LipIDens: simulation assisted interpretation of lipid densities in cryo-EM structures of membrane proteins

LipIDens: simulation assisted interpretation of lipid densities in cryo-EM structures of membrane proteins

Abstract Cryo-electron microscopy (cryo-EM) enables the determination of membrane protein structures in native-like environments. Characterising how membrane proteins interact with the surrounding membrane lipid environment is assisted by resolution of lipid-like densities visible in cryo-EM maps. N...

وصف كامل

التفاصيل البيبلوغرافية
المؤلفون الرئيسيون:	T. Bertie Ansell, Wanling Song, Claire E. Coupland, Loic Carrique, Robin A. Corey, Anna L. Duncan, C. Keith Cassidy, Maxwell M. G. Geurts, Tim Rasmussen, Andrew B. Ward, Christian Siebold, Phillip J. Stansfeld, Mark S. P. Sansom
التنسيق:	مقال
اللغة:	English
منشور في:	Nature Portfolio 2023-11-01
سلاسل:	Nature Communications
الوصول للمادة أونلاين:	https://doi.org/10.1038/s41467-023-43392-y

مواد مشابهة

LipIDens: simulation assisted interpretation of lipid densities in cryo-EM structures of membrane proteins
حسب: Ansell, TB, وآخرون
منشور في: (2023)

PyLipID: a Python package for analysis of protein-lipid interactions from MD simulations
حسب: Song, W, وآخرون
منشور في: (2022)

A IDEN T IDADE Imagenacionalidade
حسب: Antonio Basílio Rodrigues
منشور في: (1996-12-01)

N′-(2-Hydroxy-5-nitrobenzylidene)benzenesulfonohydrazide
حسب: Yusnita, Juahir, وآخرون
منشور في: (2008)

Relative affinities of protein-cholesterol interactions from equilibrium molecular dynamics simulations
حسب: Ansell, TB, وآخرون
منشور في: (2021)

Bortom akademisk kapitalism - Idén om ett Nytt Universitet
حسب: Carsten Ljunggren, وآخرون
منشور في: (2002-01-01)

IDEN Consensus on Management of Antithrombotic Agents in Patients Undergoing Gastrointestinal Endoscopy
حسب: Seung Joo Kang, وآخرون
منشور في: (2024-06-01)

N′-(5-Bromo-2-hydroxybenzylidene)-3,4,5-trihydroxybenzohydrazide dihydrate
حسب: Alhadi, Abeer A., وآخرون
منشور في: (2008)

3,4-O-Isopropyl-idene-2-C-methyl-d-galactonolactone.
حسب: Dai, N, وآخرون
منشور في: (2010)

(2,4-Dimethoxy-benzyl-idene)-2-hydroxy-benzohydrazide ethanol solvate.
حسب: Yehye, W.A., وآخرون
منشور في: (2008)

Wer o war/Wast at Cleopatra an den Iden des Márz 44?
حسب: Richard Gregor Böhm
منشور في: (1985-01-01)

Wer o war/Wast at Cleopatra an den Iden des Márz 44?
حسب: Richard Gregor Böhm
منشور في: (1985-01-01)

N'-(2-Hydroxy-5-nitrobenzylidene)-2-(1H-indol-3-yl)acetohydrazide
حسب: Puvaneswary, Subramaniam, وآخرون
منشور في: (2008)

The energetics of protein-lipid interactions as viewed by molecular simulations
حسب: Corey, RA, وآخرون
منشور في: (2019)

Benzyl N-[1-(thiophen-2-yl)ethylidene)]-hydrazinecarbodithioate
حسب: Chan, Eddy Mun Hoe, وآخرون
منشور في: (2003)

Meeting Report and Special Issue Preface: International Digestive Endoscopy Network (IDEN) 2016
حسب: Sang Kil Lee, وآخرون
منشور في: (2016-09-01)

Structure, mechanism, and inhibition of Hedgehog acyltransferase
حسب: Coupland, CE, وآخرون
منشور في: (2021)

