنوع ژنتیکی اسبهای عرب ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره بود. به این منظور از تعداد 10 نشانگر ریزماهواره شامل AHT04، AHT05، ASB02، ASB17، ASB23، HMS03، HMS06، HMS07 و VHL20 مورد تایید انجمن بینالمللی ژنتیک دام استفاده شد. تعداد 8673 نمونه موی اسب از استانهای خوزستان...
Main Authors: | , , , |
---|---|
Format: | Article |
Language: | fas |
Published: |
University of Guilan
2023-05-01
|
Series: | تحقیقات تولیدات دامی |
Subjects: | |
Online Access: | https://ar.guilan.ac.ir/article_6317_6b7cbff9aecef34d95d140315f26d613.pdf |
_version_ | 1797770698742038528 |
---|---|
author | حمیدرضا سیدآبادی جواد احمدپناه علی جوانروح حسن بانه |
author_facet | حمیدرضا سیدآبادی جواد احمدپناه علی جوانروح حسن بانه |
author_sort | حمیدرضا سیدآبادی |
collection | DOAJ |
description | هدف از این تحقیق، بررسی تنوع ژنتیکی اسبهای عرب ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره بود. به این منظور از تعداد 10 نشانگر ریزماهواره شامل AHT04، AHT05، ASB02، ASB17، ASB23، HMS03، HMS06، HMS07 و VHL20 مورد تایید انجمن بینالمللی ژنتیک دام استفاده شد. تعداد 8673 نمونه موی اسب از استانهای خوزستان، یزد، کرمان، اصفهان، لرستان و البرز جمع آوری شد و سپس استخراج DNA از نمونههای اخذ شده انجام گرفت. نشانگرهای ریزماهواره با روش Multiplex PCR تکثیر شدند. سپس محصولات تکثیر شده به وسیله سیستم Genetic analyzer و با روش الکتروفورز مویینه تعیین ژنوتیپ شدند. بیشترین و کمترین تعداد آلل مشاهده شده به ازای هر نشانگر، به ترتیب مربوط به نشانگرهای ASB17 (۱۷ آلل)، HMS06 (هشت آلل) و HMS07 (هشت آلل) بودند. مجموع تعداد کل آللهای مشاهده شده در همه جایگاهها و میانگین تعداد آلل مشاهده شده به ترتیب برابر با 113 و 3/11 بودند. میانگین تعداد آلل موثر، شاخص شانون، میزان هتروزیگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار و شاخص تثبت به ترتیب 97/3، 58/1، 721/0، 736/0 و 021/0 بهدست آمد. میانگین تنوع ژنتیکی در جمعیت اسب عرب مورد بررسی برابر با 736/۰ محاسبه شد. بیشترین تنوع ژنتیکی در نشانگر VHL20 با فراوانی برابر با 803/۰ و کمترین میزان تنوع ژنتیکی مربوط به نشانگر ASB2 با مقدار ۶۲0/۰ بود. فراسنجههای جمعیتی در اسب عرب نشان داد که چندشکلی و تنوع ژنتیکی در این نژاد نسبتاٌ بالا است. وجود تنوع ژنتیکی در این نژاد جهت اجرای برنامههای اصلاحی و حفاظت نژادی از اهمیت ویژهای برخوردار است. |
first_indexed | 2024-03-12T21:26:54Z |
format | Article |
id | doaj.art-ba2808ffdc964a8ab4c50bd5b9ed56c7 |
institution | Directory Open Access Journal |
issn | 2252-0872 2538-6107 |
language | fas |
last_indexed | 2024-03-12T21:26:54Z |
publishDate | 2023-05-01 |
publisher | University of Guilan |
record_format | Article |
series | تحقیقات تولیدات دامی |
spelling | doaj.art-ba2808ffdc964a8ab4c50bd5b9ed56c72023-07-28T07:01:34ZfasUniversity of Guilanتحقیقات تولیدات دامی2252-08722538-61072023-05-01121536410.22124/ar.2023.22264.17036317بررسی ساختار ژنتیکی اسب نژاد عرب با استفاده از نشانگرهای ریزماهوارهحمیدرضا سیدآبادی0جواد احمدپناه1علی جوانروح2حسن بانه3دانشیار، بخش تحقیقات بیوتکنولوژی، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایراناستادیار، بخش تحقیقات علوم دامی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان ایلام، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، ایلام، ایراناستادیار، بخش