شناسایی نشانه های انتخاب مرتبط با آترزی دستگاه گوارش در گوساله های هلشتاین
ضایعات انسدادی دستگاه گوارش از مهمترین مشکلات مادرزادی هستند که نتیجه آن، مرگ و میر گوسالهها در مدت کوتاهی بعد از تولد است. ژژنوم شایعترین مکان بعد از مری برای انسداد کامل یا آترزی است که فقدان مادرزادی یا انسداد کامل قسمتی از حفره روده است. شناخت زودرس آترزی برای پیشگیری از عوارض بعدی آن ضروری اس...
| Main Authors: | , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | fas |
| Published: |
University of Guilan
2023-08-01
|
| Series: | تحقیقات تولیدات دامی |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://ar.guilan.ac.ir/article_6900_f5ab4729e3bfe639098b54e227e98d4a.pdf |
| Summary: | ضایعات انسدادی دستگاه گوارش از مهمترین مشکلات مادرزادی هستند که نتیجه آن، مرگ و میر گوسالهها در مدت کوتاهی بعد از تولد است. ژژنوم شایعترین مکان بعد از مری برای انسداد کامل یا آترزی است که فقدان مادرزادی یا انسداد کامل قسمتی از حفره روده است. شناخت زودرس آترزی برای پیشگیری از عوارض بعدی آن ضروری است. هدف پژوهش حاضر، شناسایی نشانههای انتخاب با استفاده از آماره نااریب تتا مرتبط با آترزی دستگاه گوارش در گوسالههای شیری هلشتاین است. به این منظور، مجموع 466 حیوان برای 777962 جایگاه نشانگری چندشکلی تک نوکلئوتیدی (SNP) با استفاده از تراشههای Illumina 777K BovineHD تعیین ژنوتیپ شدند. پس از کنترل کیفیت دادههای اولیه در نهایت، 704242 نشانگر SNP و 466 رأس دام (375 رأس شاهد و 91 رأس موردی) وارد تجزیههای بعدی شدند. با در نظر گرفتن صدک 9/99 کل ارزشهای تتا، هشت ناحیه ژنومی روی کروموزوم‌های 7، 12، 13، 21، 22، 23 (دو نقطه) و 29 شناسایی شدند. بررسی ژنهای گزارش شده در این مناطق نشان داد که در داخل یا مجاورت این نواحی، ژنهای CSF2، SIAH3، TMEM14A و SKIV2L قرار داشتند، که با رشد و توسعه جنین، طول روده کوچک، مرگ سلولی و انواع سرطان مرتبط هستند. همچنین بررسی بیوانفورماتیکی این مناطق نشان داد ژنهای موجود در این مناطق با جایگاههای ژنی کنترلکننده صفات کمّی مرتبط با حساسیت به بیماری و مسیرهای هستیشناسی مرتبط با تنظیم تفرق و تمایز سلولی، فعالیت پروتئینهای کینازی و فعالیت سوخت و ساز سلولی هستند. نتایج این تحقیق میتواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در زمینه شناسایی مناطق ژنومی و در نتیجه ژنهای مرتبط با آترزی در گاوهای هلشتاین فراهم آورد. |
|---|---|
| ISSN: | 2252-0872 2538-6107 |