SparkBLAST: scalable BLAST processing using in-memory operations

Abstract Background The demand for processing ever increasing amounts of genomic data has raised new challenges for the implementation of highly scalable and efficient computational systems. In this paper we propose SparkBLAST, a parallelization of a sequence alignment application (BLAST) that emplo...

Πλήρης περιγραφή

Λεπτομέρειες βιβλιογραφικής εγγραφής
Κύριοι συγγραφείς: Marcelo Rodrigo de Castro, Catherine dos Santos Tostes, Alberto M. R. Dávila, Hermes Senger, Fabricio A. B. da Silva
Μορφή: Άρθρο
Γλώσσα:English
Έκδοση: BMC 2017-06-01
Σειρά:BMC Bioinformatics
Θέματα:
Διαθέσιμο Online:http://link.springer.com/article/10.1186/s12859-017-1723-8