Komparasi in SilicoSekuens PCDNA-Ca dengan Sekuens Capsid Lentivirus Sebagai Kandidat Vaksin DNA
Virus penyakit Jembrana merupakan Lentivirus yang menyerang sapi. DNA vaksin telah terbukti efektif dalam menginduksi efek protektif terhadap hewan yang terinfeksi Lentivirus. Sebagai kandidat vaksin virus penyakit Jembrana, konstruk pcDNA-CA memiliki potensi yang tinggi. Hasil sekuensing gen gag-...
| Main Authors: | , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Sekolah Pasca Sarjana Universitas Gadjah Mada
2015
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://repository.ugm.ac.id/276285/1/79%20Komparasi%20in%20Silico%20Sekuens%20PCDNA-Ca%20%2B%20sertifikat.pdf |
| _version_ | 1826050042266386432 |
|---|---|
| author | Kusumawati, Asmarani Kaitu, Renny A.M. Fatimah, Fatimah Hartati, Sri |
| author_facet | Kusumawati, Asmarani Kaitu, Renny A.M. Fatimah, Fatimah Hartati, Sri |
| author_sort | Kusumawati, Asmarani |
| collection | UGM |
| description | Virus penyakit Jembrana merupakan Lentivirus yang menyerang sapi. DNA vaksin telah terbukti efektif dalam menginduksi efek protektif terhadap hewan yang terinfeksi Lentivirus. Sebagai kandidat vaksin virus penyakit Jembrana, konstruk pcDNA-CA memiliki potensi yang
tinggi. Hasil sekuensing gen gag-ca sebagai klon positif dari pcDNA-CA dikomparasikan dengan sekuens Lentivirus lainnya seperti virus HIV (Human Immunodeficiency Virus), dan BIV (Bovine Immunodeficiency Virus) menggunakan aplikasi bioinformatika. Hasilnya menunjukkan bahwa sekuens gen gag-ca pcDNA-CA memiliki tingkat perbedaan yang tinggi sehingga tidak akan dikenali sebagai gen dari lentivirus yang lain saat diberikan dalam bentuk vaksin.. Selain itu, hasil sekuensing gen gag-ca pcDNA-CA juga dikomparasikan dengan sekuens virus penyakit Jembrana dari strain yang berbeda. Hasilnya menunjukkan bahwa gen
gag-ca pcDNA-CA memiliki tingkat kemiripan yang sangat tinggi dilihat dari hasil alignment dan persentasinya (93-100%) dengan beberapa strain virus penyakit Jembrana yang berasal dari beberapa daerah di Indonesia.
Berdasarkan kedua perbandingan ini, disimpulkan bahwa konstruk gen gag pcDNA-CA memiliki potensi yang baik untuk dikembangkan sebagai DNA vaksin.
Kata Kunci : DNA vaksin, Virus Penyakit Jembrana, gen gag pcDNA-CA |
| first_indexed | 2024-03-13T23:57:12Z |
| format | Article |
| id | oai:generic.eprints.org:276285 |
| institution | Universiti Gadjah Mada |
| language | English |
| last_indexed | 2024-03-13T23:57:12Z |
| publishDate | 2015 |
| publisher | Sekolah Pasca Sarjana Universitas Gadjah Mada |
| record_format | dspace |
| spelling | oai:generic.eprints.org:2762852021-01-08T04:01:33Z https://repository.ugm.ac.id/276285/ Komparasi in SilicoSekuens PCDNA-Ca dengan Sekuens Capsid Lentivirus Sebagai Kandidat Vaksin DNA Kusumawati, Asmarani Kaitu, Renny A.M. Fatimah, Fatimah Hartati, Sri Veterinary Sciences Virus penyakit Jembrana merupakan Lentivirus yang menyerang sapi. DNA vaksin telah terbukti efektif dalam menginduksi efek protektif terhadap hewan yang terinfeksi Lentivirus. Sebagai kandidat vaksin