Structure and dynamics of the E. coli chemotaxis core signaling complex by cryo-electron tomography and molecular simulations
حسب: Cassidy, C, وآخرون
منشور في: (2020)

(1S)-1,2-O-Benzyl-idene-α-d-glucurono-6,3-lactone.
حسب: Jenkinson, S, وآخرون
منشور في: (2009)

tert-Butyl 2-de-oxy-4,5-O-isopropyl-idene-d-gluconate.
حسب: Jenkinson, S, وآخرون
منشور في: (2008)

Benzyl N-[(Z)-(1-methyl-2-sulfanylpropylidene)amino]carbamodithioate.
حسب: Break, Mohammed Khaled, وآخرون
منشور في: (2013)

AlphaFold2 and CryoEM: Revisiting CryoEM modeling in near-atomic resolution density maps
حسب: Corey F. Hryc, وآخرون
منشور في: (2022-07-01)

Insights into membrane protein-lipid interactions from free energy calculations
حسب: Corey, R, وآخرون
منشور في: (2019)

2,3-O-(S)-Benzyl-idene-2-C-methyl-d-ribono-1,4-lactone.
حسب: Booth, K, وآخرون
منشور في: (2009)

2-O-Benzhydryl-3,4-(S)-O-benzyl-idene-d-lyxono-1,4-lactone.
حسب: Jenkinson, S, وآخرون
منشور في: (2008)

2-O-Benzhydryl-3,4-(S)-O-benzyl-idene-d-lyxono-1,4-lactone
حسب: Jenkinson, S, وآخرون
منشور في: (2008)

2-O-Benzhydryl-3,4-(S)-O-benzyl-idene-d-xylono-1,4-lactone.
حسب: Jenkinson, S, وآخرون
منشور في: (2008)

N'-[1-(2-Hydroxy-5-methylphenyl)ethylidene]benzenesulfonohydrazide
حسب: Laila, M., وآخرون
منشور في: (2008)

Malay traditional spatial design functions related to its portrayal of cultural idenity at tourist destinations in Malaysia
حسب: Md Nor, Idham Hadi
منشور في: (2016)

A lipid gating mechanism for the channel-forming O antigen ABC transporter
حسب: Christopher A. Caffalette, وآخرون
منشور في: (2019-02-01)

2-C-Hydroxymethyl-2,3-O-isopropyl-idene-3-C-methyl-beta-L-erythrose
حسب: Booth, K, وآخرون
منشور في: (2007)

2-Hydr-oxy-(2-methyl-1H-indol-3-ylmethyl-idene)benzohydrazide ethanol solvate.
حسب: Yehye, W.A., وآخرون
منشور في: (2008)

1,5-Bis(2-oxoindolin-3-ylidene)thiocarbonohydrazide tetrahydrofuran monosolvate
حسب: Pezeshkpour, Shaghayegh, وآخرون
منشور في: (2012)

Estudio de Indicadores de Desempeño Energético (IDEn) de un Hospital Básico en el Ecuador
حسب: Fernando Arias, وآخرون
منشور في: (2023-07-01)

Consolidating ICESat-2 Ocean Wave Characteristics with CryoSat-2 during the CRYO2ICE Campaign
حسب: Bjarke Nilsson, وآخرون
منشور في: (2022-03-01)

Cryo-EM structure of the mechanically activated ion channel OSCA1.2
حسب: Sebastian Jojoa-Cruz, وآخرون
منشور في: (2018-11-01)

(E,E)-1,2-Bis[4-(prop-2-yn-1-yloxy)benzylidene]hydrazine
حسب: Al-Mehana, Wisam Naji Atiyah, وآخرون
منشور في: (2011)

N'-(3,5-Di-tert-butyl-4-hydroxy-benzyl-idene)-2-hydroxy-benzohydrazide methanol solvate
حسب: Yehye, W.A., وآخرون
منشور في: (2008)

Hepatocyte cholesterol content modulates glucagon receptor signalling
حسب: Emma Rose McGlone, وآخرون
منشور في: (2022-09-01)

CryoEM-based hybrid modeling approaches for structure determination.
حسب: Cassidy, C, وآخرون
منشور في: (2017)