Phylogenetic position of Mexican jackrabbits within the genus Lepus (Mammalia: Lagomorpha): a molecular perspective Posición filogenética de las liebres mexicanas dentro del género Lepus (Mammalia: Lagomorpha): una perspectiva molecular
Although phylogenetic affinities of Mexican jackrabbits within the genus Lepus have been evaluated for a few species, no study has included all 5 species occurring in Mexico. In this study we assess the phylogenetic position of the Mexican species relative to other forms within the genus and evaluat...
| Main Authors: | , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Universidad Nacional Autónoma de México
2010-12-01
|
| Series: | Revista Mexicana de Biodiversidad |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1870-34532010000300014 |
| _version_ | 1811278506222419968 |
|---|---|
| author | Juan Pablo Ramírez-Silva Francisco Xavier González-Cózatl Ella Vázquez-Domínguez Fernando Alfredo Cervantes |
| author_facet | Juan Pablo Ramírez-Silva Francisco Xavier González-Cózatl Ella Vázquez-Domínguez Fernando Alfredo Cervantes |
| author_sort | Juan Pablo Ramírez-Silva |
| collection | DOAJ |
| description | Although phylogenetic affinities of Mexican jackrabbits within the genus Lepus have been evaluated for a few species, no study has included all 5 species occurring in Mexico. In this study we assess the phylogenetic position of the Mexican species relative to other forms within the genus and evaluate evolutionary affinities among the Mexican forms. To do so, we analyzed 57 complete cytochrome b sequences belonging to the 5 Mexican jackrabbits and 18 species of Lepus distributed across Asia, Africa, Europe and America. We performed phylogenetic tree reconstruction with the neighbor-joining, maximum parsimony and maximum likelihood approaches. We also used a minimum spanning network to evaluate relationships among Mexican species. We found 5 main phylogenetic groups within Lepus, 4 of which corresponded to geographically well defined lineages. One group included L. americanus, 3 others corresponded to Mexican, African and European species, respectively. A fifth group included Asiatic, European and American forms. Our results suggest that Mexican species constitute a monophyletic entity that evolved independently of the other American species of Lepus. Within the Mexican forms, 2 main clades are apparent; 1 that includes L. alleni, L. callotis, and L. flavigularis, previously referred to as the white-sided jackrabbits, and a second one that groups together L. californicus and L. insularis, although L. californicus is a paraphyletic relative of L. insularis.<br>Aunque la afinidad filogenética de las liebres mexicanas, dentro del género Lepus, ha sido evaluada para algunas especies, ningún estudio ha incluido las 5 especies que se presentan en México. En este trabajo estimamos la posición filogenética de las especies mexicanas de liebres en relación con otras formas dentro del género, y evaluamos las afinidades evolutivas entre ellas. Para ello analizamos 57 secuencias completas del citocromo b pertenecientes a las 5 especies mexicanas y 18 especies de Lepus distribuidas en Asia, África, Europa y América. La reconstrucción filogenética se realizó mediante los procedimientos de neighbor-joining, máxima parsimonia y máxima verosimilitud. También se empleó el enfoque de redes de haplotipos para evaluar las relaciones entre las especies mexicanas. Observamos 5 grupos filogenéticos principales dentro de Lepus, de los cuales 4 corresponden a grupos geográficamente bien definidos: 1 grupo está constituido por L. americanus, otros 3 están formados por especies mexicanas, africanas y europeas, respectivamente. Un quinto grupo incluyó de manera conjunta a especies asiáticas, europeas y americanas. Nuestros resultados sugieren que las especies de liebres mexicanas forman un grupo monofilético que evolucionó independientemente de otras formas americanas. Dentro de las formas mexicanas existen aparentemente 2 clados principales; 1 que incluye L. alleni, L. callotis y L. flavigularis, previamente reconocidas como liebres de costados blancos, y un segundo que agrupa a L. californicus y L. insularis, aunque L. californicus tiene una relación parafilética con L. insularis. |
| first_indexed | 2024-04-13T00:37:05Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-ce63521db8f94a6cb3bef817f6b50858 |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 1870-3453 |
| language | English |
| last_indexed | 2024-04-13T00:37:05Z |
| publishDate | 2010-12-01 |
| publisher | Universidad Nacional Autónoma de México |
| record_format | Article |
| series | Revista Mexicana de Biodiversidad |
| spelling | doaj.art-ce63521db8f94a6cb3bef817f6b508582022-12-22T03:10:18ZengUniversidad Nacional Autónoma de MéxicoRevista Mexicana de Biodiversidad1870-34532010-12-01813721731Phylogenetic position of Mexican jackrabbits within the genus Lepus (Mammalia: Lagomorpha): a molecular perspective Posición filogenética de las liebres mexicanas dentro del género Lepus (Mammalia: Lagomorpha): una perspectiva molecularJuan Pablo Ramírez-SilvaFrancisco Xavier González-CózatlElla Vázquez-DomínguezFernando Alfredo CervantesAlthough phylogenetic affinities of Mexican jackrabbits within the genus Lepus have been evaluated for a few species, no study has included all 5 species occurring in Mexico. In this study we assess the phylogenetic position of the Mexican species relative to other forms within the genus and evaluate evolutionary affinities among the Mexican forms. To do so, we analyzed 57 complete cytochrome b sequences belonging to the 5 Mexican jackrabbits and 18 species of Lepus distributed across Asia, Africa, Europe and America. We performed phylogenetic tree reconstruction with the neighbor-joining, maximum parsimony and maximum likelihood approaches. We also used a minimum spanning network to evaluate relationships among Mexican species. We found 5 main phylogenetic groups within Lepus, 4 of which corresponded to geographically well defined lineages. One group included L. americanus, 3 others corresponded to Mexican, African and European species, respectively. A fifth group included Asiatic, European and American forms. Our results suggest that Mexican species constitute a monophyletic entity that evolved independently of the other American species of Lepus. Within the Mexican forms, 2 main clades are apparent; 1 that includes L. alleni, L. callotis, and L. flavigularis, previously referred to as the white-sided jackrabbits, and a second one that groups together L. californicus and L. insularis, although L. californicus is a paraphyletic relative of L. insularis.