Método acoplado Autodock-PM6 para seleccionar la mejor pose en estudios de Acoplamiento Molecular

<p>El Acoplamiento Molecular (Docking) es una técnica de Mecánica Molecular ampliamente utilizada para predecir energías y modos de enlace entre ligandos y proteínas, lo que proporciona información de gran utilidad para el estudio de nuevos compuestos con efectos terapéuticos. No obstante, los...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: Margarita Velasquez, Juan Drosos, Carlos Gueto, Johana Márquez, Ricardo Vivas-Reyes
Format: Article
Language:English
Published: Universidad Nacional de Colombia 2014-07-01
Series:Revista Colombiana de Química
Online Access:http://www.revistas.unal.edu.co/index.php/rcolquim/article/view/44409
Description
Summary:<p>El Acoplamiento Molecular (Docking) es una técnica de Mecánica Molecular ampliamente utilizada para predecir energías y modos de enlace entre ligandos y proteínas, lo que proporciona información de gran utilidad para el estudio de nuevos compuestos con efectos terapéuticos. No obstante, los resultados obtenidos mediante esta técnica tienden a la subjetividad, debido a que los programas utilizados para llevarla a cabo proporcionan más de un criterio de selección de la mejor pose. En la presente investigación, se aplicó el método semiempírico PM6 a los resultados del acoplamiento, obteniendo con ello mejorarías en el proceso de selección de la mejor pose al observarse finalmente poses con alta probabilidad de unión al sitio activo de su receptor y con energías de unión menores a las reportadas por los criterios de selección ofrecidos por el programa de Docking.</p><p> </p>
ISSN:0120-2804
2357-3791