Genetische und Genomische Ressourcen als Grundlage für die Züchtung von Echter Kamille

Echte Kamille, Matricaria recutita L., ist eine der wichtigsten Arzneipflanzen und dient der Behandlung diverser Erkrankungen wie Infektionen und Entzündungen der Haut, gastrointestinale Beschwerden und Atemwegsprobleme. Neben ihrer wirtschaftlichen Bedeutung trägt der Anbau der Kamille zur Agrobiod...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: Otto, Lars-Gernot, Kellert, Beate, Cho, Woohyeon, Brassac, Jonathan, Gonzalez, Maria Yuli, Malysheva-Otto, Lyudmyla, Himmelbach, Axel, Mascher, Martin
Format: Article
Language:deu
Published: Julius Kühn-Institut 2023-09-01
Series:Julius-Kühn-Archiv
Subjects:
Online Access:https://www.openagrar.de/receive/openagrar_mods_00089189
_version_ 1797339175177945088
author Otto, Lars-Gernot
Kellert, Beate
Cho, Woohyeon
Brassac, Jonathan
Gonzalez, Maria Yuli
Malysheva-Otto, Lyudmyla
Himmelbach, Axel
Mascher, Martin
author_facet Otto, Lars-Gernot
Kellert, Beate
Cho, Woohyeon
Brassac, Jonathan
Gonzalez, Maria Yuli
Malysheva-Otto, Lyudmyla
Himmelbach, Axel
Mascher, Martin
author_sort Otto, Lars-Gernot
collection DOAJ
description Echte Kamille, Matricaria recutita L., ist eine der wichtigsten Arzneipflanzen und dient der Behandlung diverser Erkrankungen wie Infektionen und Entzündungen der Haut, gastrointestinale Beschwerden und Atemwegsprobleme. Neben ihrer wirtschaftlichen Bedeutung trägt der Anbau der Kamille zur Agrobiodiversität und als Blühkultur zur Insektenfreundlichkeit bei. Für den Landwirt muss der Anbau wirtschaftlich verlässlich gewinnbringend sein. Züchtungsarbeiten zur Erzeugung verbesserter Sorten finden nur sehr selten statt, so dass die aktuellen Sorten und Elitelinien neuen Herausforderungen z.B. durch den Klimawandel häufig nicht optimal begegnen. Pflanzengenetische Ressourcen bieten mit ihrer genetischen Diversität die Möglichkeit, neue oder verbesserte Merkmale in die aktuellen Sorten zu integrieren. Beispiele dafür sind optimierter Inhaltsstoffgehalt, abiotische Stresstoleranz oder Krankheitsresistenzen. Drei verschiedene di- und tetraploide Linien Echter Kamille mit rezessiv vererbbarer männlicher Sterilität (MS) wurden in Sorten und Handelssaatgut identifiziert und können zur gezielten Kreuzung und Bestäubungslenkung in der Züchtung genutzt werden. Die genetischen Grundlagen für die MS wurden mittels Transkiptomanalyse und GWAS unter Nutzung von SNP-Markern aus Genotyping-by-Sequencing (GBS) analysiert. Es wurden mit MS assoziierte Genomsequenzen erhalten, die aber maximal bei 92 % der untersuchten MS-Pflanzen und ebenfalls bei 5 % der MF-Pflanzen detektiert wurden, und daher nicht hinreichend für marker-gestützte Selektion nutzbar sind. Aktuell finden Arbeiten zur Erzeugung eines ersten Genomassemblies der diploiden Kamillensorte Bona statt, um mit diesem als Grundlage Marker mit einer noch deutlich stärkeren Assoziierung mit dem Merkmal MS zu identifizieren, beispielhaft zur Markerentwicklung auch für andere wichtige Merkmale. Diese „Züchter-Marker“ mit hochgradiger Assoziierung können dann für marker-gestützte Selektion eingesetzt werden, um schnell und effizient zu selektieren bzw. fehlende Eigenschaften in die ansonsten leistungsfähigen aktuellen Sorten einzukreuzen.
