Optimasi Kodon dan Konstruksi Plasmid Rekombinan Protein RBD SARS-CoV-2 pada E. coli BL21(DE3)
Coronavirus Disease 2019 (COVID-19), yang disebabkan oleh Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), telah menyebabkan lebih dari 7 juta kematian di seluruh dunia. Strategi komprehensif diperlukan untuk mengatasi pandemi ini, terutama vaksinasi untuk mengurangi infeksi lebih lanju...
| Main Authors: | , , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | Indonesian |
| Published: |
LPPM STIKES Guna Bangsa Yogyakarta
2024-01-01
|
| Series: | Journal of Health (JOH) |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://journal.gunabangsa.ac.id/index.php/joh/article/view/715 |
| _version_ | 1797347713563492352 |
|---|---|
| author | Elly Widyarni Eka Purnamasari Dini Wahyu Kartika Sari Tenri Ashari Wanahari Khairun Nissa Asmarani Kusumawati |
| author_facet | Elly Widyarni Eka Purnamasari Dini Wahyu Kartika Sari Tenri Ashari Wanahari Khairun Nissa Asmarani Kusumawati |
| author_sort | Elly Widyarni Eka Purnamasari |
| collection | DOAJ |
| description | Coronavirus Disease 2019 (COVID-19), yang disebabkan oleh Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), telah menyebabkan lebih dari 7 juta kematian di seluruh dunia. Strategi komprehensif diperlukan untuk mengatasi pandemi ini, terutama vaksinasi untuk mengurangi infeksi lebih lanjut. Pengembangan vaksin bergantung pada pemanfaatan protein imunogenik dari virus SARS-CoV-2, khususnya pada Receptor-binding Domain (RBD) yang terletak dalam Subunit 1 Spike Glycoprotein. Protein ini berperan penting dalam interaksi virus dengan sel inang melalui reseptor ACE2 untuk menginfeksi inang bersama dengan Subunit 2 untuk memediasi fusi pada membran sel. Meskipun beberapa vaksin telah tersedia, kebutuhan terhadap alternatif vaksin yang lebih terjangkau dan mudah diakses masih terus dikembangkan, terutama untuk negara-negara berkembang dan berpenghasilan rendah. Salah satu alternatif yang dapat dikembangkan dapat berupa vaksin berbasis protein rekombinan. Dalam penelitian ini, urutan gen RBD dioptimasi untuk digunakan pada konstruksi plasmid rekombinan pada ekspresi protein heterolog dalam sistem ekspresi prokaryot yaitu Escherichia coli BL21(DE3). Kodon yang telah dioptimasi kemudian disisipkan ke dalam vektor plasmid pET-15b dan dikonstruksikan menjadi plasmid rekombinan untuk transformasi ke dalam sel inang dengan metode heat-shock. Penelitian ini dievaluasi dan divalidasi melalui PCR koloni, isolasi plasmid, dan sekuensing. Hasil pada penelitian ini dapat menjadi dasar bagi penelitian lanjutan pada ekspresi dan purifikasi protein RBD SARS-CoV-2 pada E. coli BL21(DE3) sebagai kandidat vaksin protein subunit rekombinan atau uji diagnostik pada penelitian terkait COVID-19. |
| first_indexed | 2024-03-08T11:52:45Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-ccf5bb56565d43cf8e644e67723e4205 |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 2355-8857 2407-6376 |
| language | Indonesian |
| last_indexed | 2024-03-08T11:52:45Z |
| publishDate | 2024-01-01 |
| publisher | LPPM STIKES Guna Bangsa Yogyakarta |
| record_format | Article |
| series | Journal of Health (JOH) |
