Vietnam PHÂN TÍCH in silico CÁC GENE MÃ HÓA PROTEIN SWEET Ở CÂY DỀN LẤY HẠT (Amaranthus hypochondriacus L.)
SWEET (Sugars Will Eventually be Exported Transporter) là một trong các họ protein có chức năng vận chuyển đường quan trọng ở thực vật. Trong nghiên cứu này, 20 gene mã hóa các protein SWEET trong hệ gene cây dền lấy hạt (Amaranthus hypochondriacus L.) đã được xác định và phân tích. Chiều dài các g...
| Main Authors: | , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
HUJOS
2022-03-01
|
| Series: | Tạp chí Khoa học Đại học Huế: Khoa học Tự nhiên |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://jos.hueuni.edu.vn/index.php/hujos-ns/article/view/6317 |
| _version_ | 1818507532132417536 |
|---|---|
| author | Hong Viet La Bang Phi Cao Ha Duc Chu Quang Tan Hoang |
| author_facet | Hong Viet La Bang Phi Cao Ha Duc Chu Quang Tan Hoang |
| author_sort | Hong Viet La |
| collection | DOAJ |
| description |
SWEET (Sugars Will Eventually be Exported Transporter) là một trong các họ protein có chức năng vận chuyển đường quan trọng ở thực vật. Trong nghiên cứu này, 20 gene mã hóa các protein SWEET trong hệ gene cây dền lấy hạt (Amaranthus hypochondriacus L.) đã được xác định và phân tích. Chiều dài các gene này dao động từ 729 đến 9324 nucleotide và hầu hết gene có bốn hoặc năm intron. Các protein suy diễn có chiều dài từ 226 tới 311 amino acid và mang sáu hoặc bảy xoắn xuyên màng đặc trưng. Hầu hết các protein này có tính kiềm với pI 8,08–9,73. Phân tích cây phả hệ cho phép phân chia các AhSWEET thành bốn nhóm, nhóm I (ba gene), nhóm II (bảy gene), nhóm III (tám gene) và nhóm IV (hai gene). Các gene này phân bố không đồng đều trong hệ gene của cây dền lấy hạt. Mười hiện tượng nhân gene đã được phát hiện hình thành nên các cặp gene SWEET lặp ở loài cây này, trong đó chủ yếu là hiện tượng nhân gene trên toàn hệ gene. Các gene lặp trong cặp hình thành từ quá trình nhân gene chịu sự tác động của chọn lọc âm, giữ ổn định trình tự nucleotide. Kết quả của nghiên cứu này là cơ sở cho các nghiên cứu xa hơn như nghiên cứu chức năng gene hoặc cải tiến di truyền.
|
| first_indexed | 2024-12-10T22:19:45Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-d1f76b86cb5942e3999fa28aa2fd0b34 |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 1859-1388 2615-9678 |
| language | English |
| last_indexed | 2024-12-10T22:19:45Z |
| publishDate | 2022-03-01 |
| publisher | HUJOS |
| record_format | Article |
| series | Tạp chí Khoa học Đại học Huế: Khoa học Tự nhiên |
| spelling | doaj.art-d1f76b86cb5942e3999fa28aa2fd0b342022-12-22T01:31:21ZengHUJOSTạp chí Khoa học Đại học Huế: Khoa học Tự nhiên1859-13882615-96782022-03-011311A10.26459/hueunijns.v131i1A.6317Vietnam PHÂN TÍCH in silico CÁC GENE MÃ HÓA PROTEIN SWEET Ở CÂY DỀN LẤY HẠT (Amaranthus hypochondriacus L.)Hong Viet La0Bang Phi Cao1Ha Duc Chu2Quang Tan Hoang3Viện Nghiên cứu Khoa học & Ứng dụng, Trường Đại học Sư phạm Hà Nội 2, Tp. Phúc Yên, Vĩnh Phúc, Việt NamKhoa Khoa học tự nhiên, Trường Đại học Hùng vương, Tp. Việt Trì, Phú Thọ, Việt NamKhoa Công nghệ Nông nghiệp, Trường