Profil RAPD Tanaman Kantung Semar Beberapa Koleksi Kebun Raya Baturraden
Telah dilakukan penelitian tentang profil RAPD beberapa tanaman kantung semar (Nepenthes spp.) koleksi Kebun Raya Baturraden. Tujuh individu yang dipelajari merupakan spesies semiendemik Gunung Slamet dan endemik Jawa, yaitu N. adrianii dan N. gymnampora. Metode yang digunakan adalah survei dengan t...
| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Universitas Jenderal Soedirman
2017-09-01
|
| Series: | Majalah Ilmiah Biologi Biosfera: A Scientific Journal |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://journal.bio.unsoed.ac.id/index.php/biosfera/article/view/484 |
| _version_ | 1811277286586974208 |
|---|---|
| author | Retno Mayangsari Agus Hery Susanto Alice Yuniaty |
| author_facet | Retno Mayangsari Agus Hery Susanto Alice Yuniaty |
| author_sort | Retno Mayangsari |
| collection | DOAJ |
| description | Telah dilakukan penelitian tentang profil RAPD beberapa tanaman kantung semar (Nepenthes spp.) koleksi Kebun Raya Baturraden. Tujuh individu yang dipelajari merupakan spesies semiendemik Gunung Slamet dan endemik Jawa, yaitu N. adrianii dan N. gymnampora. Metode yang digunakan adalah survei dengan teknik pengambilan sampel secara acak. DNA genomik sampel diekstraksi untuk kemudian digunakan sebagai templat dalam amplifikasi marka RAPD menggunakan teknik PCR dengan 10 primer acak, yaitu ES10G23, ES10A26, ES10C24, ES10G33, OPA-2, OPA-9, OPA-13, OPB-3, OPB-5, dan OPB-7. Hasil penelitian menunjukkan bahwa ke-10 primer tersebut menghasilkan 43 (67,2%) pita polimorfik dan 21 (32,8%) pita monomorfik dengan ukuran berkisar dari 130 hingga 1.500 bp. OPA-2 and OPB-3 menghasilkan polimorfisme tertinggi, sedangkan ES10G23 dan OPA-13 menghasilkan pita monomorfik terbanyak. Dendogram yang dikonstruksi menggunakan UPGMA dalam MEGA 6.06 memperlihatkan bahwa dua klaster terbentuk pada jarak genetik 18%. Kedua klaster tersebut cenderung dipisahkan oleh lokasi geografi. |
| first_indexed | 2024-04-13T00:13:00Z |
| format | Article |
| id | doaj.art-decd01e583344edea6b2dc695ed6b2ed |
| institution | Directory Open Access Journal |
| issn | 0853-1625 2528-2050 |
| language | English |
| last_indexed | 2024-04-13T00:13:00Z |
| publishDate | 2017-09-01 |
| publisher | Universitas Jenderal Soedirman |
| record_format | Article |
| series | Majalah Ilmiah Biologi Biosfera: A Scientific Journal |
| spelling | doaj.art-decd01e583344edea6b2dc695ed6b2ed2022-12-22T03:11:02ZengUniversitas Jenderal SoedirmanMajalah Ilmiah Biologi Biosfera: A Scientific Journal0853-16252528-20502017-09-01342899710.20884/1.mib.2017.34.2.484357Profil RAPD Tanaman Kantung Semar Beberapa Koleksi Kebun Raya BaturradenRetno Mayangsari0Agus Hery Susanto1Alice Yuniaty2Fakultas Biologi Universitas Jenderal SoedirmanFakultas Biologi Universitas Jenderal Soedirman PurwokertoFakultas Biologi Universitas Jenderal SoedirmanTelah dilakukan penelitian tentang profil RAPD beberapa tanaman kantung semar (Nepenthes spp.) koleksi Kebun Raya Baturraden. Tujuh individu yang dipelajari merupakan spesies semiendemik Gunung Slamet dan endemik Jawa, yaitu N. adrianii dan N. gymnampora. Metode yang digunakan adalah survei dengan teknik pengambilan sampel secara acak. DNA genomik sampel diekstraksi untuk kemudian digunakan sebagai templat dalam amplifikasi marka RAPD menggunakan teknik PCR dengan 10 primer acak, yaitu ES10G23, ES10A26, ES10C24, ES10G33, OPA-2, OPA-9, OPA-13, OPB-3, OPB-5, dan OPB-7. Hasil penelitian menunjukkan bahwa ke-10 primer tersebut menghasilkan 43 (67,2%) pita polimorfik dan 21 (32,8%) pita monomorfik dengan ukuran berkisar dari 130 hingga 1.500 bp. OPA-2 and OPB-3 menghasilkan polimorfisme tertinggi, sedangkan ES10G23 dan OPA-13 menghasilkan pita monomorfik terbanyak. Dendogram yang dikonstruksi menggunakan UPGMA dalam MEGA 6.06 memperlihatkan bahwa dua klaster terbentuk pada jarak genetik 18%. Kedua klaster tersebut cenderung dipisahkan oleh lokasi geografi.https://journal.bio.unsoed.ac.id/index.php/biosfera/article/view/484kantung semarRAPDKebun Raya Baturraden |
| spellingShingle | Retno Mayangsari Agus Hery Susanto Alice Yuniaty Profil RAPD Tanaman Kantung Semar Beberapa Koleksi Kebun Raya Baturraden Majalah Ilmiah Biologi Biosfera: A Scientific Journal kantung semar RAPD Kebun Raya Baturraden |
| title | Profil RAPD Tanaman Kantung Semar Beberapa Koleksi Kebun Raya Baturraden |
| title_full | Profil RAPD Tanaman Kantung Semar Beberapa Koleksi Kebun Raya Baturraden |
| title_fullStr | Profil RAPD Tanaman Kantung Semar Beberapa Koleksi Kebun Raya Baturraden |
| title_full_unstemmed | Profil RAPD Tanaman Kantung Semar Beberapa Koleksi Kebun Raya Baturraden |
| title_short | Profil RAPD Tanaman Kantung Semar Beberapa Koleksi Kebun Raya Baturraden |
| title_sort | profil rapd tanaman kantung semar beberapa koleksi kebun raya baturraden |
| topic | kantung semar RAPD Kebun Raya Baturraden |
| url | https://journal.bio.unsoed.ac.id/index.php/biosfera/article/view/484 |
| work_keys_str_mv | AT retnomayangsari profilrapdtanamankantungsemarbeberapakoleksikebunrayabaturraden AT agusherysusanto profilrapdtanamankantungsemarbeberapakoleksikebunrayabaturraden AT aliceyuniaty profilrapdtanamankantungsemarbeberapakoleksikebunrayabaturraden |