| spelling | doaj.art-ccf5bb56565d43cf8e644e67723e42052024-01-24T08:02:31ZindLPPM STIKES Guna Bangsa YogyakartaJournal of Health (JOH)2355-88572407-63762024-01-0111104305110.30590/joh.v11n1.715715Optimasi Kodon dan Konstruksi Plasmid Rekombinan Protein RBD SARS-CoV-2 pada E. coli BL21(DE3)Elly Widyarni Eka Purnamasari0Dini Wahyu Kartika Sari1Tenri Ashari Wanahari2Khairun Nissa3Asmarani KusumawatiProgram Studi Magister Bioteknologi, Universitas Gadjah Mada, YogyakartaProgram Studi Magister Bioteknologi, Universitas Gadjah Mada, YogyakartaDepartemen Penyakit Dalam, Fakultas Kedokteran, Universitas Lambung Mangkurat/RSUD Ulin, BanjarmasinProgram Studi Magister Bioteknologi, Universitas Gadjah Mada, YogyakartaCoronavirus Disease 2019 (COVID-19), yang disebabkan oleh Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), telah menyebabkan lebih dari 7 juta kematian di seluruh dunia. Strategi komprehensif diperlukan untuk mengatasi pandemi ini, terutama vaksinasi untuk mengurangi infeksi lebih lanjut. Pengembangan vaksin bergantung pada pemanfaatan protein imunogenik dari virus SARS-CoV-2, khususnya pada Receptor-binding Domain (RBD) yang terletak dalam Subunit 1 Spike Glycoprotein. Protein ini berperan penting dalam interaksi virus dengan sel inang melalui reseptor ACE2 untuk menginfeksi inang bersama dengan Subunit 2 untuk memediasi fusi pada membran sel. Meskipun beberapa vaksin telah tersedia, kebutuhan terhadap alternatif vaksin yang lebih terjangkau dan mudah diakses masih terus dikembangkan, terutama untuk negara-negara berkembang dan berpenghasilan rendah. Salah satu alternatif yang dapat dikembangkan dapat berupa vaksin berbasis protein rekombinan. Dalam penelitian ini, urutan gen RBD dioptimasi untuk digunakan pada konstruksi plasmid rekombinan pada ekspresi protein heterolog dalam sistem ekspresi prokaryot yaitu Escherichia coli BL21(DE3). Kodon yang telah dioptimasi kemudian disisipkan ke dalam vektor plasmid pET-15b dan dikonstruksikan menjadi plasmid rekombinan untuk transformasi ke dalam sel inang dengan metode heat-shock. Penelitian ini dievaluasi dan divalidasi melalui PCR koloni, isolasi plasmid, dan sekuensing. Hasil pada penelitian ini dapat menjadi dasar bagi penelitian lanjutan pada ekspresi dan purifikasi protein RBD SARS-CoV-2 pada E. coli BL21(DE3) sebagai kandidat vaksin protein subunit rekombinan atau uji diagnostik pada penelitian terkait COVID-19.https://journal.gunabangsa.ac.id/index.php/joh/article/view/715rbd proteinsars-cov-2codon optimizationrecombinant plasmid |
| spellingShingle | Elly Widyarni Eka Purnamasari Dini Wahyu Kartika Sari Tenri Ashari Wanahari Khairun Nissa Asmarani Kusumawati Optimasi Kodon dan Konstruksi Plasmid Rekombinan Protein RBD SARS-CoV-2 pada E. coli BL21(DE3) Journal of Health (JOH) rbd protein sars-cov-2 codon optimization recombinant plasmid |
| title | Optimasi Kodon dan Konstruksi Plasmid Rekombinan Protein RBD SARS-CoV-2 pada E. coli BL21(DE3) |
| title_full | Optimasi Kodon dan Konstruksi Plasmid Rekombinan Protein RBD SARS-CoV-2 pada E. coli BL21(DE3) |
| title_fullStr | Optimasi Kodon dan Konstruksi Plasmid Rekombinan Protein RBD SARS-CoV-2 pada E. coli BL21(DE3) |
| title_full_unstemmed | Optimasi Kodon dan Konstruksi Plasmid Rekombinan Protein RBD SARS-CoV-2 pada E. coli BL21(DE3) |
| title_short | Optimasi Kodon dan Konstruksi Plasmid Rekombinan Protein RBD SARS-CoV-2 pada E. coli BL21(DE3) |
| title_sort | optimasi kodon dan konstruksi plasmid rekombinan protein rbd sars cov 2 pada e coli bl21 de3 |
| topic | rbd protein sars-cov-2 codon optimization recombinant plasmid |
| url | https://journal.gunabangsa.ac.id/index.php/joh/article/view/715 |
| work_keys_str_mv | AT ellywidyarniekapurnamasari optimasikodondankonstruksiplasmidrekombinanproteinrbdsarscov2padaecolibl21de3 AT diniwahyukartikasari optimasikodondankonstruksiplasmidrekombinanproteinrbdsarscov2padaecolibl21de3 AT tenriashariwanahari optimasikodondankonstruksiplasmidrekombinanproteinrbdsarscov2padaecolibl21de3 AT khairunnissa optimasikodondankonstruksiplasmidrekombinanproteinrbdsarscov2padaecolibl21de3 AT asmaranikusumawati optimasikodondankonstruksiplasmidrekombinanproteinrbdsarscov2padaecolibl21de3 |