Be positive: customized reference databases and new, local barcodes balance false taxonomic assignments in metabarcoding studies
Background In metabarcoding analyses, the taxonomic assignment is crucial to place sequencing data in biological and ecological contexts. This fundamental step depends on a reference database, which should have a good taxonomic coverage to avoid unassigned sequences. However, this goal is rarely ach...
Հիմնական հեղինակներ: | Francesco Mugnai, Federica Costantini, Anne Chenuil, Michèle Leduc, José Miguel Gutiérrez Ortega, Emese Meglécz |
---|---|
Ձևաչափ: | Հոդված |
Լեզու: | English |
Հրապարակվել է: |
PeerJ Inc.
2023-01-01
|
Շարք: | PeerJ |
Խորագրեր: | |
Առցանց հասանելիություն: | https://peerj.com/articles/14616.pdf |
Նմանատիպ նյութեր
-
How reliable is metabarcoding for pollen identification? An evaluation of different taxonomic assignment strategies by cross-validation
: Gilles San Martin, և այլն
Հրապարակվել է: (2024-01-01) -
An improved statistical model for taxonomic assignment of metagenomics
: Yujing Yao, և այլն
Հրապարակվել է: (2018-10-01) -
Tackling critical parameters in metazoan meta-barcoding experiments: a preliminary study based on coxI DNA barcode
: Bachir Balech, և այլն
Հրապարակվել է: (2018-06-01) -
A Custom Regional DNA Barcode Reference Library for Lichen-Forming Fungi of the Intermountain West, USA, Increases Successful Specimen Identification
: Michael Kerr, և այլն
Հրապարակվել է: (2023-07-01) -
Using Gap Visualization to Navigate Multivariate Metabarcode Data, Select Primer Pairs, and Enhance Reference Data Quality
: Xin‐Yi Chua, և այլն
Հրապարակվել է: (2024-11-01)