SEQUENCIAMENTO DE NOVA GERAÇÃO DE ANTÍGENOS ERITROCITÁRIOS EM TRANSFUSÕES SANGUÍNEAS – REVISÃO SISTEMÁTICA E META-ANÁLISE
Introdução: A análise molecular de grupos sanguíneos em bancos de sangue é geralmente realizada por meio da genotipagem de SNPs, uma estratégia bem estabelecida porém limitada aos principais polimorfismos, o que pode resultar na não detecção de variantes capazes de alterar a expressão antigênica. Pa...
| Main Authors: | , , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Elsevier
2023-10-01
|
| Series: | Hematology, Transfusion and Cell Therapy |
| Online Access: | http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S253113792301338X |
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|---|---|
| author | CGR Silva CGR Matosinho MM Lobato LC Schmidt MC Silva-Malta |
| author_facet | CGR Silva CGR Matosinho MM Lobato LC Schmidt MC Silva-Malta |
| author_sort | CGR Silva |
| collection | DOAJ |
| description | Introdução: A análise molecular de grupos sanguíneos em bancos de sangue é geralmente realizada por meio da genotipagem de SNPs, uma estratégia bem estabelecida porém limitada aos principais polimorfismos, o que pode resultar na não detecção de variantes capazes de alterar a expressão antigênica. Para superar essa limitação, técnicas de sequenciamento têm sido aplicadas. Objetivos: Avaliar a aplicabilidade do Sequenciamento de Nova Geração (NGS) na determinação de antígenos eritrocitários. Metodologia: Foi feita uma pesquisa abrangente na literatura e seleção dos artigos de acordo com critérios pré-definidos, utilizando os guias PRISMA e STROBE. Alelos dos sistemas Kell, Kidd e Duffy foram selecionados como modelo. A metanálise foi conduzida utilizando o software MedCalc. Resultados e discussão: As características e resultados dos estudos (proporção de concordância) foram extraídos e a meta-análise foi feita para verificar a concordância entre métodos moleculares padrão e NGS. Dos 864 estudos elegíveis identificados, 11 atenderam aos critérios de inclusão e exclusão e foram selecionados para metanálise. A proporção de concordância agrupada comparando o NGS e outros métodos para os SNVs rs8176058 (Kell), rs2814778, rs12078 (Duffy) e rs1085396 (Kidd) variou de 0,982 a 0,994. Aparente ausência de heterogeneidade foi observada (I2 = 0% para todos os polimorfismos estudados). Alguns estudos relataram dificuldade em analisar sistemas mais complexos, como Rh e MNS, exigindo a adoção de abordagens específicas. Conclusão: NGS é eficaz na inferência de fenótipos eritrocitários e tem vantagens como a possibilidade de analisar simultaneamente um grande número de indivíduos e regiões gênicas, e a capacidade de fornecer análise genética abrangente, o que é útil na descrição de novos alelos e na melhor compreensão da base genética dos grupos sanguíneos. A implementação de NGS nos bancos de sangue depende de fatores como redução de custos, disponibilidade de painéis amplamente validados, estabelecimento de parâmetros de qualidade claros e acesso a ferramentas de análise bioinformática fáceis de acessar e operar. Apoio financeiro: Fapemig e Fundação Hemminas. |
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| issn | 2531-1379 |
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| publishDate | 2023-10-01 |
| publisher | Elsevier |
| record_format | Article |
| series | Hematology, Transfusion and Cell Therapy |
| spelling | doaj.art-f76a48b25cc74fddba014321dc7df6802023-10-20T06:45:23ZengElsevierHematology, Transfusion and Cell Therapy2531-13792023-10-0145S638S639SEQUENCIAMENTO DE NOVA GERAÇÃO DE ANTÍGENOS ERITROCITÁRIOS EM TRANSFUSÕES SANGUÍNEAS – REVISÃO SISTEMÁTICA E META-ANÁLISECGR Silva0CGR Matosinho1MM Lobato2LC Schmidt3MC Silva-Malta4Fundação Centro de Hematologia e Hemoterapia do Estado de Minas Gerais (Hemominas), Belo Horizonte, MG, BrasilFundação Centro de Hematologia e Hemoterapia do Estado de Minas Gerais (Hemominas), Belo Horizonte, MG, BrasilFundação Centro de Hematologia e Hemoterapia do Estado de Minas Gerais (Hemominas), Belo Horizonte, MG, BrasilFundação Centro de Hematologia e Hemoterapia do Estado de Minas Gerais (Hemominas), Belo Horizonte, MG, BrasilFundação Centro de Hematologia e Hemoterapia do Estado de Minas Gerais (Hemominas), Belo Horizonte, MG, BrasilIntrodução: A análise molecular de grupos sanguíneos em bancos de sangue é geralmente realizada por meio da genotipagem de SNPs, uma estratégia bem estabelecida porém limitada aos principais polimorfismos, o que pode resultar na não detecção de variantes capazes de alterar a expressão antigênica. Para superar essa limitação, técnicas de sequenciamento têm sido aplicadas. Objetivos: Avaliar a aplicabilidade do Sequenciamento de Nova Geração (NGS) na determinação de antígenos eritrocitários. Metodologia: Foi feita uma pesquisa abrangente na literatura e seleção dos artigos de acordo com critérios pré-definidos, utilizando os guias PRISMA e STROBE. Alelos dos sistemas Kell, Kidd e Duffy foram selecionados como modelo. A metanálise foi conduzida utilizando o software MedCalc. Resultados e discussão: As características e resultados dos estudos (proporção de concordância) foram extraídos e a meta-análise foi feita para verificar a concordância entre métodos moleculares padrão e NGS. Dos 864 estudos elegíveis identificados, 11 atenderam aos critérios de inclusão e exclusão e foram selecionados para metanálise. A proporção de concordância agrupada comparando o NGS e outros métodos para os SNVs rs8176058 (Kell), rs2814778, rs12078 (Duffy) e rs1085396 (Kidd) variou de 0,982 a 0,994. Aparente ausência de heterogeneidade foi observada (I2 = 0% para todos os polimorfismos estudados). Alguns estudos relataram dificuldade em analisar sistemas mais complexos, como Rh e MNS, exigindo a adoção de abordagens específicas. Conclusão: NGS é eficaz na inferência de fenótipos eritrocitários e tem vantagens como a possibilidade de analisar simultaneamente um grande número de indivíduos e regiões gênicas, e a capacidade de fornecer análise genética abrangente, o que é útil na descrição de novos alelos e na melhor compreensão da base genética dos grupos sanguíneos. A implementação de NGS nos bancos de sangue depende de fatores como redução de custos, disponibilidade de painéis amplamente validados, estabelecimento de parâmetros de qualidade claros e acesso a ferramentas de análise bioinformática fáceis de acessar e operar. Apoio financeiro: Fapemig e Fundação Hemminas.http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S253113792301338X |
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