تحقیقات ژنتیک و اصلاح نژاد دام، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایراناستادیار، بخش تحقیقات ژنتیک و اصلاح نژاد دام، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایرانهدف از این تحقیق، بررسی تنوع ژنتیکی اسبهای عرب ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره بود. به این منظور از تعداد 10 نشانگر ریزماهواره شامل AHT04، AHT05، ASB02، ASB17، ASB23، HMS03، HMS06، HMS07 و VHL20 مورد تایید انجمن بینالمللی ژنتیک دام استفاده شد. تعداد 8673 نمونه موی اسب از استانهای خوزستان، یزد، کرمان، اصفهان، لرستان و البرز جمع آوری شد و سپس استخراج DNA از نمونههای اخذ شده انجام گرفت. نشانگرهای ریزماهواره با روش Multiplex PCR تکثیر شدند. سپس محصولات تکثیر شده به وسیله سیستم Genetic analyzer و با روش الکتروفورز مویینه تعیین ژنوتیپ شدند. بیشترین و کمترین تعداد آلل مشاهده شده به ازای هر نشانگر، به ترتیب مربوط به نشانگرهای ASB17 (۱۷ آلل)، HMS06 (هشت آلل) و HMS07 (هشت آلل) بودند. مجموع تعداد کل آللهای مشاهده شده در همه جایگاهها و میانگین تعداد آلل مشاهده شده به ترتیب برابر با 113 و 3/11 بودند. میانگین تعداد آلل موثر، شاخص شانون، میزان هتروزیگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار و شاخص تثبت به ترتیب 97/3، 58/1، 721/0، 736/0 و 021/0 بهدست آمد. میانگین تنوع ژنتیکی در جمعیت اسب عرب مورد بررسی برابر با 736/۰ محاسبه شد. بیشترین تنوع ژنتیکی در نشانگر VHL20 با فراوانی برابر با 803/۰ و کمترین میزان تنوع ژنتیکی مربوط به نشانگر ASB2 با مقدار ۶۲0/۰ بود. فراسنجههای جمعیتی در اسب عرب نشان داد که چندشکلی و تنوع ژنتیکی در این نژاد نسبتاٌ بالا است. وجود تنوع ژنتیکی در این نژاد جهت اجرای برنامههای اصلاحی و حفاظت نژادی از اهمیت ویژهای برخوردار است.https://ar.guilan.ac.ir/article_6317_6b7cbff9aecef34d95d140315f26d613.pdfاسب عربتنوع ژنتیکیفراسنجههای جمعیتینشانگر ریزماهواره |
spellingShingle | حمیدرضا سیدآبادی جواد احمدپناه علی جوانروح حسن بانه بررسی ساختار ژنتیکی اسب نژاد عرب با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره تحقیقات تولیدات دامی اسب عرب تنوع ژنتیکی فراسنجههای جمعیتی نشانگر ریزماهواره |
title | بررسی ساختار ژنتیکی اسب نژاد عرب با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره |
title_full | بررسی ساختار ژنتیکی اسب نژاد عرب با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره |
title_fullStr | بررسی ساختار ژنتیکی اسب نژاد عرب با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره |
title_full_unstemmed | بررسی ساختار ژنتیکی اسب نژاد عرب با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره |
title_short | بررسی ساختار ژنتیکی اسب نژاد عرب با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره |
title_sort | بررسی ساختار ژنتیکی اسب نژاد عرب با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره |
topic | اسب عرب تنوع ژنتیکی فراسنجههای جمعیتی نشانگر ریزماهواره |
url | https://ar.guilan.ac.ir/article_6317_6b7cbff9aecef34d95d140315f26d613.pdf |
work_keys_str_mv | AT ḥmydrḍạsydậbạdy brrsysạkẖtạrzẖntyḵyạsbnzẖạdʿrbbạạstfạdhạznsẖạngrhạyryzmạhwạrh AT jwạdạḥmdpnạh brrsysạkẖtạrzẖntyḵyạsbnzẖạdʿrbbạạstfạdhạznsẖạngrhạyryzmạhwạrh AT ʿlyjwạnrwḥ brrsysạkẖtạrzẖntyḵyạsbnzẖạdʿrbbạạstfạdhạznsẖạngrhạyryzmạhwạrh AT ḥsnbạnh brrsysạkẖtạrzẖntyḵyạsbnzẖạdʿrbbạạstfạdhạznsẖạngrhạyryzmạhwạrh |