Polimorfismos en la longitud de fragmentos amplificados (AFLP´s) a partir de muestras de sangre almacenadas en tarjetas FTA® para la especie Cavia porcellus Lin. (Rodentia: Caviidae) Amplified Fragments Length Polymorphisms (AFLP´s) from blood samples stored in FTA® cards for Cavia porcellus

Una manera eficaz de establecer el grado de variabilidad entre y dentro de poblaciones, es a través del análisis de polimorfismos de ADN con marcadores moleculares como los AFLP`s. En este artículo se presenta una metodología que combina la utilización de tarjetas de FTA® (Whatman Bioscience, Cambri...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: William Burgos-Paz, Carol Rosero-Galindo, Heiber Cárdenas-Henao, Carlos Solarte-Portilla
Format: Article
Language:English
Published: Universidad de Antioquia 2007-01-01
Series:Revista Colombiana de Ciencias Pecuarias
Subjects:
Online Access:http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-06902007000100008
_version_ 1828928009949675520
author William Burgos-Paz
Carol Rosero-Galindo
Heiber Cárdenas-Henao
Carlos Solarte-Portilla
author_facet William Burgos-Paz
Carol Rosero-Galindo
Heiber Cárdenas-Henao
Carlos Solarte-Portilla
author_sort William Burgos-Paz
collection DOAJ
description Una manera eficaz de establecer el grado de variabilidad entre y dentro de poblaciones, es a través del análisis de polimorfismos de ADN con marcadores moleculares como los AFLP`s. En este artículo se presenta una metodología que combina la utilización de tarjetas de FTA® (Whatman Bioscience, Cambridge) para colección y conservación de muestras de sangre, con los procedimientos de extracción de ADN y obtención de marcadores AFLP´s, aspectos sobre los cuales no existen antecedentes para la especie Cavia porcellus. Se utilizaron muestras de ADN procedentes de tres poblaciones, dos criollas y una mejorada genéticamente obtenida a partir de un pie de cría procedente del Perú y sometida a selección en Colombia durante varias generaciones. Todos los animales procedieron de la Granja "Botana", propiedad de la Universidad de Nariño, Pasto-Colombia. Para la detección de polimorfismos en la longitud de los fragmentos (AFLP`s) se utilizaron uno, tres y cinco discos FTA® de 1.2 mm, cada disco con aproximadamente 25 ng de ADN. Los ensayos indicaron que los mejores productos de amplificación, para la visualización de AFLP´s, se obtuvieron de muestras con tres discos de FTA® por individuo, lo que sugiere que con esta metodología, 75 ng de ADN por animal son suficientes para detectar polimorfismos de alta calidad en el genoma de Cavia porcellus. Se recomienda el uso de las tarjetas de FTA® para el estudio genético de poblaciones de Cavia porcellus, con las modificaciones metodológicas descritas en este artículo para marcadores AFLP´s.<br>A methodology that includes the use of FTA® (Whatman Bioscience, Cambridge) to collect and store animals` blood samples and the procedures to extract and to get AFLP markers is presented in this paper. A review of the literature indicates that there are no reports concerning both aspects for the Cavia porcellus case. To reach our goal blood samples of three populations - Two native ones and other genetically improved- were obtained through heart puncture. This blood was stored in the FTA cards in order to extract, purify, amplify and analyze their DNA forms. All of the animals came from "Botana" farm of the Universidad de Nariño, located in Pasto, Colombia. For amplifying the AFLP one, three and five 1.2 mm FTA disks of approximately 75 ng of DNA per disk where used. The tests indicated that the best products to amplify and to visualize the AFLP where those ones obtained from samples of three FTA disks per animal. This suggests that 75 ng of DNA per animal is enough to generate AFLP of high quality in the Cavia porcellus` genome. We recommend the use of FTA cards to carry out genetic analyses in the Cavia porcellus, including the methodology modifications presented in this paper.
