Внебольничная пневмония у ВИЧ-инфицированных: микрофлора, антибиотикорезистентность роль в развитии в зависимости от уровня CD4 лимфоцитов Community-acquired pneumonia in HIV-infected: microflora, antibiotic resistance, developmental role depending on the
Резюме. Гнойно-воспалительные заболевания различной нозологии и этиологии у ВИЧ-инфицированных являются одной из главных причин их гибели. Целью данной работы явилось определение спектра возбудителей внебольничной пневмонии и профиля их резистентности, зависимости от уровня CD4 лимфоцитов, а также в...
| Format: | Article |
|---|---|
| Language: | Russian |
| Published: |
St. Petersburg branch of the Russian Association of Allergologists and Clinical Immunologists
2019-03-01
|
| Series: | Медицинская иммунология |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://www.mimmun.ru/mimmun/article/view/1689 |
| _version_ | 1797703953477009408 |
|---|---|
| collection | DOAJ |
| description | Резюме. Гнойно-воспалительные заболевания различной нозологии и этиологии у ВИЧ-инфицированных являются одной из главных причин их гибели. Целью данной работы явилось определение спектра возбудителей внебольничной пневмонии и профиля их резистентности, зависимости от уровня CD4 лимфоцитов, а также выявление роли метициллинрезистентных Staphylococcus aureus и их молекулярно-генетических особенностей у ВИЧ-инфицированных пациентов г. Красноярска. В период 2012-2016 год было обследовано 152 ВИЧ-инфицированных пациента пульмонологического отделения с клиническим диагнозом внебольничная пневмония. От больных забирались мокрота, бронхоальвеолярный лаваж, плевральная жидкость, промывные воды, гной из плевры, а также мазок из носа и зева на выявление микрофлоры, кровь на стерильность. Использован бактериологический метод. Антибиотикочувствительность определяли диско-диффузионным методом; чувствительность стафилококков к проводили методом скрининга, ПЦР, методом серийных разведений в плотной среде в соответствии с международными рекомендациями СLSI, EUCAST. Для генотипирования и определения молекулярно-генетических особенностей – ПЦР, М-ПЦР, секвенирование. Обработку результатов проводили с использованием компьютерной программы WHONET (ВОЗ). Уровень значимости p<0,05. На протяжении всего периода исследования от ВИЧ-инфицированных пациентов неизменно выделялись дрожжеподобные грибы рода Candida (30,4% и 35,6%). Данные микроорганизмы выделялись в монокультуре в этиологически значимом количестве от каждого третьего ВИЧ-инфицированного пациента. При этом они являлись активными ассоциантами, наиболее часто образуя ассоциации с представителями семейства Enterobacteriaceae. При этом, установили, что наиболее часто грибы рода Candida в нижних отделах дыхательных путей выявлялись у ВИЧ-инфицированных с тяжелым иммунодефицитом с уровнем CD4 <200 клеток/мкл. Также были выделены неферментирующие грамотрицательные бактерии (12,9%), стафилококки (8,9%), представители семейства Enterobacteriaceae (4,4%). Микроорганизмы характеризовались полирезистентностью к антимикробным препаратам. Клоном MRSA среди ВИЧ-инфицированных являлся ST239/spa3(t037)/agr1/SCCmecIII.1.1.2(IIIA)/coaIV/tst+; характеризуюшийся высоким уровнем вирулентности и мультирезистентностью. Таким образом, установлено, что в развитии внебольничной пневмонии у ВИЧ-инфицированных пациентов играют роль полирезистентные микроорганизмы, в том числе грибы р. Candida, грамотрицательные микроорганизмы, MRSA, зачастую в составе микробных ассоциаций. Наиболее часто грибы рода Candida выявлялись у ВИЧ-инфицированных с тяжелым иммунодефицитом с уровнем CD4 <200 клеток/мкл. Высокая частота выделение таких штаммов требует коррекции антимикробной терапии внебольничной пневмонии у ВИЧ-инфицированных.Abstract. Purulent-inflammatory diseases of various nosology and etiology in HIV-infected individuals are one of the main causes of their death. The purpose of this work was to determine the spectrum of pathogens of community-acquired pneumonia and their resistance profile, dependence on the level of CD4 lymphocytes, as well as to identify the role of methicillin-resistant Staphylococcus aureus and their molecular genetic characteristics in HIV-infected patients in Krasnoyarsk. In the period 2012-2016, 152 HIV-infected patients of