<br>Aunque la afinidad filogenética de las liebres mexicanas, dentro del género Lepus, ha sido evaluada para algunas especies, ningún estudio ha incluido las 5 especies que se presentan en México. En este trabajo estimamos la posición filogenética de las especies mexicanas de liebres en relación con otras formas dentro del género, y evaluamos las afinidades evolutivas entre ellas. Para ello analizamos 57 secuencias completas del citocromo b pertenecientes a las 5 especies mexicanas y 18 especies de Lepus distribuidas en Asia, África, Europa y América. La reconstrucción filogenética se realizó mediante los procedimientos de neighbor-joining, máxima parsimonia y máxima verosimilitud. También se empleó el enfoque de redes de haplotipos para evaluar las relaciones entre las especies mexicanas. Observamos 5 grupos filogenéticos principales dentro de Lepus, de los cuales 4 corresponden a grupos geográficamente bien definidos: 1 grupo está constituido por L. americanus, otros 3 están formados por especies mexicanas, africanas y europeas, respectivamente. Un quinto grupo incluyó de manera conjunta a especies asiáticas, europeas y americanas. Nuestros resultados sugieren que las especies de liebres mexicanas forman un grupo monofilético que evolucionó independientemente de otras formas americanas. Dentro de las formas mexicanas existen aparentemente 2 clados principales; 1 que incluye L. alleni, L. callotis y L. flavigularis, previamente reconocidas como liebres de costados blancos, y un segundo que agrupa a L. californicus y L. insularis, aunque L. californicus tiene una relación parafilética con L. insularis.http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1870-34532010000300014citocromo bMéxicoADN mitocondrialfilogeniacytochrome bMexicomitochondrial DNAphylogeny |
| spellingShingle | Juan Pablo Ramírez-Silva Francisco Xavier González-Cózatl Ella Vázquez-Domínguez Fernando Alfredo Cervantes Phylogenetic position of Mexican jackrabbits within the genus Lepus (Mammalia: Lagomorpha): a molecular perspective Posición filogenética de las liebres mexicanas dentro del género Lepus (Mammalia: Lagomorpha): una perspectiva molecular Revista Mexicana de Biodiversidad citocromo b México ADN mitocondrial filogenia cytochrome b Mexico mitochondrial DNA phylogeny |
| title | Phylogenetic position of Mexican jackrabbits within the genus Lepus (Mammalia: Lagomorpha): a molecular perspective Posición filogenética de las liebres mexicanas dentro del género Lepus (Mammalia: Lagomorpha): una perspectiva molecular |
| title_full | Phylogenetic position of Mexican jackrabbits within the genus Lepus (Mammalia: Lagomorpha): a molecular perspective Posición filogenética de las liebres mexicanas dentro del género Lepus (Mammalia: Lagomorpha): una perspectiva molecular |
| title_fullStr | Phylogenetic position of Mexican jackrabbits within the genus Lepus (Mammalia: Lagomorpha): a molecular perspective Posición filogenética de las liebres mexicanas dentro del género Lepus (Mammalia: Lagomorpha): una perspectiva molecular |
| title_full_unstemmed | Phylogenetic position of Mexican jackrabbits within the genus Lepus (Mammalia: Lagomorpha): a molecular perspective Posición filogenética de las liebres mexicanas dentro del género Lepus (Mammalia: Lagomorpha): una perspectiva molecular |
| title_short | Phylogenetic position of Mexican jackrabbits within the genus Lepus (Mammalia: Lagomorpha): a molecular perspective Posición filogenética de las liebres mexicanas dentro del género Lepus (Mammalia: Lagomorpha): una perspectiva molecular |
| title_sort | phylogenetic position of mexican jackrabbits within the genus lepus mammalia lagomorpha a molecular perspective posicion filogenetica de las liebres mexicanas dentro del genero lepus mammalia lagomorpha una perspectiva molecular |
| topic | citocromo b México ADN mitocondrial filogenia cytochrome b Mexico mitochondrial DNA phylogeny |
| url | http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1870-34532010000300014 |
| work_keys_str_mv | AT juanpabloramirezsilva phylogeneticpositionofmexicanjackrabbitswithinthegenuslepusmammalialagomorphaamolecularperspectiveposicionfilogeneticadelasliebresmexicanasdentrodelgenerolepusmammalialagomorphaunaperspectivamolecular AT franciscoxaviergonzalezcozatl phylogeneticpositionofmexicanjackrabbitswithinthegenuslepusmammalialagomorphaamolecularperspectiveposicionfilogeneticadelasliebresmexicanasdentrodelgenerolepusmammalialagomorphaunaperspectivamolecular AT ellavazquezdominguez phylogeneticpositionofmexicanjackrabbitswithinthegenuslepusmammalialagomorphaamolecularperspectiveposicionfilogeneticadelasliebresmexicanasdentrodelgenerolepusmammalialagomorphaunaperspectivamolecular AT fernandoalfredocervantes phylogeneticpositionofmexicanjackrabbitswithinthegenuslepusmammalialagomorphaamolecularperspectiveposicionfilogeneticadelasliebresmexicanasdentrodelgenerolepusmammalialagomorphaunaperspectivamolecular |