Selección de Características de Microarreglos de ADN Utilizando una Búsqueda Cuckoo
En este artículo, se propone un método híbrido para la selección y clasificación de datos de microarreglos de AND. Primero, el método combina los subconjuntos de genes relevantes obtenidos de cinco métodos de filtro, después, se implementa un algoritmo basado en una búsqueda cuckoo combinado con un...
Main Authors: | , , |
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Format: | Article |
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Published: |
Universidad Autónoma del Estado de Morelos
2019-10-01
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Series: | Programación Matemática y Software |
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Online Access: | https://progmat.uaem.mx/progmat/index.php/progmat/article/view/212 |
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author | Luis Alberto Hernández Montiel Carlos Edgardo Cruz Pérez Luis David Hernández Huerta |
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En este artículo, se propone un método híbrido para la selección y clasificación de datos de microarreglos de AND. Primero, el método combina los subconjuntos de genes relevantes obtenidos de cinco métodos de filtro, después, se implementa un algoritmo basado en una búsqueda cuckoo combinado con un clasificador MSV. El algoritmo híbrido explora dentro del subconjunto obtenido en la etapa anterior y selecciona los genes que alcanzan un alto desempeño al entrenar al clasificador. En los resultados experimentales, el algoritmo obtiene una tasa de clasificación alta seleccionado un número pequeño de genes, los resultados obtenidos son comparados con otros métodos reportados en la literatura.
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institution | Directory Open Access Journal |
issn | 2007-3283 |
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publishDate | 2019-10-01 |
publisher | Universidad Autónoma del Estado de Morelos |
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spelling | doaj.art-ede3552a30a24fe8ab4f9623db4a1fe52023-04-28T18:01:54ZengUniversidad Autónoma del Estado de MorelosProgramación Matemática y Software2007-32832019-10-01113Selección de Características de Microarreglos de ADN Utilizando una Búsqueda CuckooLuis Alberto Hernández Montiel0Carlos Edgardo Cruz Pérez1Luis David Hernández Huerta2Universidad del Istmo, Campus Ixtepec (UNISTMO), Ciudad Ixtepec, Oaxaca, México, 70110Universidad del Istmo, Campus Ixtepec (UNISTMO), Ciudad Ixtepec, Oaxaca, México, 70110Universidad del Istmo, Campus Ixtepec (UNISTMO), Ciudad Ixtepec, Oaxaca, México, 70110 En este artículo, se propone un método híbrido para la selección y clasificación de datos de microarreglos de AND. Primero, el método combina los subconjuntos de genes relevantes obtenidos de cinco métodos de filtro, después, se implementa un algoritmo basado en una búsqueda cuckoo combinado con un clasificador MSV. El algoritmo híbrido explora dentro del subconjunto obtenido en la etapa anterior y selecciona los genes que alcanzan un alto desempeño al entrenar al clasificador. En los resultados experimentales, el algoritmo obtiene una tasa de clasificación alta seleccionado un número pequeño de genes, los resultados obtenidos son comparados con otros métodos reportados en la literatura. https://progmat.uaem.mx/progmat/index.php/progmat/article/view/212Microarreglos de ADNPreprocesamientoFusión de filtrosSelecciónClasificación |
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