the pulmonary department with a clinical diagnosis of community-acquired pneumonia were examined. Sputum, bronchoalveolar lavage, pleural fluid, wash water, pus from the pleura, as well as a smear from the nose and pharynx for microflora and blood for sterility were taken from patients. Used bacteriological method. Antibiotic sensitivity was determined by the disco-diffusion method; sensitivity of staphylococci to was performed by screening, PCR, serial dilution in a dense medium in accordance with international recommendations CLSI, EUCAST. For genotyping and determination of molecular genetic features - PCR, M-PCR, sequencing. The results were processed using the WHONET computer program (WHO). The significance level is p <0.05. During the entire study period, yeast-like fungi of the genus Candida (30.4% and 35.6%) were consistently isolated from HIV-infected patients. These microorganisms were isolated in a monoculture in an etiologically significant amount from every third HIV-infected patient. At the same time, they were active associates, most often forming associations with members of the Enterobacteriaceae family. At the same time, it was found that the most frequently Candida fungi in the lower respiratory tract were detected in HIV-infected people with severe immunodeficiency with a CD4 level <200 cells / µl. Non fermentative gram-negative bacteria (12.9%), staphylococcus (8.9%), members of the Enterobacteriaceae family (4.4%) were also isolated. Microorganisms were characterized by polyresistance to antimicrobial agents. The MRSA clone among HIV-infected individuals was ST239 / spa3 (t037) /agr1/SCCmecIII.1.1.2 (IIIA) / coaIV / tst +; characterized by high levels of virulence and multiresistance. Thus, it has been established that in the development of community-acquired pneumonia in HIV-infected patients polyresistant microorganisms play a role, including p. Candida, gram-negative microorganisms, MRSA, often as part of microbial associations. Most often, Candida fungi were detected in HIV-infected individuals with severe immunodeficiency with a CD4 level <200 cells / µl. The high frequency of isolation of such strains requires the correction of antimicrobial therapy of community-acquired pneumonia in HIV-infected. |
| first_indexed | 2024-03-12T05:12:05Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-d9fd2d78a49343308f4cf4b8cc4e3aa2 |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 1563-0625 2313-741X |
| language | Russian |
| last_indexed | 2024-03-12T05:12:05Z |
| publishDate | 2019-03-01 |
| publisher | St. Petersburg branch of the Russian Association of Allergologists and Clinical Immunologists |
| record_format | Article |
| series | Медицинская иммунология |
| spelling | doaj.art-d9fd2d78a49343308f4cf4b8cc4e3aa22023-09-03T08:29:23ZrusSt. Petersburg branch of the Russian Association of Allergologists and Clinical ImmunologistsМедицинская иммунология1563-06252313-741X2019-03-01001122Внебольничная пневмония у ВИЧ-инфицированных: микрофлора, антибиотикорезистентность роль в развитии в зависимости от уровня CD4 лимфоцитов Community-acquired pneumonia in HIV-infected: microflora, antibiotic resistance, developmental role depending on the01234567Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф.Войно-Ясенецкого" Министерства здравоохранения Российской ФедерацииФедеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф.Войно-Ясенецкого" Министерства здравоохранения Российской Федерации, 660022, Красноярск, РоссияКраевое государственное бюджетное учреждение здравоохранения «Красноярская межрайонная клиническая больница скорой медицинской помощи им. Н.С.КарповичаКраевое государственное бюджетное учреждение здравоохранения «Красноярская межрайонная клиническая больница скорой медицинской помощи им. Н.С.КарповичаФедеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф.Войно-Ясенецкого" Министерства здравоохранения Российской ФедерацииКраевое государственное бюджетное учреждение здравоохранения «Красноярская межрайонная клиническая больница скорой медицинской помощи им. Н.С.Карповича»1Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф.Войно-Ясенецкого" Министерства здравоохранения Российской Федерации, 660022, Красноярск, Россия. 