LipIDens: simulation assisted interpretation of lipid densities in cryo-EM structures of membrane proteins

LipIDens: simulation assisted interpretation of lipid densities in cryo-EM structures of membrane proteins

Abstract Cryo-electron microscopy (cryo-EM) enables the determination of membrane protein structures in native-like environments. Characterising how membrane proteins interact with the surrounding membrane lipid environment is assisted by resolution of lipid-like densities visible in cryo-EM maps. N...

সম্পূর্ণ বিবরণ

গ্রন্থ-পঞ্জীর বিবরন
প্রধান লেখক:	T. Bertie Ansell, Wanling Song, Claire E. Coupland, Loic Carrique, Robin A. Corey, Anna L. Duncan, C. Keith Cassidy, Maxwell M. G. Geurts, Tim Rasmussen, Andrew B. Ward, Christian Siebold, Phillip J. Stansfeld, Mark S. P. Sansom
বিন্যাস:	প্রবন্ধ
ভাষা:	English
প্রকাশিত:	Nature Portfolio 2023-11-01
মালা:	Nature Communications
অনলাইন ব্যবহার করুন:	https://doi.org/10.1038/s41467-023-43392-y

অনুরূপ উপাদানগুলি

LipIDens: simulation assisted interpretation of lipid densities in cryo-EM structures of membrane proteins
অনুযায়ী: Ansell, TB, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2023)

PyLipID: a Python package for analysis of protein-lipid interactions from MD simulations
অনুযায়ী: Song, W, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2022)

A IDEN T IDADE Imagenacionalidade
অনুযায়ী: Antonio Basílio Rodrigues
প্রকাশিত: (1996-12-01)

N′-(2-Hydroxy-5-nitrobenzylidene)benzenesulfonohydrazide
অনুযায়ী: Yusnita, Juahir, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2008)

Relative affinities of protein-cholesterol interactions from equilibrium molecular dynamics simulations
অনুযায়ী: Ansell, TB, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2021)

Bortom akademisk kapitalism - Idén om ett Nytt Universitet
অনুযায়ী: Carsten Ljunggren, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2002-01-01)

IDEN Consensus on Management of Antithrombotic Agents in Patients Undergoing Gastrointestinal Endoscopy
অনুযায়ী: Seung Joo Kang, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2024-06-01)

N′-(5-Bromo-2-hydroxybenzylidene)-3,4,5-trihydroxybenzohydrazide dihydrate
অনুযায়ী: Alhadi, Abeer A., অন্যান্য
প্রকাশিত: (2008)

3,4-O-Isopropyl-idene-2-C-methyl-d-galactonolactone.
অনুযায়ী: Dai, N, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2010)

(2,4-Dimethoxy-benzyl-idene)-2-hydroxy-benzohydrazide ethanol solvate.
অনুযায়ী: Yehye, W.A., অন্যান্য
প্রকাশিত: (2008)

Wer o war/Wast at Cleopatra an den Iden des Márz 44?
অনুযায়ী: Richard Gregor Böhm
প্রকাশিত: (1985-01-01)

Wer o war/Wast at Cleopatra an den Iden des Márz 44?
অনুযায়ী: Richard Gregor Böhm
প্রকাশিত: (1985-01-01)

N'-(2-Hydroxy-5-nitrobenzylidene)-2-(1H-indol-3-yl)acetohydrazide
অনুযায়ী: Puvaneswary, Subramaniam, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2008)

The energetics of protein-lipid interactions as viewed by molecular simulations
অনুযায়ী: Corey, RA, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2019)

Benzyl N-[1-(thiophen-2-yl)ethylidene)]-hydrazinecarbodithioate
অনুযায়ী: Chan, Eddy Mun Hoe, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2003)

Meeting Report and Special Issue Preface: International Digestive Endoscopy Network (IDEN) 2016
অনুযায়ী: Sang Kil Lee, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2016-09-01)

Structure, mechanism, and inhibition of Hedgehog acyltransferase
অনুযায়ী: Coupland, CE, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2021)