Đại học Công nghệ, ĐHQG Hà Nội, 144 Xuân Thủy, Hà Nội, Việt NamViện Công nghệ Sinh học, Đại học Huế, Tỉnh lộ 10, Phú Thượng, Phú Vang, Thừa Thiên Huế, Việt Nam SWEET (Sugars Will Eventually be Exported Transporter) là một trong các họ protein có chức năng vận chuyển đường quan trọng ở thực vật. Trong nghiên cứu này, 20 gene mã hóa các protein SWEET trong hệ gene cây dền lấy hạt (Amaranthus hypochondriacus L.) đã được xác định và phân tích. Chiều dài các gene này dao động từ 729 đến 9324 nucleotide và hầu hết gene có bốn hoặc năm intron. Các protein suy diễn có chiều dài từ 226 tới 311 amino acid và mang sáu hoặc bảy xoắn xuyên màng đặc trưng. Hầu hết các protein này có tính kiềm với pI 8,08–9,73. Phân tích cây phả hệ cho phép phân chia các AhSWEET thành bốn nhóm, nhóm I (ba gene), nhóm II (bảy gene), nhóm III (tám gene) và nhóm IV (hai gene). Các gene này phân bố không đồng đều trong hệ gene của cây dền lấy hạt. Mười hiện tượng nhân gene đã được phát hiện hình thành nên các cặp gene SWEET lặp ở loài cây này, trong đó chủ yếu là hiện tượng nhân gene trên toàn hệ gene. Các gene lặp trong cặp hình thành từ quá trình nhân gene chịu sự tác động của chọn lọc âm, giữ ổn định trình tự nucleotide. Kết quả của nghiên cứu này là cơ sở cho các nghiên cứu xa hơn như nghiên cứu chức năng gene hoặc cải tiến di truyền. http://jos.hueuni.edu.vn/index.php/hujos-ns/article/view/6317SWEETđặc điểm genebiểu hiện genecây di truyềndền lấy hạt |
| spellingShingle | Hong Viet La Bang Phi Cao Ha Duc Chu Quang Tan Hoang Vietnam PHÂN TÍCH in silico CÁC GENE MÃ HÓA PROTEIN SWEET Ở CÂY DỀN LẤY HẠT (Amaranthus hypochondriacus L.) Tạp chí Khoa học Đại học Huế: Khoa học Tự nhiên SWEET đặc điểm gene biểu hiện gene cây di truyền dền lấy hạt |
| title | Vietnam PHÂN TÍCH in silico CÁC GENE MÃ HÓA PROTEIN SWEET Ở CÂY DỀN LẤY HẠT (Amaranthus hypochondriacus L.) |
| title_full | Vietnam PHÂN TÍCH in silico CÁC GENE MÃ HÓA PROTEIN SWEET Ở CÂY DỀN LẤY HẠT (Amaranthus hypochondriacus L.) |
| title_fullStr | Vietnam PHÂN TÍCH in silico CÁC GENE MÃ HÓA PROTEIN SWEET Ở CÂY DỀN LẤY HẠT (Amaranthus hypochondriacus L.) |
| title_full_unstemmed | Vietnam PHÂN TÍCH in silico CÁC GENE MÃ HÓA PROTEIN SWEET Ở CÂY DỀN LẤY HẠT (Amaranthus hypochondriacus L.) |
| title_short | Vietnam PHÂN TÍCH in silico CÁC GENE MÃ HÓA PROTEIN SWEET Ở CÂY DỀN LẤY HẠT (Amaranthus hypochondriacus L.) |
| title_sort | vietnam phan tich in silico cac gene ma hoa protein sweet o cay den lay hat amaranthus hypochondriacus l |
| topic | SWEET đặc điểm gene biểu hiện gene cây di truyền dền lấy hạt |
| url | http://jos.hueuni.edu.vn/index.php/hujos-ns/article/view/6317 |
| work_keys_str_mv | AT hongvietla vietnamphantichinsilicocacgenemahoaproteinsweetocaydenlayhatamaranthushypochondriacusl AT bangphicao vietnamphantichinsilicocacgenemahoaproteinsweetocaydenlayhatamaranthushypochondriacusl AT haducchu vietnamphantichinsilicocacgenemahoaproteinsweetocaydenlayhatamaranthushypochondriacusl AT quangtanhoang vietnamphantichinsilicocacgenemahoaproteinsweetocaydenlayhatamaranthushypochondriacusl |