first_indexed 2024-03-08T09:42:10Z
format Article
id doaj.art-cdc313bb2b0b4d18a8b1330cf9a7011e
institution Directory Open Access Journal
issn 1868-9892
2199-921X
language deu
last_indexed 2024-03-08T09:42:10Z
publishDate 2023-09-01
publisher Julius Kühn-Institut
record_format Article
series Julius-Kühn-Archiv
spelling doaj.art-cdc313bb2b0b4d18a8b1330cf9a7011e2024-01-30T06:02:10ZdeuJulius Kühn-InstitutJulius-Kühn-Archiv1868-98922199-921X2023-09-01476333410.5073/20230821-141243-0Genetische und Genomische Ressourcen als Grundlage für die Züchtung von Echter KamilleOtto, Lars-Gernot0Kellert, Beate1Cho, Woohyeon2Brassac, Jonathan3Gonzalez, Maria Yuli4Malysheva-Otto, Lyudmyla5Himmelbach, Axel6Mascher, Martin 7Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK), AG Quantitative Genetik, DeutschlandLeibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK), AG Quantitative Genetik, DeutschlandLeibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK), AG Domestikationsgenomik, DeutschlandJulius Kühn-Institut (JKI), Institut für Resistenzforschung und Stresstoleranz, DeutschlandLeibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK), AG Quantitative Genetik, DeutschlandLeibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK), AG Quantitative Genetik, DeutschlandLeibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK), AG Genomik Genetischer Ressourcen, DeutschlandLeibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK), AG Domestikationsgenomik, DeutschlandEchte Kamille, Matricaria recutita L., ist eine der wichtigsten Arzneipflanzen und dient der Behandlung diverser Erkrankungen wie Infektionen und Entzündungen der Haut, gastrointestinale Beschwerden und Atemwegsprobleme. Neben ihrer wirtschaftlichen Bedeutung trägt der Anbau der Kamille zur Agrobiodiversität und als Blühkultur zur Insektenfreundlichkeit bei. Für den Landwirt muss der Anbau wirtschaftlich verlässlich gewinnbringend sein. Züchtungsarbeiten zur Erzeugung verbesserter Sorten finden nur sehr selten statt, so dass die aktuellen Sorten und Elitelinien neuen Herausforderungen z.B. durch den Klimawandel häufig nicht optimal begegnen. Pflanzengenetische Ressourcen bieten mit ihrer genetischen Diversität die Möglichkeit, neue oder verbesserte Merkmale in die aktuellen Sorten zu integrieren. Beispiele dafür sind optimierter Inhaltsstoffgehalt, abiotische Stresstoleranz oder Krankheitsresistenzen. Drei verschiedene di- und tetraploide Linien Echter Kamille mit rezessiv vererbbarer männlicher Sterilität (MS) wurden in Sorten und Handelssaatgut identifiziert und können zur gezielten Kreuzung und Bestäubungslenkung in der Züchtung genutzt werden. Die genetischen Grundlagen für die MS wurden mittels Transkiptomanalyse und GWAS unter Nutzung von SNP-Markern aus Genotyping-by-Sequencing (GBS) analysiert. Es wurden mit MS assoziierte Genomsequenzen erhalten, die aber maximal bei 92 % der untersuchten MS-Pflanzen und ebenfalls bei 5 % der MF-Pflanzen detektiert wurden, und daher nicht hinreichend für marker-gestützte Selektion nutzbar sind. Aktuell finden Arbeiten zur Erzeugung eines ersten Genomassemblies der diploiden Kamillensorte Bona statt, um mit diesem als Grundlage Marker mit einer noch deutlich stärkeren Assoziierung mit dem Merkmal MS zu identifizieren, beispielhaft zur Markerentwicklung auch für andere wichtige Merkmale. Diese „Züchter-Marker“ mit hochgradiger Assoziierung können dann für marker-gestützte Selektion eingesetzt werden, um schnell und effizient zu selektieren bzw. fehlende Eigenschaften in die ansonsten leistungsfähigen aktuellen Sorten einzukreuzen.https://www.openagrar.de/receive/openagrar_mods_00089189male sterilitygenetic diversitygbstranscriptome analysisgwasdraft genome assemblymatricaria recutitachamomile
spellingShingle Otto, Lars-Gernot
Kellert, Beate
Cho, Woohyeon
Brassac, Jonathan
Gonzalez, Maria Yuli
Malysheva-Otto, Lyudmyla
Himmelbach, Axel
Mascher, Martin
Genetische und Genomische Ressourcen als Grundlage für die Züchtung von Echter Kamille
Julius-Kühn-Archiv
male sterility
genetic diversity
gbs
transcriptome analysis
gwas
draft genome assembly
matricaria recutita
chamomile
title Genetische und Genomische Ressourcen als Grundlage für die Züchtung von Echter Kamille
title_full Genetische und Genomische Ressourcen als Grundlage für die Züchtung von Echter Kamille
title_fullStr Genetische und Genomische Ressourcen als Grundlage für die Züchtung von Echter Kamille
title_full_unstemmed Genetische und Genomische Ressourcen als Grundlage für die Züchtung von Echter Kamille
title_short Genetische und Genomische Ressourcen als Grundlage für die Züchtung von Echter Kamille
title_sort genetische und genomische ressourcen als grundlage fur die zuchtung von echter kamille
topic male sterility
genetic diversity
gbs
transcriptome analysis
gwas
draft genome assembly
matricaria recutita
chamomile
url https://www.openagrar.de/receive/openagrar_mods_00089189
work_keys_str_mv AT ottolarsgernot genetischeundgenomischeressourcenalsgrundlagefurdiezuchtungvonechterkamille
AT kellertbeate genetischeundgenomischeressourcenalsgrundlagefurdiezuchtungvonechterkamille
AT chowoohyeon genetischeundgenomischeressourcenalsgrundlagefurdiezuchtungvonechterkamille
AT brassacjonathan genetischeundgenomischeressourcenalsgrundlagefurdiezuchtungvonechterkamille
AT gonzalezmariayuli genetischeundgenomischeressourcenalsgrundlagefurdiezuchtungvonechterkamille
AT malyshevaottolyudmyla genetischeundgenomischeressourcenalsgrundlagefurdiezuchtungvonechterkamille
AT himmelbachaxel genetischeundgenomischeressourcenalsgrundlagefurdiezuchtungvonechterkamille
AT maschermartin genetischeundgenomischeressourcenalsgrundlagefurdiezuchtungvonechterkamille