virus penyakit Jembrana, konstruk pcDNA-CA memiliki potensi yang tinggi. Hasil sekuensing gen gag-ca sebagai klon positif dari pcDNA-CA dikomparasikan dengan sekuens Lentivirus lainnya seperti virus HIV (Human Immunodeficiency Virus), dan BIV (Bovine Immunodeficiency Virus) menggunakan aplikasi bioinformatika. Hasilnya menunjukkan bahwa sekuens gen gag-ca pcDNA-CA memiliki tingkat perbedaan yang tinggi sehingga tidak akan dikenali sebagai gen dari lentivirus yang lain saat diberikan dalam bentuk vaksin.. Selain itu, hasil sekuensing gen gag-ca pcDNA-CA juga dikomparasikan dengan sekuens virus penyakit Jembrana dari strain yang berbeda. Hasilnya menunjukkan bahwa gen gag-ca pcDNA-CA memiliki tingkat kemiripan yang sangat tinggi dilihat dari hasil alignment dan persentasinya (93-100%) dengan beberapa strain virus penyakit Jembrana yang berasal dari beberapa daerah di Indonesia. Berdasarkan kedua perbandingan ini, disimpulkan bahwa konstruk gen gag pcDNA-CA memiliki potensi yang baik untuk dikembangkan sebagai DNA vaksin. Kata Kunci : DNA vaksin, Virus Penyakit Jembrana, gen gag pcDNA-CA Sekolah Pasca Sarjana Universitas Gadjah Mada 2015-10-31 Article PeerReviewed application/pdf en https://repository.ugm.ac.id/276285/1/79%20Komparasi%20in%20Silico%20Sekuens%20PCDNA-Ca%20%2B%20sertifikat.pdf Kusumawati, Asmarani and Kaitu, Renny A.M. and Fatimah, Fatimah and Hartati, Sri (2015) Komparasi in SilicoSekuens PCDNA-Ca dengan Sekuens Capsid Lentivirus Sebagai Kandidat Vaksin DNA. PROSIDING Seminar Nasional Bioteknologi III Universitas Gadjah Mada. pp. 198-206. ISSN 978-602-8683-09-8 |
| spellingShingle | Veterinary Sciences Kusumawati, Asmarani Kaitu, Renny A.M. Fatimah, Fatimah Hartati, Sri Komparasi in SilicoSekuens PCDNA-Ca dengan Sekuens Capsid Lentivirus Sebagai Kandidat Vaksin DNA |
| title | Komparasi in SilicoSekuens PCDNA-Ca dengan Sekuens Capsid Lentivirus Sebagai Kandidat Vaksin DNA |
| title_full | Komparasi in SilicoSekuens PCDNA-Ca dengan Sekuens Capsid Lentivirus Sebagai Kandidat Vaksin DNA |
| title_fullStr | Komparasi in SilicoSekuens PCDNA-Ca dengan Sekuens Capsid Lentivirus Sebagai Kandidat Vaksin DNA |
| title_full_unstemmed | Komparasi in SilicoSekuens PCDNA-Ca dengan Sekuens Capsid Lentivirus Sebagai Kandidat Vaksin DNA |
| title_short | Komparasi in SilicoSekuens PCDNA-Ca dengan Sekuens Capsid Lentivirus Sebagai Kandidat Vaksin DNA |
| title_sort | komparasi in silicosekuens pcdna ca dengan sekuens capsid lentivirus sebagai kandidat vaksin dna |
| topic | Veterinary Sciences |
| url | https://repository.ugm.ac.id/276285/1/79%20Komparasi%20in%20Silico%20Sekuens%20PCDNA-Ca%20%2B%20sertifikat.pdf |
| work_keys_str_mv | AT kusumawatiasmarani komparasiinsilicosekuenspcdnacadengansekuenscapsidlentivirussebagaikandidatvaksindna AT kaiturennyam komparasiinsilicosekuenspcdnacadengansekuenscapsidlentivirussebagaikandidatvaksindna AT fatimahfatimah komparasiinsilicosekuenspcdnacadengansekuenscapsidlentivirussebagaikandidatvaksindna AT hartatisri komparasiinsilicosekuenspcdnacadengansekuenscapsidlentivirussebagaikandidatvaksindna |