Structure and dynamics of the E. coli chemotaxis core signaling complex by cryo-electron tomography and molecular simulations
অনুযায়ী: Cassidy, C, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2020)

(1S)-1,2-O-Benzyl-idene-α-d-glucurono-6,3-lactone.
অনুযায়ী: Jenkinson, S, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2009)

tert-Butyl 2-de-oxy-4,5-O-isopropyl-idene-d-gluconate.
অনুযায়ী: Jenkinson, S, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2008)

Benzyl N-[(Z)-(1-methyl-2-sulfanylpropylidene)amino]carbamodithioate.
অনুযায়ী: Break, Mohammed Khaled, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2013)

AlphaFold2 and CryoEM: Revisiting CryoEM modeling in near-atomic resolution density maps
অনুযায়ী: Corey F. Hryc, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2022-07-01)

Insights into membrane protein-lipid interactions from free energy calculations
অনুযায়ী: Corey, R, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2019)

2,3-O-(S)-Benzyl-idene-2-C-methyl-d-ribono-1,4-lactone.
অনুযায়ী: Booth, K, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2009)

2-O-Benzhydryl-3,4-(S)-O-benzyl-idene-d-lyxono-1,4-lactone.
অনুযায়ী: Jenkinson, S, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2008)

2-O-Benzhydryl-3,4-(S)-O-benzyl-idene-d-lyxono-1,4-lactone
অনুযায়ী: Jenkinson, S, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2008)

2-O-Benzhydryl-3,4-(S)-O-benzyl-idene-d-xylono-1,4-lactone.
অনুযায়ী: Jenkinson, S, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2008)

N'-[1-(2-Hydroxy-5-methylphenyl)ethylidene]benzenesulfonohydrazide
অনুযায়ী: Laila, M., অন্যান্য
প্রকাশিত: (2008)

Malay traditional spatial design functions related to its portrayal of cultural idenity at tourist destinations in Malaysia
অনুযায়ী: Md Nor, Idham Hadi
প্রকাশিত: (2016)

A lipid gating mechanism for the channel-forming O antigen ABC transporter
অনুযায়ী: Christopher A. Caffalette, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2019-02-01)

2-C-Hydroxymethyl-2,3-O-isopropyl-idene-3-C-methyl-beta-L-erythrose
অনুযায়ী: Booth, K, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2007)

2-Hydr-oxy-(2-methyl-1H-indol-3-ylmethyl-idene)benzohydrazide ethanol solvate.
অনুযায়ী: Yehye, W.A., অন্যান্য
প্রকাশিত: (2008)

1,5-Bis(2-oxoindolin-3-ylidene)thiocarbonohydrazide tetrahydrofuran monosolvate
অনুযায়ী: Pezeshkpour, Shaghayegh, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2012)

Estudio de Indicadores de Desempeño Energético (IDEn) de un Hospital Básico en el Ecuador
অনুযায়ী: Fernando Arias, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2023-07-01)

Consolidating ICESat-2 Ocean Wave Characteristics with CryoSat-2 during the CRYO2ICE Campaign
অনুযায়ী: Bjarke Nilsson, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2022-03-01)

Cryo-EM structure of the mechanically activated ion channel OSCA1.2
অনুযায়ী: Sebastian Jojoa-Cruz, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2018-11-01)

(E,E)-1,2-Bis[4-(prop-2-yn-1-yloxy)benzylidene]hydrazine
অনুযায়ী: Al-Mehana, Wisam Naji Atiyah, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2011)

N'-(3,5-Di-tert-butyl-4-hydroxy-benzyl-idene)-2-hydroxy-benzohydrazide methanol solvate
অনুযায়ী: Yehye, W.A., অন্যান্য
প্রকাশিত: (2008)

Hepatocyte cholesterol content modulates glucagon receptor signalling
অনুযায়ী: Emma Rose McGlone, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2022-09-01)

CryoEM-based hybrid modeling approaches for structure determination.
অনুযায়ী: Cassidy, C, অন্যান্য
প্রকাশিত: (2017)