Analysis of bovine rotavirus strains circulating in diarrheic dairy calves in Uberaba, Minas Gerais, Brazil, during 2008-2009
RESUMO O objetivo deste estudo foi detectar rotavírus em fezes de bezerros com diarreia em Uberaba, MG, e caracterizar os genes VP7 e VP4 por meio da genotipagem e da análise filogenética. Setenta e quatro amostras foram coletadas entre novembro de 2008 e setembro de 2009. A detecção do vírus foi fe...
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| Format: | Article |
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| Published: |
Universidade Federal de Minas Gerais
2016-08-01
|
| Series: | Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia |
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| Online Access: | http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352016000401090&lng=en&tlng=en |
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| author | A.C.B. Dulgheroff W.A.B. Pereira R.R. Sarmento G.A.V. Silva F.G. Naveca A.L.S. Domingues |
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| description | RESUMO O objetivo deste estudo foi detectar rotavírus em fezes de bezerros com diarreia em Uberaba, MG, e caracterizar os genes VP7 e VP4 por meio da genotipagem e da análise filogenética. Setenta e quatro amostras foram coletadas entre novembro de 2008 e setembro de 2009. A detecção do vírus foi feita por teste de aglutinação e as amostras positivas foram submetidas à transcrição reversa, seguida de reação em cadeia da polimerase (RT-PCR), tipagem por PCR e sequenciamento. A taxa de detecção de rotavírus foi de 6,8% e todas as amostras apresentaram o genótipo G6P[5]. A análise filogenética mostrou que as amostras do genótipo G6 pertencem à linhagem IV e que, para ambos os genes (VP7 e VP4), as amostras deste estudo compõem um sub-cluster à parte daquele das cepas referências e das amostras campo mais similares. O alinhamento das sequências de aminoácidos deduzidas mostrou substituições em regiões antigênicas quando comparadas com as sequências das cepas bovinas UK e NCDV, presentes nas vacinas disponíveis no Brasil. Uma nova sublinhagem genética de G6P[5] foi evidenciada neste estudo. Substituições de aminoácidos nas regiões antigênicas dos rotavírus e a circulação de novas variantes podem representar desafios para as vacinas utilizadas atualmente. O presente estudo contribui para a compreensão da epidemiologia dos rotavírus bovinos no Brasil. |
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| publishDate | 2016-08-01 |
| publisher | Universidade Federal de Minas Gerais |
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| spelling | doaj.art-cf8c1d3387a2450e8c7aee1e1f6395302022-12-21T17:48:00ZengUniversidade Federal de Minas GeraisArquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia1678-41622016-08-016841090109410.1590/1678-4162-8737S0102-09352016000401090Analysis of bovine rotavirus strains circulating in diarrheic dairy calves in Uberaba, Minas Gerais, Brazil, during 2008-2009A.C.B. DulgheroffW.A.B. PereiraR.R. SarmentoG.A.V. SilvaF.G. NavecaA.L.S. DominguesRESUMO O objetivo deste estudo foi detectar rotavírus em fezes de bezerros com diarreia em Uberaba, MG, e caracterizar os genes VP7 e VP4 por meio da genotipagem e da análise filogenética. Setenta e quatro amostras foram coletadas entre novembro de 2008 e setembro de 2009. A detecção do vírus foi feita por teste de aglutinação e as amostras positivas foram submetidas à transcrição reversa, seguida de reação em cadeia da polimerase (RT-PCR), tipagem por PCR e sequenciamento. A taxa de detecção de rotavírus foi de 6,8% e todas as amostras apresentaram o genótipo G6P[5]. A análise filogenética mostrou que as amostras do genótipo G6 pertencem à linhagem IV e que, para ambos os genes (VP7 e VP4), as amostras deste estudo compõem um sub-cluster à parte daquele das cepas referências e das amostras campo mais similares. O alinhamento das sequências de aminoácidos deduzidas mostrou substituições em regiões antigênicas quando comparadas com as sequências das cepas bovinas UK e NCDV, presentes nas vacinas disponíveis no Brasil. Uma nova sublinhagem genética de G6P[5] foi evidenciada neste estudo. Substituições de aminoácidos nas regiões antigênicas dos rotavírus e a circulação de novas variantes podem representar desafios para as vacinas utilizadas atualmente. O presente estudo contribui para a compreensão da epidemiologia dos rotavírus bovinos no Brasil.http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352016000401090&lng=en&tlng=enrotavírus bovinogenotipagemlinhagem genética |
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