first_indexed 2024-12-13T23:58:11Z
format Article
id doaj.art-fb3428e0765f4879ac0f5bbd1fc847c4
institution Directory Open Access Journal
issn 0120-0690
language English
last_indexed 2024-12-13T23:58:11Z
publishDate 2007-01-01
publisher Universidad de Antioquia
record_format Article
series Revista Colombiana de Ciencias Pecuarias
spelling doaj.art-fb3428e0765f4879ac0f5bbd1fc847c42022-12-21T23:26:29ZengUniversidad de AntioquiaRevista Colombiana de Ciencias Pecuarias0120-06902007-01-012016772Polimorfismos en la longitud de fragmentos amplificados (AFLP´s) a partir de muestras de sangre almacenadas en tarjetas FTA® para la especie Cavia porcellus Lin. (Rodentia: Caviidae) Amplified Fragments Length Polymorphisms (AFLP´s) from blood samples stored in FTA® cards for Cavia porcellusWilliam Burgos-PazCarol Rosero-GalindoHeiber Cárdenas-HenaoCarlos Solarte-PortillaUna manera eficaz de establecer el grado de variabilidad entre y dentro de poblaciones, es a través del análisis de polimorfismos de ADN con marcadores moleculares como los AFLP`s. En este artículo se presenta una metodología que combina la utilización de tarjetas de FTA® (Whatman Bioscience, Cambridge) para colección y conservación de muestras de sangre, con los procedimientos de extracción de ADN y obtención de marcadores AFLP´s, aspectos sobre los cuales no existen antecedentes para la especie Cavia porcellus. Se utilizaron muestras de ADN procedentes de tres poblaciones, dos criollas y una mejorada genéticamente obtenida a partir de un pie de cría procedente del Perú y sometida a selección en Colombia durante varias generaciones. Todos los animales procedieron de la Granja "Botana", propiedad de la Universidad de Nariño, Pasto-Colombia. Para la detección de polimorfismos en la longitud de los fragmentos (AFLP`s) se utilizaron uno, tres y cinco discos FTA® de 1.2 mm, cada disco con aproximadamente 25 ng de ADN. Los ensayos indicaron que los mejores productos de amplificación, para la visualización de AFLP´s, se obtuvieron de muestras con tres discos de FTA® por individuo, lo que sugiere que con esta metodología, 75 ng de ADN por animal son suficientes para detectar polimorfismos de alta calidad en el genoma de Cavia porcellus. Se recomienda el uso de las tarjetas de FTA® para el estudio genético de poblaciones de Cavia porcellus, con las modificaciones metodológicas descritas en este artículo para marcadores AFLP´s.<br>A methodology that includes the use of FTA® (Whatman Bioscience, Cambridge) to collect and store animals` blood samples and the procedures to extract and to get AFLP markers is presented in this paper. A review of the literature indicates that there are no reports concerning both aspects for the Cavia porcellus case. To reach our goal blood samples of three populations - Two native ones and other genetically improved- were obtained through heart puncture. This blood was stored in the FTA cards in order to extract, purify, amplify and analyze their DNA forms. All of the animals came from "Botana" farm of the Universidad de Nariño, located in Pasto, Colombia. For amplifying the AFLP one, three and five 1.2 mm FTA disks of approximately 75 ng of DNA per disk where used. The tests indicated that the best products to amplify and to visualize the AFLP where those ones obtained from samples of three FTA disks per animal. This suggests that 75 ng of DNA per animal is enough to generate AFLP of high quality in the Cavia porcellus` genome. We recommend the use of FTA cards to carry out genetic analyses in the Cavia porcellus, including the methodology modifications presented in this paper.http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-06902007000100008AFLP´sCavia porcellusFTAAFLP´sCavia porcellusFTA