2Российско-Японский центр микробиологии, метагеномики и инфекционных заболеваний4Международный медицинский образовательно-исследовательский центр (IMERC) Ниигата, ЯпонияРезюме. Гнойно-воспалительные заболевания различной нозологии и этиологии у ВИЧ-инфицированных являются одной из главных причин их гибели. Целью данной работы явилось определение спектра возбудителей внебольничной пневмонии и профиля их резистентности, зависимости от уровня CD4 лимфоцитов, а также выявление роли метициллинрезистентных Staphylococcus aureus и их молекулярно-генетических особенностей у ВИЧ-инфицированных пациентов г. Красноярска. В период 2012-2016 год было обследовано 152 ВИЧ-инфицированных пациента пульмонологического отделения с клиническим диагнозом внебольничная пневмония. От больных забирались мокрота, бронхоальвеолярный лаваж, плевральная жидкость, промывные воды, гной из плевры, а также мазок из носа и зева на выявление микрофлоры, кровь на стерильность. Использован бактериологический метод. Антибиотикочувствительность определяли диско-диффузионным методом; чувствительность стафилококков к проводили методом скрининга, ПЦР, методом серийных разведений в плотной среде в соответствии с международными рекомендациями СLSI, EUCAST. Для генотипирования и определения молекулярно-генетических особенностей – ПЦР, М-ПЦР, секвенирование. Обработку результатов проводили с использованием компьютерной программы WHONET (ВОЗ). Уровень значимости p<0,05. На протяжении всего периода исследования от ВИЧ-инфицированных пациентов неизменно выделялись дрожжеподобные грибы рода Candida (30,4% и 35,6%). Данные микроорганизмы выделялись в монокультуре в этиологически значимом количестве от каждого третьего ВИЧ-инфицированного пациента. При этом они являлись активными ассоциантами, наиболее часто образуя ассоциации с представителями семейства Enterobacteriaceae. При этом, установили, что наиболее часто грибы рода Candida в нижних отделах дыхательных путей выявлялись у ВИЧ-инфицированных с тяжелым иммунодефицитом с уровнем CD4 <200 клеток/мкл. Также были выделены неферментирующие грамотрицательные бактерии (12,9%), стафилококки (8,9%), представители семейства Enterobacteriaceae (4,4%). Микроорганизмы характеризовались полирезистентностью к антимикробным препаратам. Клоном MRSA среди ВИЧ-инфицированных являлся ST239/spa3(t037)/agr1/SCCmecIII.1.1.2(IIIA)/coaIV/tst+; характеризуюшийся высоким уровнем вирулентности и мультирезистентностью. Таким образом, установлено, что в развитии внебольничной пневмонии у ВИЧ-инфицированных пациентов играют роль полирезистентные микроорганизмы, в том числе грибы р. Candida, грамотрицательные микроорганизмы, MRSA, зачастую в составе микробных ассоциаций. Наиболее часто грибы рода Candida выявлялись у ВИЧ-инфицированных с тяжелым иммунодефицитом с уровнем CD4 <200 клеток/мкл. Высокая частота выделение таких штаммов требует коррекции антимикробной терапии внебольничной пневмонии у ВИЧ-инфицированных.Abstract. Purulent-inflammatory diseases of various nosology and etiology in HIV-infected individuals are one of the main causes of their death. The purpose of this work was to determine the spectrum of pathogens of community-acquired pneumonia and their resistance profile, dependence on the level of CD4 lymphocytes, as well as to identify the role of methicillin-resistant Staphylococcus aureus and their molecular genetic characteristics in HIV-infected patients in Krasnoyarsk. In the period 2012-2016, 152 HIV-infected patients of the pulmonary department with a clinical diagnosis of community-acquired pneumonia were examined. Sputum, bronchoalveolar lavage, pleural fluid, wash water, pus from the pleura, as well as a smear from the nose and pharynx for microflora and blood for sterility were taken from patients. Used bacteriological method. Antibiotic sensitivity was determined by the disco-diffusion method; sensitivity of staphylococci to was performed by screening, PCR, serial dilution in a dense medium in accordance with international recommendations CLSI, EUCAST. For genotyping and determination of molecular genetic features - PCR, M-PCR, sequencing. The results were processed using the WHONET computer program (WHO). The significance level is p <0.05. During the entire study period, yeast-like fungi of the genus Candida (30.4% and 