PCR-RAPD and PCR-RFLP polymorphisms detected in Anopheles cruzii (Diptera, Culicidae) Polimorfismos PCR-RAPD e PCR-RFLP detectados em Anopheles cruzii (Diptera, Culicidae)
The aim of the present study was to examine genetic variability in populations of An. cruzii by employing PCR-RAPD and PCR-RFLP markers. All analyses were carried out using individuals of the F1 generation of wild caught females obtained in Santa Catarina State (Florianópolis and São Francisco do Su...
| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Sociedade Brasileira de Entomologia
2006-09-01
|
| Series: | Revista Brasileira de Entomologia |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0085-56262006000300014 |
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|---|---|
| author | Daniéla Calado Mario Antonio Navarro-Silva Maria Anice Mureb Sallum |
| author_facet | Daniéla Calado Mario Antonio Navarro-Silva Maria Anice Mureb Sallum |
| author_sort | Daniéla Calado |
| collection | DOAJ |
| description | The aim of the present study was to examine genetic variability in populations of An. cruzii by employing PCR-RAPD and PCR-RFLP markers. All analyses were carried out using individuals of the F1 generation of wild caught females obtained in Santa Catarina State (Florianópolis and São Francisco do Sul), Paraná State (Morretes, Paranaguá and Guaratuba) and São Paulo State (Cananéia). In the PCR-RAPD experiments, seven primers were used for comparisons within and among populations. The restriction profile of the ITS2 including a fragment of both 5.8S and 28S regions of the rDNA was obtained with the enzymes BstUI, HaeIII, TaqI, HhaI, Sau96I, HinfI, HincII and NruI. The PCR-RAPD method detected a large number of polymorphic bands. Genetic distance among populations of An. cruzii varied from 0,0214 to 0,0673, suggesting that all individuals used in the analyses belong to a single species. The number of migrants per generation (Nm) was 4.3, showing the existence of gene flow among populations. The restriction profile of the ITS2, 5.8S and 28S gene regions was similar in all An. cruzii samples, whereas the results obtained by using HhaI and NruI are indicative that the individuals analyzed have nucleotide sequences distinct from those of An. cruzii samples from Peruíbe and Juquiazinho deposited in GenBank.<br>O objetivo desse trabalho foi analisar a variabilidade genética em populações de An. cruzii utilizando as técnicas PCR-RAPD e PCR-RFLP. As análises foram realizadas a partir de adultos da geração F1 de fêmeas coletadas nos estados de Santa Catarina (Florianópolis e São Francisco do Sul), Paraná (Morretes, Paranaguá e Guaratuba) e São Paulo (Cananéia). Na PCR-RAPD, sete iniciadores foram utilizados para comparação dentro e entre populações. Os perfis de restrição da região ITS2 e parte do genes 5.8S e 28S foram obtidos com as enzimas BstUI, HaeIII, TaqI, HhaI, Sau96I, HinfI, HincII e NruI. Utilizando-se a técnica PCR-RAPD, elevado número de bandas polimórficas foi detectado. As distâncias genéticas entre as populações variaram de 0,0214 a 0,0673, sugerindo que as amostras representam uma única espécie. O número de migrantes por geração (Nm) foi de 4,3, indicando a existência de fluxo gênico entre as populações. Os padrões de restrição da região ITS2 foram semelhantes para todas as amostras de An. cruzii, entretanto, os resultados obtidos com HhaI e NruI indicam que os indivíduos analisados apresentam seqüências diferentes daquelas disponíveis no GenBank para as populações de Peruíbe e Juquiazinho. |
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| publisher | Sociedade Brasileira de Entomologia |
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| spelling | doaj.art-c805c41d20ae4900a6f71a6aa725237e2022-12-22T00:00:41ZengSociedade Brasileira de EntomologiaRevista Brasileira de Entomologia0085-56261806-96652006-09-0150342343010.1590/S0085-56262006000300014PCR-RAPD and PCR-RFLP polymorphisms detected in Anopheles cruzii (Diptera, Culicidae) Polimorfismos PCR-RAPD e PCR-RFLP detectados em Anopheles cruzii (Diptera, Culicidae)Daniéla CaladoMario Antonio Navarro-SilvaMaria Anice Mureb SallumThe aim of the present study was to examine genetic variability in populations of An. cruzii by employing PCR-RAPD and PCR-RFLP markers. All analyses were carried out using individuals of the F1 generation of wild caught females obtained in Santa Catarina State (Florianópolis and São Francisco do Sul), Paraná State (Morretes, Paranaguá and Guaratuba) and São Paulo State (Cananéia). In the PCR-RAPD experiments, seven primers were used for comparisons within and among populations. The restriction profile of the ITS2 including a fragment of both 5.8S and 28S regions of the rDNA was obtained with the enzymes BstUI, HaeIII, TaqI, HhaI, Sau96I, HinfI, HincII and NruI. The PCR-RAPD method detected a large number of polymorphic bands. Genetic distance among populations of An. cruzii varied from 0,0214 to 0,0673, suggesting that all individuals used in the analyses belong to a single species. The number of migrants per generation (Nm) was 4.3, showing the existence of gene flow among populations. The restriction profile of the ITS2, 5.8S and 28S gene regions was similar in all An. cruzii samples, whereas the results obtained by using HhaI and NruI are indicative that the individuals analyzed have nucleotide sequences distinct from those of An. cruzii samples from Peruíbe and Juquiazinho deposited in GenBank.<br>O objetivo desse trabalho foi analisar a variabilidade genética em populações de An. cruzii utilizando as técnicas PCR-RAPD e PCR-RFLP. As análises foram realizadas a partir de adultos da geração F1 de fêmeas coletadas nos estados de Santa Catarina (Florianópolis e São Francisco do Sul), Paraná (Morretes, Paranaguá e Guaratuba) e São Paulo (Cananéia). Na PCR-RAPD, sete iniciadores foram utilizados para comparação dentro e entre populações. Os perfis de restrição da região ITS2 e parte do genes 5.8S e 28S foram obtidos com as enzimas BstUI, HaeIII, TaqI, HhaI, Sau96I, HinfI, HincII e NruI. Utilizando-se a técnica PCR-RAPD, elevado número de bandas polimórficas foi detectado. As distâncias genéticas entre as populações variaram de 0,0214 a 0,0673, sugerindo que as amostras representam uma única espécie. O número de migrantes por geração (Nm) foi de 4,3, indicando a existência de fluxo gênico entre as populações. Os padrões de restrição da região ITS2 foram semelhantes para todas as amostras de An. cruzii, entretanto, os resultados obtidos com HhaI e NruI indicam que os indivíduos analisados apresentam seqüências diferentes daquelas disponíveis no GenBank para as populações de Peruíbe e Juquiazinho.http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0085-56262006000300014AnophelinaeITS2marcadores molecularesvariabilidade genéticaAnophelinaegenetic variabilityITS2molecular markers |
| spellingShingle | Daniéla Calado Mario Antonio Navarro-Silva Maria Anice Mureb Sallum PCR-RAPD and PCR-RFLP polymorphisms detected in Anopheles cruzii (Diptera, Culicidae) Polimorfismos PCR-RAPD e PCR-RFLP detectados em Anopheles cruzii (Diptera, Culicidae) Revista Brasileira de Entomologia Anophelinae ITS2 marcadores moleculares variabilidade genética Anophelinae genetic variability ITS2 molecular markers |
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