spellingShingle William Burgos-Paz
Carol Rosero-Galindo
Heiber Cárdenas-Henao
Carlos Solarte-Portilla
Polimorfismos en la longitud de fragmentos amplificados (AFLP´s) a partir de muestras de sangre almacenadas en tarjetas FTA® para la especie Cavia porcellus Lin. (Rodentia: Caviidae) Amplified Fragments Length Polymorphisms (AFLP´s) from blood samples stored in FTA® cards for Cavia porcellus
Revista Colombiana de Ciencias Pecuarias
AFLP´s
Cavia porcellus
FTA
AFLP´s
Cavia porcellus
FTA
title Polimorfismos en la longitud de fragmentos amplificados (AFLP´s) a partir de muestras de sangre almacenadas en tarjetas FTA® para la especie Cavia porcellus Lin. (Rodentia: Caviidae) Amplified Fragments Length Polymorphisms (AFLP´s) from blood samples stored in FTA® cards for Cavia porcellus
title_full Polimorfismos en la longitud de fragmentos amplificados (AFLP´s) a partir de muestras de sangre almacenadas en tarjetas FTA® para la especie Cavia porcellus Lin. (Rodentia: Caviidae) Amplified Fragments Length Polymorphisms (AFLP´s) from blood samples stored in FTA® cards for Cavia porcellus
title_fullStr Polimorfismos en la longitud de fragmentos amplificados (AFLP´s) a partir de muestras de sangre almacenadas en tarjetas FTA® para la especie Cavia porcellus Lin. (Rodentia: Caviidae) Amplified Fragments Length Polymorphisms (AFLP´s) from blood samples stored in FTA® cards for Cavia porcellus
title_full_unstemmed Polimorfismos en la longitud de fragmentos amplificados (AFLP´s) a partir de muestras de sangre almacenadas en tarjetas FTA® para la especie Cavia porcellus Lin. (Rodentia: Caviidae) Amplified Fragments Length Polymorphisms (AFLP´s) from blood samples stored in FTA® cards for Cavia porcellus
title_short Polimorfismos en la longitud de fragmentos amplificados (AFLP´s) a partir de muestras de sangre almacenadas en tarjetas FTA® para la especie Cavia porcellus Lin. (Rodentia: Caviidae) Amplified Fragments Length Polymorphisms (AFLP´s) from blood samples stored in FTA® cards for Cavia porcellus
title_sort polimorfismos en la longitud de fragmentos amplificados aflp´s a partir de muestras de sangre almacenadas en tarjetas fta r para la especie cavia porcellus lin rodentia caviidae amplified fragments length polymorphisms aflp´s from blood samples stored in fta r cards for cavia porcellus
topic AFLP´s
Cavia porcellus
FTA
AFLP´s
Cavia porcellus
FTA
url http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-06902007000100008
work_keys_str_mv AT williamburgospaz polimorfismosenlalongituddefragmentosamplificadosaflpsapartirdemuestrasdesangrealmacenadasentarjetasftaparalaespeciecaviaporcelluslinrodentiacaviidaeamplifiedfragmentslengthpolymorphismsaflpsfrombloodsamplesstoredinftacardsforcaviaporcellus
AT carolroserogalindo polimorfismosenlalongituddefragmentosamplificadosaflpsapartirdemuestrasdesangrealmacenadasentarjetasftaparalaespeciecaviaporcelluslinrodentiacaviidaeamplifiedfragmentslengthpolymorphismsaflpsfrombloodsamplesstoredinftacardsforcaviaporcellus
AT heibercardenashenao polimorfismosenlalongituddefragmentosamplificadosaflpsapartirdemuestrasdesangrealmacenadasentarjetasftaparalaespeciecaviaporcelluslinrodentiacaviidaeamplifiedfragmentslengthpolymorphismsaflpsfrombloodsamplesstoredinftacardsforcaviaporcellus
AT carlossolarteportilla polimorfismosenlalongituddefragmentosamplificadosaflpsapartirdemuestrasdesangrealmacenadasentarjetasftaparalaespeciecaviaporcelluslinrodentiacaviidaeamplifiedfragmentslengthpolymorphismsaflpsfrombloodsamplesstoredinftacardsforcaviaporcellus