35.6%) were consistently isolated from HIV-infected patients. These microorganisms were isolated in a monoculture in an etiologically significant amount from every third HIV-infected patient. At the same time, they were active associates, most often forming associations with members of the Enterobacteriaceae family. At the same time, it was found that the most frequently Candida fungi in the lower respiratory tract were detected in HIV-infected people with severe immunodeficiency with a CD4 level <200 cells / µl. Non fermentative gram-negative bacteria (12.9%), staphylococcus (8.9%), members of the Enterobacteriaceae family (4.4%) were also isolated. Microorganisms were characterized by polyresistance to antimicrobial agents. The MRSA clone among HIV-infected individuals was ST239 / spa3 (t037) /agr1/SCCmecIII.1.1.2 (IIIA) / coaIV / tst +; characterized by high levels of virulence and multiresistance. Thus, it has been established that in the development of community-acquired pneumonia in HIV-infected patients polyresistant microorganisms play a role, including p. Candida, gram-negative microorganisms, MRSA, often as part of microbial associations. Most often, Candida fungi were detected in HIV-infected individuals with severe immunodeficiency with a CD4 level <200 cells / µl. The high frequency of isolation of such strains requires the correction of antimicrobial therapy of community-acquired pneumonia in HIV-infected.https://www.mimmun.ru/mimmun/article/view/1689Ключевые слова: пневмония, ВИЧ-инфицированные, CD4 лимфоциты, микрофлора, антибиотикорезистентность, MRSA, молекулярно-генетические особенности. Keywords: pneumonia, HIV-infected, CD4 lymphocytes, microflora, antibiotic resistance, MRSA, molecular genetic |
| spellingShingle | Внебольничная пневмония у ВИЧ-инфицированных: микрофлора, антибиотикорезистентность роль в развитии в зависимости от уровня CD4 лимфоцитов Community-acquired pneumonia in HIV-infected: microflora, antibiotic resistance, developmental role depending on the Медицинская иммунология Ключевые слова: пневмония, ВИЧ-инфицированные, CD4 лимфоциты, микрофлора, антибиотикорезистентность, MRSA, молекулярно-генетические особенности. Keywords: pneumonia, HIV-infected, CD4 lymphocytes, microflora, antibiotic resistance, MRSA, molecular genetic |
| title | Внебольничная пневмония у ВИЧ-инфицированных: микрофлора, антибиотикорезистентность роль в развитии в зависимости от уровня CD4 лимфоцитов Community-acquired pneumonia in HIV-infected: microflora, antibiotic resistance, developmental role depending on the |
| title_full | Внебольничная пневмония у ВИЧ-инфицированных: микрофлора, антибиотикорезистентность роль в развитии в зависимости от уровня CD4 лимфоцитов Community-acquired pneumonia in HIV-infected: microflora, antibiotic resistance, developmental role depending on the |
| title_fullStr | Внебольничная пневмония у ВИЧ-инфицированных: микрофлора, антибиотикорезистентность роль в развитии в зависимости от уровня CD4 лимфоцитов Community-acquired pneumonia in HIV-infected: microflora, antibiotic resistance, developmental role depending on the |
| title_full_unstemmed | Внебольничная пневмония у ВИЧ-инфицированных: микрофлора, антибиотикорезистентность роль в развитии в зависимости от уровня CD4 лимфоцитов Community-acquired pneumonia in HIV-infected: microflora, antibiotic resistance, developmental role depending on the |
| title_short | Внебольничная пневмония у ВИЧ-инфицированных: микрофлора, антибиотикорезистентность роль в развитии в зависимости от уровня CD4 лимфоцитов Community-acquired pneumonia in HIV-infected: microflora, antibiotic resistance, developmental role depending on the |
| title_sort | внебольничная пневмония у вич инфицированных микрофлора антибиотикорезистентность роль в развитии в зависимости от уровня cd4 лимфоцитов community acquired pneumonia in hiv infected microflora antibiotic resistance developmental role depending on the |
| topic | Ключевые слова: пневмония, ВИЧ-инфицированные, CD4 лимфоциты, микрофлора, антибиотикорезистентность, MRSA, молекулярно-генетические особенности. Keywords: pneumonia, HIV-infected, CD4 lymphocytes, microflora, antibiotic resistance, MRSA, molecular genetic |
| url | https://www.mimmun.ru/mimmun/article/view/1689 |